| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-31页 |
| ·微生物代谢组学 | 第12-16页 |
| ·微生物代谢组学定义 | 第12-16页 |
| ·代谢组学研究的几个层次 | 第13-14页 |
| ·微生物的代谢物 | 第14-15页 |
| ·微生物代谢网络数据库 | 第15-16页 |
| ·微生物代谢物分析平台 | 第16-19页 |
| ·稳健性与稳定性 | 第18页 |
| ·敏感性 | 第18页 |
| ·定量 | 第18-19页 |
| ·微生物代谢组学的实验设计 | 第19-24页 |
| ·代表性的生物样品的获得 | 第19页 |
| ·微生物生长的重复性 | 第19-20页 |
| ·快速样品制备和淬灭 | 第20-21页 |
| ·代谢物的提取 | 第21页 |
| ·实验设计 | 第21-24页 |
| ·代谢组学解析流程 | 第21页 |
| ·代谢组学的生物分析策略 | 第21-22页 |
| ·设计策略 | 第22-24页 |
| ·代谢组学在微生物研究中的应用 | 第24-29页 |
| ·代谢途径研究及发酵过程中细胞生理生化状态测定方面的应用 | 第24-25页 |
| ·微生物细胞内的代谢流量 | 第24-25页 |
| ·代谢物组学在微生物代谢工程学中的应用 | 第25页 |
| ·菌株区分 | 第25-26页 |
| ·环境微生物研究 | 第26-27页 |
| ·代谢通量分析 | 第27-28页 |
| ·确定基因功能 | 第28-29页 |
| ·微生物代谢组学发展展望 | 第29-30页 |
| ·本论文研究的意义和内容 | 第30-31页 |
| 第二章 遗传和碳源差异对Escherichia coli代谢的影响 | 第31-48页 |
| 第一节 代谢物提取方法的选择 | 第31-36页 |
| ·前言 | 第31-32页 |
| ·实验材料 | 第32页 |
| ·仪器和试剂 | 第32页 |
| ·菌株和培养条件 | 第32页 |
| ·实验方法 | 第32-34页 |
| ·样品淬灭 | 第32页 |
| ·甲醇提取 | 第32-33页 |
| ·甲醇/氯仿提取 | 第33页 |
| ·热乙醇提取 | 第33页 |
| ·GC-MS分析方法 | 第33-34页 |
| ·结果和讨论 | 第34-35页 |
| ·提取方法的总离子流图(TIC) | 第34页 |
| ·主成分分析 | 第34-35页 |
| ·小结 | 第35-36页 |
| 第二节 遗传和碳源差异对Escherichia coli代谢的影响 | 第36-48页 |
| ·前言 | 第36页 |
| ·实验材料 | 第36-37页 |
| ·仪器和试剂 | 第36-37页 |
| ·试验菌株 | 第37页 |
| ·培养基及培养条件 | 第37页 |
| ·实验方法 | 第37-38页 |
| ·细胞干重的测定 | 第37页 |
| ·样品淬灭和提取 | 第37页 |
| ·衍生方法 | 第37页 |
| ·GC-MS分析方法 | 第37-38页 |
| ·GC-MS数据处理和多元数据分析 | 第38页 |
| ·标准溶液的配置 | 第38页 |
| ·代谢通量分析 | 第38页 |
| ·结果与讨论 | 第38-47页 |
| ·大肠杆菌生长曲线及葡萄糖残余浓度曲线 | 第38-39页 |
| ·方法验证 | 第39-41页 |
| ·大肠杆菌胞内代谢物GC-MS指纹图谱 | 第41-42页 |
| ·基因和环境对大肠杆菌代谢的影响 | 第42-47页 |
| ·两种碳源下菌株代谢通量比较 | 第42-43页 |
| ·表型区分 | 第43-45页 |
| ·HCA分析 | 第45-47页 |
| ·小结 | 第47-48页 |
| 第三章 GC-MS在研究环境对Exiguobacterium aurantiacum Lp3-3代谢影响中的应用 | 第48-57页 |
| ·前言 | 第48-49页 |
| ·实验材料 | 第49-50页 |
| ·菌株 | 第49页 |
| ·仪器和试剂 | 第49页 |
| ·培养基 | 第49-50页 |
| ·实验方法 | 第50-51页 |
| ·培养条件 | 第50页 |
| ·细胞干重测定 | 第50页 |
| ·样品淬灭和提取 | 第50页 |
| ·衍生 | 第50-51页 |
| ·GC-MS分析方法 | 第51页 |
| ·数据处理 | 第51页 |
| ·结果和讨论 | 第51-56页 |
| ·方法验证 | 第51-53页 |
| ·环境对Lp3-3代谢的影响 | 第53-56页 |
| ·LP-3在不同培养条件下典型TIC图 | 第53页 |
| ·多元数据分析 | 第53-55页 |
| ·VIP代谢物分析 | 第55-56页 |
| ·小结 | 第56-57页 |
| 第四章 GC×GC/MS在分析微生物代谢物中的应用 | 第57-66页 |
| ·前言 | 第57-59页 |
| ·实验材料 | 第59-60页 |
| ·仪器和试剂 | 第59页 |
| ·菌株和培养条件 | 第59-60页 |
| ·实验方法 | 第60页 |
| ·样品制备 | 第60页 |
| ·GC×GC TOF MS分析方法 | 第60页 |
| ·结果与讨论 | 第60-65页 |
| ·三株菌的TIC等高线图 | 第60-62页 |
| ·数据处理 | 第62-64页 |
| ·代谢物的鉴定 | 第64-65页 |
| ·小结 | 第65-66页 |
| 结论 | 第66-67页 |
| 参考文献 | 第67-78页 |
| 攻读硕士学位期间发表和撰写的论文 | 第78-79页 |
| 致谢 | 第79页 |
