| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-8页 |
| 前言 | 第8-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-23页 |
| ·链霉菌基因组 | 第9-11页 |
| ·概述 | 第9页 |
| ·链霉菌简介 | 第9-10页 |
| ·天蓝色链霉菌 | 第10页 |
| ·阿维链霉菌 | 第10-11页 |
| ·灰色链霉菌 | 第11页 |
| ·比较基因组学 | 第11-15页 |
| ·概述 | 第11-13页 |
| ·比较基因组学研究内容及应用 | 第13-14页 |
| ·常用的基因组比对软件 | 第14-15页 |
| ·多烯大环内酯类抗生素合成后修饰酶 | 第15-19页 |
| ·多烯大环内酯类抗生素 | 第15-16页 |
| ·糖基侧链 | 第16-17页 |
| ·GDP甘露糖脱水酶 | 第17页 |
| ·氨基转移酶 | 第17-19页 |
| ·系统发育分析方法 | 第19-22页 |
| ·系统发育树构建方法 | 第19-20页 |
| ·系统发育树的评估检验 | 第20页 |
| ·常用的系统发育分析软件 | 第20-22页 |
| ·本课题研究意义 | 第22-23页 |
| 第二章 天蓝色、阿维和灰色链霉菌的全基因组比对 | 第23-40页 |
| ·概述 | 第23页 |
| ·材料及方法 | 第23-25页 |
| ·DNA序列的获得 | 第23-24页 |
| ·DNA序列的全基因组比对 | 第24页 |
| ·基因重复分析 | 第24-25页 |
| ·基因倒位分析 | 第25页 |
| ·结果与讨论 | 第25-38页 |
| ·基因组表现出高度的同线性 | 第25-26页 |
| ·链霉菌基因组中存在许多DNA倒位现象 | 第26-32页 |
| ·基因重复分析 | 第32-37页 |
| ·阿维的核心区域中重复比例低 | 第37-38页 |
| ·小结 | 第38-40页 |
| 第三章 多烯大环内酯类抗生素合成后修饰酶系统发育分析 | 第40-59页 |
| ·概述 | 第40-42页 |
| ·实验材料及方法 | 第42-43页 |
| ·氨基酸序列的获得 | 第42-43页 |
| ·系统发育分析方法 | 第43页 |
| ·结果与讨论 | 第43-57页 |
| ·GDP-D-甘露糖脱水酶可能来自其它菌属的HGT | 第43-50页 |
| ·氨基转移酶进化来源 | 第50-53页 |
| ·其它修饰酶进化分析 | 第53-57页 |
| ·小结 | 第57-59页 |
| 第四章 结论与展望 | 第59-61页 |
| ·结论 | 第59-60页 |
| ·前景与展望 | 第60-61页 |
| 参考文献 | 第61-68页 |
| 致谢 | 第68页 |