中文摘要 | 第1-6页 |
ABSTRACT | 第6-8页 |
缩略语表 | 第8-12页 |
第一章 文献综述 | 第12-20页 |
1 伪狂犬病及伪狂犬病毒概述 | 第12-15页 |
·伪狂犬病的流行现状 | 第12页 |
·伪狂犬病毒及其编码的糖蛋白 | 第12-13页 |
·伪狂犬病毒的致病机理 | 第13-14页 |
·伪狂犬病毒潜伏感染与免疫防治 | 第14-15页 |
·伪狂犬病毒的应用 | 第15页 |
2 microRNA的研究概况 | 第15-18页 |
·miRNA的产生及作用机制 | 第15-16页 |
·MiRNA的研究方法 | 第16-17页 |
·病毒miRNA及其功能 | 第17-18页 |
·宿主miRNA与病毒感染 | 第18页 |
3 目的与意义 | 第18-20页 |
第二章 基于microRNA表达谱的伪狂犬病毒及其基因缺失株与PK-15细胞互作的研究 | 第20-47页 |
1 实验的材料和方法 | 第20-28页 |
·病毒与细胞 | 第20页 |
·实验的主要仪器耗材及主要试剂 | 第20页 |
·PK-15细胞的传代培养及病毒的增殖培养 | 第20-21页 |
·病毒感染PK-15细胞 | 第21页 |
·总RNA的提取 | 第21页 |
·总RNA的高通量测序 | 第21-22页 |
·测序结果的生物信息学分析 | 第22-24页 |
·小RNA的生物信息分析 | 第22页 |
·miRNA表达谱的构建 | 第22-23页 |
·病毒感染后PK-15细胞差异miRNA表达谱的构建及靶基因预测 | 第23页 |
·靶基因的GO与功能富集分析 | 第23页 |
·miRNA-Gene-network的构建 | 第23-24页 |
·荧光定量PCR分析 | 第24-27页 |
·引物设计 | 第24-25页 |
·RNA的提取 | 第25页 |
·cDNA的合成 | 第25-26页 |
·实时荧光定量PCR反应 | 第26-27页 |
·qPCR反应数据处理 | 第27页 |
·外源miRNA对病毒细胞内增殖的影响 | 第27-28页 |
·外源miRNA的选择 | 第27页 |
·miRNA mimics的转染 | 第27-28页 |
·荧光定量PCR | 第28页 |
2 结果与分析 | 第28-42页 |
·总RNA的质量鉴定 | 第28页 |
·测序结果概述 | 第28-29页 |
·高通量测序所得miRNA的荧光定量PCR验证 | 第29-30页 |
·病毒感染后与未感染的PK-15细胞的miRNA表达谱 | 第30-31页 |
·病毒感染后PK-15细胞的miRNA表达谱变化 | 第31-32页 |
·病毒感染后的PK-15细胞miRNA差异表达分析 | 第31-32页 |
·比较2株病毒感染后的PK-15细胞表达变化的miRNA | 第32页 |
·病毒感染后PK-15细胞差异表达miRNA与其靶基因的调控网络 | 第32-36页 |
·对比PRV-gEgI与PRV分别感染后的PK-15细胞表达的miRNA | 第36-39页 |
·重要显著差异miRNA的分析 | 第36-37页 |
·显著差异miRNA的靶基因GO分析 | 第37-39页 |
·病毒编码的miRNA | 第39-40页 |
·外源miRNA转染对病毒复制的影响 | 第40-42页 |
3 讨论 | 第42-47页 |
·PRV与PRV-gEgI感染前后PK-15细胞表达的miRNA | 第42-44页 |
·对比PRV感染后与PRV-gEGI感染后PK-15细胞表达的miRNA | 第44-45页 |
·PK-15细胞中PRV与PRV-gEgI编码的miRNA | 第45-46页 |
·外源miRNA与病毒复制 | 第46页 |
·小结 | 第46-47页 |
参考文献 | 第47-54页 |
致谢 | 第54-55页 |
学术论文 | 第55-56页 |
附录 | 第56-80页 |
附表1 成熟miRNA的序列 | 第56-72页 |
附表2 PRV感染PK-15细胞后差异表达的miRNA | 第72-75页 |
附表3 PRV-gEgI感染PK-15细胞后差异表达的miRNA | 第75-79页 |
附表4 PRV-gEgI感染相对于PRV感染的PK-15细胞差异表达的miRNA | 第79-80页 |