| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-11页 |
| 第一部分 前言 | 第11-23页 |
| 1 斑腿蝗科研究现状 | 第11-15页 |
| ·斑腿蝗科概况 | 第11页 |
| ·斑腿蝗科形态特征 | 第11-12页 |
| ·斑腿蝗科的起源及分类系统 | 第12页 |
| ·我国斑腿蝗科的研究现状 | 第12-15页 |
| ·斑腿蝗科的化石资料 | 第15页 |
| 2 昆虫线粒体基因组与COⅠ、COⅡ基因 | 第15-18页 |
| ·昆虫线粒体基因组 | 第15-16页 |
| ·线粒体COⅠ、COⅡ基因 | 第16-18页 |
| 3 昆虫分子系统学 | 第18-21页 |
| ·分子系统学定义 | 第18页 |
| ·昆虫分子系统学研究方法 | 第18-19页 |
| ·系统树构建方法 | 第19-21页 |
| ·系统树构建方法的评价 | 第21页 |
| 4 本研究的目的和意义 | 第21-23页 |
| 第二部分 实验材料与方法 | 第23-31页 |
| 1 实验材料 | 第23-25页 |
| ·实验所用标本的采集、保存和鉴定 | 第23页 |
| ·实验仪器、试剂 | 第23-25页 |
| 2 实验方法 | 第25-27页 |
| ·DNA的提取和检测 | 第25-26页 |
| ·PCR扩增和检测 | 第26-27页 |
| ·扩增结果的纯化 | 第27页 |
| ·测序 | 第27页 |
| 3 序列编辑 | 第27-31页 |
| ·序列校正 | 第27页 |
| ·序列比对 | 第27页 |
| ·序列组成分析 | 第27-28页 |
| ·数据组系统发育信号检验 | 第28页 |
| ·构建系统树 | 第28-31页 |
| 第三部分 结果与分析 | 第31-67页 |
| 1 基因组总DNA的提取、PCR扩增及测序 | 第31页 |
| ·基因组总DNA提取 | 第31页 |
| ·PCR扩增结果 | 第31页 |
| ·测序 | 第31页 |
| 2 COⅠ序列编辑和分析 | 第31-40页 |
| ·COⅠ序列组成分析 | 第32页 |
| ·COⅠ碱基替换颠换分析 | 第32-33页 |
| ·COⅠ密码子的使用和氨基酸的组成 | 第33页 |
| ·COⅠ未矫正的遗传距离和碱基替换、颠换、R值分析 | 第33页 |
| ·COⅠ碱基替换饱和性分析 | 第33-36页 |
| ·COⅠ P距离与R的关系 | 第36-37页 |
| ·COⅠ数据组碱基组成偏向性的x2(Chi-square)检验 | 第37页 |
| ·COⅠ随机树长分布分析(g1 test)与PTP检验 | 第37-40页 |
| 3 COⅡ基因序列编辑和分析 | 第40-49页 |
| ·COⅡ序列组成分析 | 第40页 |
| ·COⅡ碱基替换颠换分析 | 第40页 |
| ·COⅡ密码子的使用和氨基酸的组成 | 第40-41页 |
| ·COⅡ未矫正的遗传距离和碱基替换、颠换、R值 | 第41页 |
| ·COⅡ碱基替换饱和性分析 | 第41页 |
| ·COⅡ P距离与R的关系 | 第41-48页 |
| ·COⅠ数据组碱基组成偏向性的x2(Chi-square)检验 | 第48页 |
| ·COⅡ随机树长分布(g1 test)与PTP检验 | 第48-49页 |
| 4 COⅠ & COⅡ联合数据分析 | 第49-55页 |
| ·COⅠ & COⅡ序列组成分析 | 第50页 |
| ·COⅠ&COⅡ碱基替换颠换分析 | 第50页 |
| ·p距离,TS,Tv,R值分析 | 第50-51页 |
| ·斑腿蝗科10种昆虫COⅠ&COⅡ基因碱基替换饱和性分析 | 第51-53页 |
| ·斑腿蝗科11种昆虫COⅠ基因P距离和R的关系分析 | 第53-54页 |
| ·斑腿蝗科三个亚科的COⅠ&COⅡ个数据组碱基组成偏向性的x2(Chi-square)检验 | 第54页 |
| ·三个亚科COⅠ&COⅡ随机树长分布分析及PTP检验 | 第54-55页 |
| 5 斑腿蝗科的系统发育分析 | 第55-67页 |
| ·贝叶斯法建树(BI) | 第55-57页 |
| ·距离法建树(NJ) | 第57-58页 |
| ·简约法建树(MP) | 第58-61页 |
| ·对三个数据集进行MP法建树的结果统计 | 第60-61页 |
| ·极似然法建树(ML) | 第61-64页 |
| ·对三个数据组的四种建树方法评价 | 第64-65页 |
| ·三个数据组的四种建树法50%合一树 | 第65-67页 |
| 第四部分 讨论 | 第67-73页 |
| 1 目标序列的获得 | 第67页 |
| 2 COⅠ、COⅡ基因的分子进化特征 | 第67-69页 |
| ·基因序列组成特征 | 第67-68页 |
| ·不同密码子碱基组成特征 | 第68-69页 |
| ·氨基酸组成和密码子使用频率特征 | 第69页 |
| 3 碱基组成偏向性检验 | 第69页 |
| 4 数据组系统发育信号评估分析 | 第69-70页 |
| 5 系统树构建结果分析 | 第70-72页 |
| ·简约法建树分析 | 第70页 |
| ·距离法建树分析 | 第70-71页 |
| ·极似然法建树分析 | 第71页 |
| ·贝叶斯推论法建树分析 | 第71页 |
| ·不同方法构建的系统树的比较 | 第71-72页 |
| 6 斑腿蝗科部分种类系统发育关系的讨论 | 第72页 |
| 7 COⅠ、COⅡ基因在斑腿蝗科昆虫系统发育关系研究中的有效性 | 第72-73页 |
| 第五部分 NCBⅠ数据和本实验COⅡ序列联合分析 | 第73-77页 |
| 1 贝叶斯法建树(BI) | 第75-76页 |
| 2 极似然法建树(ML) | 第76-77页 |
| 第六部分 结论 | 第77-79页 |
| 参考文献 | 第79-86页 |
| 致谢 | 第86-87页 |
| 研究生期间发表论文 | 第87页 |
