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基于家蚕(Bombyx mori)基因组精细图的第27、28连锁群研究

摘要第1-12页
ABSTRACT第12-15页
第一章 文献综述第15-29页
   ·家蚕遗传图谱研究概述第15-16页
   ·家蚕经典连锁遗传图谱研究进展第16-18页
   ·家蚕分子标记遗传图谱的研究进展第18-21页
     ·RFLP分子标记连锁图谱第19页
     ·RAPD分子标记连锁图谱第19页
     ·AFLP分子标记连锁图谱第19-20页
     ·SSR分子标记连锁图谱第20页
     ·SNP分子标记连锁图谱第20-21页
   ·家蚕的基因组图谱第21-29页
     ·基因功能注释的研究进展第22-23页
     ·家蚕基因表达研究进展第23-29页
第二章 引言第29-33页
   ·研究家蚕第27、28号染色体的重要意义第29页
   ·主要研究内容第29-30页
   ·研究思路与技术路线第30-33页
第三章 家蚕第27、28染色体遗传图谱整合第33-47页
   ·材料和方法第33-34页
     ·数据来源第33页
     ·分子标记收集第33页
     ·序列比对第33-34页
   ·结果与分析第34-45页
     ·利用SNP标记对家蚕第27号染色体进行图谱整合第34-38页
     ·利用SNP标记对家蚕第28号染色体进行图谱整合第38-41页
     ·利用SSR标记对家蚕第27、28号染色体进行图谱整合第41-45页
   ·讨论第45-47页
第四章 家蚕第27、28号染色体的GAPS填补第47-57页
   ·材料与方法第47-50页
     ·数据和材料来源第47页
     ·信息分析第47-48页
     ·主要试剂及耗材第48页
     ·主要溶液及配制第48页
     ·主要仪器设备第48-49页
     ·PCR引物、反应体系和程序的设计第49-50页
   ·结果与分析第50-54页
     ·未匹配BAC末端序列的获得第50-51页
     ·未匹配BAC的比对和Gaps填补结果第51-54页
     ·对Gaps填补的PCR验证第54页
   ·讨论第54-57页
第五章 家蚕第27、28号染色体基因的功能注释第57-73页
   ·材料和方法第57-58页
     ·序列集合及分析方法第57页
     ·序列比对第57页
     ·基因相关数据的统计第57-58页
     ·蛋白质结构域预测第58页
     ·基因芯片表达谱第58页
   ·结果与分析第58-68页
     ·基因的数目第58页
     ·基因的长度第58-59页
     ·外显子和内含子第59-61页
     ·GC含量第61页
     ·蛋白编码基因的功能注释第61-65页
     ·基因表达第65-68页
   ·讨论第68-73页
     ·基因数目的预测第68页
     ·内含子第68页
     ·GC含量第68-69页
     ·蛋白编码基因的功能注释第69-70页
     ·基因表达第70-73页
第六章 家蚕糖转运蛋白基因的鉴定分析第73-87页
   ·材料和方法第73-74页
     ·基因数据集第73页
     ·糖转运蛋白基因的鉴定第73页
     ·糖转运蛋白基因家族的分析第73-74页
     ·27号染色体上糖转运蛋白基因序列和表达分析第74页
   ·结果与分析第74-83页
     ·家蚕糖转运蛋白基因家族的鉴定及分析第74-80页
     ·27号染色体上糖转运蛋白的结构分析第80-82页
     ·27号染色体上糖转运蛋白基因的表达谱分析第82-83页
   ·讨论第83-87页
     ·家蚕糖转运蛋白基因家族的鉴定及分析第83-84页
     ·糖转运蛋白的结构和功能第84-86页
     ·27号染色体上糖转运蛋白基因的表达第86-87页
第七章 家蚕第27、28号染色体突变基因的可能表型第87-105页
   ·材料和方法第87-88页
     ·数据库和基因组序列第87页
     ·同源性检索第87页
     ·突变基因的可能表型第87-88页
   ·结果与分析第88-102页
     ·第27号染色体基因同源检索的结果第88-96页
     ·第28号染色体基因同源检索的结果第96-102页
   ·讨论第102-105页
第八章 综合和结论第105-109页
论文的创新第109-111页
主要参考文献第111-119页
附录第119-131页
博士在读期间发表文章和参研课题情况第131-133页
致谢第133页

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