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甘蓝型油菜含油量主效QTL qOilA5的精细定位和候选基因鉴定

摘要第7-9页
ABSTRACT第9-10页
缩略词表第11-12页
1 前言第12-23页
    1.1 甘蓝型油菜含油量育种现状第13-14页
    1.2 植物的油脂代谢第14-17页
        1.2.1 TAG代谢途径第14-16页
        1.2.2 油体的细胞学基础第16-17页
    1.3 环境因素对含油量的影响第17-18页
    1.4 含油量遗传控制机理研究进展第18-19页
    1.5 含油量性状QTL定位的研究进展第19-21页
    1.6 含油量组学研究进展第21-22页
    1.7 本研究的目的与意义第22-23页
2 材料与方法第23-36页
    2.1 研究材料第23-24页
        2.1.1 双单倍体群体ZD-DH第23页
        2.1.2 精细定位群体第23页
        2.1.3 BC_1F_2:3后代测验群体第23页
        2.1.4 转基因材料第23-24页
    2.2 材料的种植与性状考察第24-25页
        2.2.1 材料的种植第24页
        2.2.2 性状考察第24-25页
    2.3 技术路线第25-26页
        2.3.1 精细定位技术路线第25页
        2.3.2 HB2基因转基因验证技术路线第25-26页
    2.4 基因型鉴定第26-30页
        2.4.1 DNA提取第26-27页
        2.4.2 DNA浓度检测第27页
        2.4.3 PCR反应第27-28页
        2.4.4 聚丙烯酰胺凝胶电泳第28-29页
        2.4.5 基因型记录和电子版保存第29-30页
    2.5 定位群体的构建第30页
        2.5.1 近等基因系的进一步创建第30页
        2.5.2 精细定位群体的构建第30页
    2.6 遗传图谱的构建和QTL的定位第30-31页
        2.6.1 局部遗传连锁图的构建第30页
        2.6.2 QTL的定位和效应分析第30-31页
        2.6.3 基于亲本重测序的InDel标记的开发第31页
    2.7 甘蓝型油菜下胚轴遗传转化第31-32页
    2.8 转基因阳性鉴定第32-34页
    2.9 RNA提取及CDNA第一链的合成第34-35页
        2.9.1 油菜叶片RNA提取第34页
        2.9.2 油菜种子RNA提取第34-35页
        2.9.3 cDNA第一链的合成以及BnActin2检测第35页
    2.10 数据整理与分析第35-36页
3 结果分析第36-59页
    3.1 利用ZD-DH群体进行含油量初定位第36-43页
        3.1.1 ZD-DH群体含油量表型变异第36-38页
        3.1.2 ZD-DH群体遗传连锁图谱的构建第38-40页
        3.1.3 含油量QTL定位第40-41页
        3.1.4 ZD-DH群体qOilA5位点标记加密第41-42页
        3.1.5 ZD-DH群体qOilA5位点QTL分析第42-43页
    3.2 精细定位群体亲本全基因组重测序及标记开发第43-47页
        3.2.1 测序亲本材料的选择第43-44页
        3.2.2 全基因组重测序第44页
        3.2.3 亲本间差异分析及标记开发第44-47页
    3.3 精细定位第47-51页
        3.3.1 近等基因系的构建第47-48页
        3.3.2 qOilA5位点BC_1F_2群体重组单株的表型变异第48-49页
        3.3.3 qOilA5位点BC_1F_2群体的基因型分析第49-50页
        3.3.4 qOilA5位点BC_1F_2群体局部遗传连锁图谱第50页
        3.3.5 qOilA5位点BC_1F_2群体QTL定位结果第50-51页
    3.4 qOilA5目标区段内候选基因的分析第51-54页
        3.4.1 共线性分析第51-52页
        3.4.2 qOilA5目标区段内候选基因的分析第52-54页
    3.5 HB2基因转基因验证第54-59页
        3.5.1 载体的构建第54页
        3.5.2 转基因植株阳性鉴定第54-55页
        3.5.3 p35S:Hb表达载体转基因后代分析第55-57页
        3.5.4 pNapin:Hb种子特异表达载体转基因后代分析第57-59页
4 讨论第59-63页
    4.1 qOilA5位点可以明显提高油菜含油量第59-61页
        4.1.1 qOilA5位点精细定位群体的构建第59页
        4.1.2 含油量表型考察需要注意的问题第59-60页
        4.1.3 利用全基因组重测序技术加快精细定位进程和候选基因筛选第60-61页
    4.2 HB2基因可能不是qOilA5位点对应的基因第61-62页
    4.3 下一步工作设想第62-63页
参考文献第63-70页
附录1 油菜含油量QTL定位的研究进展第70-71页
附录2 实验所需试剂的配制第71-73页
致谢第73页

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