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斑马鱼SIX基因亚簇的重叠转录本Six2a-OT和Six6b-OT的功能探究

摘要第2-4页
abstract第4-5页
缩略词第6-9页
第一部分 引言第9-18页
    1.1 非编码RNA第9-13页
        1.1.1 LncRNASix2a-OT第11页
        1.1.2 LncRNASix6b-OT第11-13页
    1.2 SIX基因家族及SIX基因亚簇第13-16页
    1.3 LncRNA与SIX基因亚簇在染色体上的位置关系第16-18页
第二部分 实验方法探究LncRNA生物学功能第18-43页
    2.1 引言第18页
    2.2 斑马鱼品系和饲养方法第18-19页
    2.3 总RNA的提取和cDNA的制备第19页
    2.4 LncRNA基因的外显子测序第19-22页
    2.5 qPCR实验方法及数据分析第22-29页
        2.5.1 引物设计第22-23页
        2.5.2 qPCR实验操作步骤(SYBRGreen染料法)第23-24页
        2.5.3 Six2a-OT、Six6b-OT在斑马鱼性腺和胚胎早期的表达差异第24-25页
        2.5.4 Six2a-OT、Six6b-OT在斑马鱼卵巢支持细胞和生殖细胞的表达差异第25-26页
        2.5.5 Six2a-OT和Six2a-OTuns在AB斑马鱼胚胎早期的表达差异第26-27页
        2.5.6 SIX基因亚簇各成员在斑马鱼性腺及胚胎发育早期的表达差异第27-29页
    2.6 整胚原位杂交实验方法及结果分析第29-36页
        2.6.1 固定胚胎第29-30页
        2.6.2 反义RNA探针的制备第30-31页
        2.6.3 整胚原位杂交实验操作步骤第31-34页
        2.6.4 显微观察及拍照:第34页
        2.6.5 Six2a-OT和Six6b-OT的时空表达模式第34-36页
    2.7 显微注射Morpholino敲低Six2a-OT的表达第36-42页
        2.7.1 Morpholino设计第36-37页
        2.7.2 显微注射Morpholino实验操作步骤第37-38页
        2.7.3 观察注射Six2a-OTMo组与StandardMo组的胚胎发育情况第38-39页
        2.7.4 检验Morpholino效果第39-41页
        2.7.5 检测Six2a-OTMo组中six2a-six3a基因亚簇的表达量变化第41-42页
    2.8 本章小结第42-43页
第三部分 生物信息学方法预测和分析LncRNA第43-54页
    3.1 引言第43页
    3.2 Six2a-OT的生物信息方法预测和分析第43-49页
        3.2.1 Six2a-OT的二级结构预测第43-45页
        3.2.2 Six2a-OTRRI预测第45-47页
        3.2.3 Six2a-OTRPI预测第47-49页
    3.3 Six6b-OT的生物信息方法预测和分析第49-53页
        3.3.1 Six6b-OT的二级结构预测第49-50页
        3.3.2 Six6b-OTRRI预测第50-52页
        3.3.3 Six6b-OTRPI预测第52-53页
    3.4 本章小结第53-54页
第四部分 结论第54-56页
参考文献第56-62页
致谢第62页

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