| 摘要 | 第3-4页 |
| abstract | 第4页 |
| 第1章 绪论 | 第7-13页 |
| 1.1 研究背景与意义 | 第7-9页 |
| 1.2 目前研究存在的问题 | 第9-10页 |
| 1.3 本文研究内容 | 第10-11页 |
| 1.4 本文贡献 | 第11-12页 |
| 1.5 本文组织结构 | 第12-13页 |
| 第2章 相关研究 | 第13-25页 |
| 2.1 语义Web与Linked Data研究现状 | 第13-15页 |
| 2.1.1 语义Web | 第13-14页 |
| 2.1.2 Linked Data | 第14-15页 |
| 2.1.3 SPARQL查询 | 第15页 |
| 2.2 关于RDF生物信息图数据的研究 | 第15-19页 |
| 2.3 生物途径可视化研究现状 | 第19-21页 |
| 2.3.1 可视化技术 | 第19-20页 |
| 2.3.2 生物途径可视化 | 第20-21页 |
| 2.4 生物途径数据集成研究现状 | 第21-24页 |
| 2.4.1 数据集成 | 第21-22页 |
| 2.4.2 生物途径数据集成 | 第22-24页 |
| 2.5 本章小结 | 第24-25页 |
| 第3章 基于分类的生物途径可视化模型构建 | 第25-34页 |
| 3.1 代谢网络可视化模型 | 第25-27页 |
| 3.2 基因表达网络可视化模型 | 第27-29页 |
| 3.3 基因调控网络可视化模型 | 第29-31页 |
| 3.4 细胞信号转导通路可视化模型 | 第31-33页 |
| 3.5 本章小结 | 第33-34页 |
| 第4章 生物途径可视化展示方案 | 第34-43页 |
| 4.1 基于力导向图布局的生物途径可视化展示方案 | 第34-38页 |
| 4.2 基于Sankey图布局的生物途径可视化展示方案 | 第38-40页 |
| 4.3 生物途径可视化系统界面设计 | 第40-42页 |
| 4.4 本章小结 | 第42-43页 |
| 第5章 基于本体映射的多源生物途径数据动态集成 | 第43-51页 |
| 5.1 本体映射 | 第43-47页 |
| 5.1.1 本体映射技术 | 第43-45页 |
| 5.1.2 本体间映射关联方式 | 第45-47页 |
| 5.2 生物途径数据标识符的动态映射 | 第47-49页 |
| 5.3 Linked Data API与SPARQL相结合的数据访问方式 | 第49-50页 |
| 5.4 本章小结 | 第50-51页 |
| 第6章 BioPW生物途径可视化系统的设计与实现 | 第51-64页 |
| 6.1 系统架构设计 | 第51-53页 |
| 6.2 关键技术 | 第53-54页 |
| 6.3 系统设计 | 第54-60页 |
| 6.3.1 用例模型设计 | 第54-57页 |
| 6.3.2 类图设计 | 第57-58页 |
| 6.3.3 活动图设计 | 第58-60页 |
| 6.4 系统演示 | 第60-63页 |
| 6.5 本章小结 | 第63-64页 |
| 第7章 总结与展望 | 第64-66页 |
| 7.1 总结 | 第64-65页 |
| 7.2 展望 | 第65-66页 |
| 参考文献 | 第66-69页 |
| 发表论文和参加科研情况说明 | 第69-70页 |
| 致谢 | 第70页 |
