| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 缩略词表 | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-19页 |
| 1 ASGV的分子特性研究 | 第11页 |
| 2 热处理结合茎尖组织培养脱除ASGV在果树上的应用 | 第11-12页 |
| 3 小RNA的研究 | 第12-18页 |
| 3.1 小RNA的分类 | 第12页 |
| 3.2 miRNA的发现 | 第12-13页 |
| 3.3 miRNA的加工 | 第13-15页 |
| 3.4 miRNA调控靶标基因表达 | 第15-16页 |
| 3.5 miRNA调控寄主抗性基因表达 | 第16页 |
| 3.6 小干扰RNA的研究 | 第16-18页 |
| 4 研究目的和意义 | 第18-19页 |
| 第二章“金水二号”ASGV基因组扩增和序列分析 | 第19-31页 |
| 1 研究材料 | 第19页 |
| 1.1 材料来源 | 第19页 |
| 1.2 研究所用试剂 | 第19页 |
| 2 研究方法 | 第19-23页 |
| 2.1 总RNA提取方法 | 第19-20页 |
| 2.2 沙梨“金水二号”ASGV分离物(ASGV-J2)全基因组扩增策略 | 第20-22页 |
| 2.3 ASGV-J2 分离物基因组克隆测序 | 第22-23页 |
| 2.4 序列分析所用软件 | 第23页 |
| 3 结果和分析 | 第23-30页 |
| 3.1 三种方法提取ASGV-J2 分离物不同组织部位总RNA的效果比较 | 第23-24页 |
| 3.2 ASGV-J2 分离物RT-PCR产物电泳检测结果 | 第24-25页 |
| 3.3 ASGV-J2 分离物基因组序列分析 | 第25-30页 |
| 4 小结和讨论 | 第30-31页 |
| 第三章 热处理对带ASGV沙梨离体植株microRNAs的影响 | 第31-59页 |
| 1 研究材料 | 第31-34页 |
| 1.1 供试植株材料 | 第31页 |
| 1.2 研究所用试剂 | 第31-32页 |
| 1.3 引物 | 第32-34页 |
| 2 研究方法 | 第34-37页 |
| 2.1 小RNA文库的构建 | 第34页 |
| 2.2 小RNA测序与数据分析流程 | 第34-36页 |
| 2.3 梨样品总RNA的DNA消化 | 第36页 |
| 2.4 qRT-PCR扩增 | 第36-37页 |
| 2.5 q RT-PCR 数据分析 | 第37页 |
| 3 结果和分析 | 第37-56页 |
| 3.1 沙梨“金水二号”组培苗带ASGV含量检测 | 第37-38页 |
| 3.2 热处理 1d、5d对沙梨“金水二号”茎尖组织ASGV含量影响 | 第38-39页 |
| 3.3 热处理对沙梨“金水二号”茎尖和基部组织中ASGV含量影响 | 第39页 |
| 3.4 深度测序用总RNA质量检测 | 第39-41页 |
| 3.5 热处理对沙梨茎尖组织small RNA数量及大小影响分析 | 第41-43页 |
| 3.6 梨茎尖组织中已知miRNAs的鉴定及保守性分析 | 第43-45页 |
| 3.7 梨茎尖组织中新的miRNA的预测及分析 | 第45-47页 |
| 3.8 热处理对沙梨茎尖和基部组织miRNA表达量影响 | 第47-52页 |
| 3.9 差异表达的miRNA靶标基因预测及功能分析 | 第52-54页 |
| 3.10 差异表达的miRNA调控靶标基因空间动态表达分析 | 第54-56页 |
| 4 小结和讨论 | 第56-59页 |
| 第四章 热处理对沙梨植物来源于ASGV的vsiRANs的影响 | 第59-68页 |
| 1 研究材料 | 第59-60页 |
| 1.1 供试植物材料 | 第59页 |
| 1.2 研究所用试剂 | 第59页 |
| 1.3 引物 | 第59-60页 |
| 2 研究方法 | 第60页 |
| 3 结果和分析 | 第60-67页 |
| 3.1 沙梨寄主体内来源于ASGV的vsiRNA的数量和长度分布 | 第60-61页 |
| 3.2 沙梨寄主体内vsiRNA 5'末端核苷酸偏好性分析 | 第61-63页 |
| 3.3 沙梨寄主体内vsiRNA沉默热点区域种类特点 | 第63-67页 |
| 4 小结和讨论 | 第67-68页 |
| 第五章 全文结论和展望 | 第68-69页 |
| 参考文献 | 第69-77页 |
| 附录A常用溶液配方 | 第77-78页 |
| 附录B sRNA数据分析表格 | 第78-87页 |
| 附录C研究生期间发表论文 | 第87-88页 |
| 致谢 | 第88页 |
