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基于microRNA表达谱的伪狂犬病毒及其基因缺失株与PK-15细胞互作的研究

中文摘要第1-6页
ABSTRACT第6-8页
缩略语表第8-12页
第一章 文献综述第12-20页
 1 伪狂犬病及伪狂犬病毒概述第12-15页
   ·伪狂犬病的流行现状第12页
   ·伪狂犬病毒及其编码的糖蛋白第12-13页
   ·伪狂犬病毒的致病机理第13-14页
   ·伪狂犬病毒潜伏感染与免疫防治第14-15页
   ·伪狂犬病毒的应用第15页
 2 microRNA的研究概况第15-18页
   ·miRNA的产生及作用机制第15-16页
   ·MiRNA的研究方法第16-17页
   ·病毒miRNA及其功能第17-18页
   ·宿主miRNA与病毒感染第18页
 3 目的与意义第18-20页
第二章 基于microRNA表达谱的伪狂犬病毒及其基因缺失株与PK-15细胞互作的研究第20-47页
 1 实验的材料和方法第20-28页
   ·病毒与细胞第20页
   ·实验的主要仪器耗材及主要试剂第20页
   ·PK-15细胞的传代培养及病毒的增殖培养第20-21页
   ·病毒感染PK-15细胞第21页
   ·总RNA的提取第21页
   ·总RNA的高通量测序第21-22页
   ·测序结果的生物信息学分析第22-24页
     ·小RNA的生物信息分析第22页
     ·miRNA表达谱的构建第22-23页
     ·病毒感染后PK-15细胞差异miRNA表达谱的构建及靶基因预测第23页
     ·靶基因的GO与功能富集分析第23页
     ·miRNA-Gene-network的构建第23-24页
   ·荧光定量PCR分析第24-27页
     ·引物设计第24-25页
     ·RNA的提取第25页
     ·cDNA的合成第25-26页
     ·实时荧光定量PCR反应第26-27页
     ·qPCR反应数据处理第27页
   ·外源miRNA对病毒细胞内增殖的影响第27-28页
     ·外源miRNA的选择第27页
     ·miRNA mimics的转染第27-28页
     ·荧光定量PCR第28页
 2 结果与分析第28-42页
   ·总RNA的质量鉴定第28页
   ·测序结果概述第28-29页
   ·高通量测序所得miRNA的荧光定量PCR验证第29-30页
   ·病毒感染后与未感染的PK-15细胞的miRNA表达谱第30-31页
   ·病毒感染后PK-15细胞的miRNA表达谱变化第31-32页
     ·病毒感染后的PK-15细胞miRNA差异表达分析第31-32页
     ·比较2株病毒感染后的PK-15细胞表达变化的miRNA第32页
   ·病毒感染后PK-15细胞差异表达miRNA与其靶基因的调控网络第32-36页
   ·对比PRV-gEgI与PRV分别感染后的PK-15细胞表达的miRNA第36-39页
     ·重要显著差异miRNA的分析第36-37页
     ·显著差异miRNA的靶基因GO分析第37-39页
   ·病毒编码的miRNA第39-40页
   ·外源miRNA转染对病毒复制的影响第40-42页
 3 讨论第42-47页
   ·PRV与PRV-gEgI感染前后PK-15细胞表达的miRNA第42-44页
   ·对比PRV感染后与PRV-gEGI感染后PK-15细胞表达的miRNA第44-45页
   ·PK-15细胞中PRV与PRV-gEgI编码的miRNA第45-46页
   ·外源miRNA与病毒复制第46页
   ·小结第46-47页
参考文献第47-54页
致谢第54-55页
学术论文第55-56页
附录第56-80页
 附表1 成熟miRNA的序列第56-72页
 附表2 PRV感染PK-15细胞后差异表达的miRNA第72-75页
 附表3 PRV-gEgI感染PK-15细胞后差异表达的miRNA第75-79页
 附表4 PRV-gEgI感染相对于PRV感染的PK-15细胞差异表达的miRNA第79-80页

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