| 摘要 | 第3-5页 |
| ABSTRACT | 第5-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-21页 |
| §1.1 结构生物学主要研究方法 | 第10-11页 |
| §1.2 冷冻电镜单颗粒重构技术的发展 | 第11-13页 |
| §1.3 冷冻电镜单颗粒技术重构步骤 | 第13-19页 |
| §1.3.1 衬度传递函数校正 | 第14-16页 |
| §1.3.2 颗粒挑选 | 第16-17页 |
| §1.3.3 二维聚类与分类 | 第17-18页 |
| §1.3.4 初始模型构建 | 第18页 |
| §1.3.5 参数精修 | 第18-19页 |
| §1.4 本文的主要研究内容及论文安排 | 第19-21页 |
| 第二章 单颗粒三维重构过程及相关算法 | 第21-42页 |
| §2.1 模板匹配函数 | 第22-25页 |
| §2.2 在面参数确定 | 第25-31页 |
| §2.2.1 基于模板的分类平均 | 第25-28页 |
| §2.2.2 无模板分类平均 | 第28-31页 |
| §2.3 空间参数搜索 | 第31-33页 |
| §2.4 三维结构重构 | 第33-37页 |
| §2.4.1 直接傅里叶变换 | 第33-34页 |
| §2.4.2 傅立叶-柱贝塞尔变换 | 第34-35页 |
| §2.4.3 傅立叶-球贝塞尔变换 | 第35-37页 |
| §2.5 从无到有的初始模型构建方法 | 第37-41页 |
| §2.5.1 随机圆锥倾斜法 | 第37-38页 |
| §2.5.2 等价线计算方法 | 第38-39页 |
| §2.5.3 概率性初始三维模型方法 | 第39-40页 |
| §2.5.4 快速无监督初始模型构建方法 | 第40-41页 |
| §2.6 本章小结 | 第41-42页 |
| 第三章 基于傅里叶-梅林变换的快速可信初始三维模型构建新算法 | 第42-69页 |
| §3.1 傅里叶-梅林变换 | 第42-43页 |
| §3.2 相位匹配函数 | 第43-45页 |
| §3.3 基于傅里叶-梅林变换的快速二维分类 | 第45-50页 |
| §3.3.1 在面参数确定 | 第45-47页 |
| §3.3.2 相关实验 | 第47-50页 |
| §3.4 基于高斯回归的亚像素级精度匹配方法 | 第50-53页 |
| §3.5 基于粒子群搜索算法的三维精修方法 | 第53-61页 |
| §3.5.1 问题描述 | 第54-55页 |
| §3.5.2 粒子群优化算法 | 第55-59页 |
| §3.5.3 基于粒子群优化算法的三维精修方法 | 第59-61页 |
| §3.6 从随机模型到高分辨的单颗粒三维重构新软件 | 第61-66页 |
| §3.6.1 程序界面及相关参数 | 第62-65页 |
| §3.6.2 多CPU并行化处理及调度 | 第65-66页 |
| §3.7 本章小结 | 第66-69页 |
| 第四章 相关实验与结果 | 第69-92页 |
| §4.1 程序正确性验证 | 第69-70页 |
| §4.2 快速可信初始三维模构建测试 | 第70-78页 |
| §4.2.1 二十面体对称性质型多角体病毒 | 第70-72页 |
| §4.2.2 大肠杆菌半乳糖苷酶 | 第72-73页 |
| §4.2.3 嗜酸热原体20S蛋白酶体 | 第73-76页 |
| §4.2.4 恶性疟原虫80S核糖体 | 第76-78页 |
| §4.3 近原子分辨三维结构重构 | 第78-82页 |
| §4.3.1 雀麦草花叶病毒 | 第78-80页 |
| §4.3.2 转录态质型多角体病毒 | 第80-82页 |
| §4.4 质型多角体病毒甲基转移酶活性位点确定 | 第82-91页 |
| §4.5 本章小结 | 第91-92页 |
| 第五章 总结与展望 | 第92-94页 |
| §5.1 工作总结 | 第92-93页 |
| §5.2 工作展望 | 第93-94页 |
| 参考文献 | 第94-103页 |
| 附录 | 第103-106页 |
| 致谢 | 第106-108页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文与其他成果 | 第108-110页 |