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系统代谢工程改造谷氨酸棒状杆菌生产L-缬氨酸

摘要第3-5页
Abstract第5-7页
第一章 绪论第12-24页
    1.1 L-缬氨酸理化性质、应用和生产菌株第12-15页
        1.1.1 L-缬氨酸的性质第12页
        1.1.2 L-缬氨酸的用途及市场第12页
        1.1.3 L-缬氨酸的生产方法第12-13页
        1.1.4 L-缬氨酸生产菌株国内外研究概况第13-15页
    1.2 L-缬氨酸的生物合成及代谢调控第15-19页
        1.2.1 谷氨酸棒状杆菌L-缬氨酸合成代谢途径第15-16页
        1.2.2 L-缬氨酸的生物合成途径中关键前体积累第16-17页
        1.2.3 通过过表达关键基因来加强L-缬氨酸的生物合成途径第17-18页
        1.2.4 转录和反馈抑制调控第18-19页
    1.3 基于染色体突变优化及辅助因子平衡提高L-缬氨酸产量第19-20页
        1.3.1 染色体突变优化第19-20页
        1.3.2 辅因子平衡第20页
    1.4 L-缬氨酸的外排运输调节第20-21页
    1.5 转录组学和蛋白组学在氨基酸生产菌株育种中的应用第21-22页
    1.6 本论文的主要研究内容第22-24页
        1.6.1 立题依据和研究意义第22页
        1.6.2 研究内容第22-24页
第二章 转录组学解析C.glutamicum VWB-1高产L-缬氨酸机制第24-48页
    2.1 引言第24页
    2.2 材料和方法第24-29页
        2.2.1 菌株第24页
        2.2.2 试剂和仪器第24-26页
        2.2.3 培养基和培养条件第26页
        2.2.4 发酵参数测定第26-28页
        2.2.5 转录组学分析第28-29页
    2.3 结果和分析第29-46页
        2.3.1 C.glutamicum VWB-1与ATCC 13869分批发酵培养生长及产酸比较第29-31页
        2.3.2 C.glutamicum VWB-1与ATCC 13869转录组学测序整体比较第31-32页
        2.3.3 氨基酸代谢途径基因差异表达分析第32-36页
        2.3.4 L-缬氨酸合成所需关键前体物质和辅因子在中心代谢途径中的积累第36-41页
        2.3.5 C.glutamicum VWB-1中转运系统的调控第41-43页
        2.3.6 延伸因子、核糖体蛋白以及σ因子编码基因的转录调控第43-45页
        2.3.7 细胞分裂和细胞壁合成的关键基因在VWB-1中的转录调控第45-46页
    2.4 讨论第46-47页
    2.5 本章小结第47-48页
第三章 蛋白组学解析C.glutamicum VWB-1高产L-缬氨酸机制第48-64页
    3.1 引言第48页
    3.2 材料和方法第48-52页
        3.2.1 菌株第48页
        3.2.2 试剂和仪器第48-50页
        3.2.3 培养基和培养条件第50页
        3.2.4 发酵参数测定第50页
        3.2.5 细胞全蛋白SDS-PAGE第50页
        3.2.6 二维电泳第50-51页
        3.2.7 图像扫描和差异蛋白点比较分析第51页
        3.2.8 质谱鉴定差异蛋白第51-52页
    3.3 结果和分析第52-62页
        3.3.1 C.glutamicum VWB-1和ATCC 13869细胞全蛋白提取第52页
        3.3.2 C.glutamicum VWB-1和ATCC 13869的蛋白质组学差异模块化分析第52-62页
    3.4 讨论第62-63页
    3.5 本章小结第63-64页
第四章 过量表达具有抗反馈抑制能力的AHAS提高出发菌株C.glutamicum VWB-1 L-缬氨酸产量第64-82页
    4.1 引言第64页
    4.2 材料和方法第64-71页
        4.2.1 菌株、质粒和引物第64-66页
        4.2.2 主要试剂第66页
        4.2.3 主要仪器第66页
        4.2.4 培养基和培养条件第66-67页
        4.2.5 分子生物学操作第67-70页
        4.2.6 蛋白表达分析第70页
        4.2.7 Ni柱纯化重组蛋白第70页
        4.2.8 酶活性检测及抗反馈抑制分析第70-71页
    4.3 结果和分析第71-80页
        4.3.1 不同AHAS序列比较分析第71-73页
        4.3.2 ilvBN的pET-28a(+)系列重组表达载体的构建及定点突变第73-74页
        4.3.3 AHAS的体外表达实验第74-75页
        4.3.4 突变型AHAS抗反馈抑制分析第75-77页
        4.3.5 用于C.glutamicum VWB-1中ilvBN表达重组载体的构建第77-78页
        4.3.6 重组表达质粒稳定性研究第78页
        4.3.7 重组C.glutamicum工程菌摇瓶产酸性能分析第78-79页
        4.3.8 VWB-1/pEC-XK99E-ilvBN1~M的补料分批发酵第79-80页
    4.4 讨论第80页
    4.5 本章小结第80-82页
第五章 C.glutamicum VWB-1 L-缬氨酸合成旁支路途径的代谢工程改造第82-95页
    5.1 引言第82-83页
    5.2 材料和方法第83-89页
        5.2.0 菌株和质粒第83-85页
        5.2.1 工具酶和试剂第85页
        5.2.2 主要仪器第85页
        5.2.3 培养基和培养条件第85页
        5.2.4 基本操作第85-88页
        5.2.5 突变株遗传稳定性试验第88页
        5.2.6 alaT敲除突变株VWB-2的透射电镜观察第88页
        5.2.7 重组菌株发酵第88-89页
    5.3 结果和分析第89-93页
        5.3.1 敲除质粒构建第89页
        5.3.2 基因敲除第89-90页
        5.3.3 基因敲除突变株摇瓶发酵第90页
        5.3.4 基于sacB的整合型敲除方法构建alaT的无痕敲除突变株第90-91页
        5.3.5 C.glutamicum VWB-2的5L罐发酵实验第91-92页
        5.3.6 透射电镜观察VWB-2菌株形态变化第92-93页
    5.4 讨论第93-94页
    5.5 本章小结第94-95页
第六章 增加合成途径碳代谢流并强化L-缬氨酸分泌能力提高C.glutamicum VWB-1 L-缬氨酸产量第95-105页
    6.1 引言第95-96页
    6.2 材料与方法第96-100页
        6.2.1 菌株、质粒和引物第96-98页
        6.2.2 工具酶和试剂第98页
        6.2.3 主要仪器第98页
        6.2.4 培养基和培养条件第98页
        6.2.5 重组质粒和重组菌株的构建第98-100页
        6.2.6 重组蛋白的表达分析第100页
        6.2.7 重组菌株发酵性能检测第100页
    6.3 结果与分析第100-103页
        6.3.1 表达载体构建第100-101页
        6.3.2 重组表达质粒的稳定性研究第101页
        6.3.3 不同的VWB-1重组菌的L-缬氨酸生产比较第101页
        6.3.4 重组质粒携带基因的蛋白表达分析第101-102页
        6.3.5 VWB-2重组菌株5L罐发酵实验第102-103页
    6.4 讨论第103-104页
    6.5 本章小结第104-105页
主要结论与展望第105-107页
    主要结论第105-106页
    展望第106-107页
论文主要创新点第107-108页
致谢第108-109页
参考文献第109-115页
附录:作者在攻读博士学位期间发表的论文第115页

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