摘要 | 第2-4页 |
abstract | 第4-5页 |
缩略词 | 第6-9页 |
第一部分 引言 | 第9-18页 |
1.1 非编码RNA | 第9-13页 |
1.1.1 LncRNASix2a-OT | 第11页 |
1.1.2 LncRNASix6b-OT | 第11-13页 |
1.2 SIX基因家族及SIX基因亚簇 | 第13-16页 |
1.3 LncRNA与SIX基因亚簇在染色体上的位置关系 | 第16-18页 |
第二部分 实验方法探究LncRNA生物学功能 | 第18-43页 |
2.1 引言 | 第18页 |
2.2 斑马鱼品系和饲养方法 | 第18-19页 |
2.3 总RNA的提取和cDNA的制备 | 第19页 |
2.4 LncRNA基因的外显子测序 | 第19-22页 |
2.5 qPCR实验方法及数据分析 | 第22-29页 |
2.5.1 引物设计 | 第22-23页 |
2.5.2 qPCR实验操作步骤(SYBRGreen染料法) | 第23-24页 |
2.5.3 Six2a-OT、Six6b-OT在斑马鱼性腺和胚胎早期的表达差异 | 第24-25页 |
2.5.4 Six2a-OT、Six6b-OT在斑马鱼卵巢支持细胞和生殖细胞的表达差异 | 第25-26页 |
2.5.5 Six2a-OT和Six2a-OTuns在AB斑马鱼胚胎早期的表达差异 | 第26-27页 |
2.5.6 SIX基因亚簇各成员在斑马鱼性腺及胚胎发育早期的表达差异 | 第27-29页 |
2.6 整胚原位杂交实验方法及结果分析 | 第29-36页 |
2.6.1 固定胚胎 | 第29-30页 |
2.6.2 反义RNA探针的制备 | 第30-31页 |
2.6.3 整胚原位杂交实验操作步骤 | 第31-34页 |
2.6.4 显微观察及拍照: | 第34页 |
2.6.5 Six2a-OT和Six6b-OT的时空表达模式 | 第34-36页 |
2.7 显微注射Morpholino敲低Six2a-OT的表达 | 第36-42页 |
2.7.1 Morpholino设计 | 第36-37页 |
2.7.2 显微注射Morpholino实验操作步骤 | 第37-38页 |
2.7.3 观察注射Six2a-OTMo组与StandardMo组的胚胎发育情况 | 第38-39页 |
2.7.4 检验Morpholino效果 | 第39-41页 |
2.7.5 检测Six2a-OTMo组中six2a-six3a基因亚簇的表达量变化 | 第41-42页 |
2.8 本章小结 | 第42-43页 |
第三部分 生物信息学方法预测和分析LncRNA | 第43-54页 |
3.1 引言 | 第43页 |
3.2 Six2a-OT的生物信息方法预测和分析 | 第43-49页 |
3.2.1 Six2a-OT的二级结构预测 | 第43-45页 |
3.2.2 Six2a-OTRRI预测 | 第45-47页 |
3.2.3 Six2a-OTRPI预测 | 第47-49页 |
3.3 Six6b-OT的生物信息方法预测和分析 | 第49-53页 |
3.3.1 Six6b-OT的二级结构预测 | 第49-50页 |
3.3.2 Six6b-OTRRI预测 | 第50-52页 |
3.3.3 Six6b-OTRPI预测 | 第52-53页 |
3.4 本章小结 | 第53-54页 |
第四部分 结论 | 第54-56页 |
参考文献 | 第56-62页 |
致谢 | 第62页 |