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北方三省区番茄病毒病病原分子鉴定及番茄花叶病毒全基因组序列分析

符号说明第5-9页
中文摘要第9-11页
Abstract第11-12页
1 前言第13-25页
    1.1 番茄病毒病病原种类及危害简介第13-21页
        1.1.1 番茄黄化曲叶病毒的分类及病原特征第15-17页
        1.1.2 番茄褪绿病毒的分类及病原特征第17-18页
        1.1.3 番茄花叶病毒的分类及病原特征第18-21页
    1.2 番茄病毒病的防治措施第21-22页
    1.3 番茄病毒病的检测技术研究概况第22-24页
        1.3.1 生物学检测法第22页
        1.3.2 血清学检测法第22-23页
        1.3.3 分子生物学检测法第23-24页
    1.4 本研究的目的与意义第24-25页
2 材料与方法第25-40页
    2.1 实验材料与仪器第25-28页
        2.1.1 病毒样品的采集第25页
        2.1.2 菌株和载体第25-26页
        2.1.3 生化及分子生物学试剂第26页
        2.1.4 实验所需仪器第26页
        2.1.5 实验试剂的配制方法第26-28页
    2.2 感病植株病毒病中DNA、RNA病毒的检测与鉴定第28-37页
        2.2.1 植物基因组DNA的提取第28-29页
        2.2.2 病毒基因组RNA的提取第29-30页
        2.2.3 引物的设计及合成第30-32页
        2.2.4 反转录cDNA的合成第32页
        2.2.5 PCR扩增第32-33页
        2.2.6 PCR产物的克隆和测序第33-37页
        2.2.7 序列分析第37页
    2.3 番茄双生病毒的检测与鉴定第37-38页
        2.3.1 样品DNA提取第37页
        2.3.2 引物合成第37-38页
        2.3.3 双生病毒的RCR扩增第38页
        2.3.4 PCR产物的克隆及测序第38页
        2.3.5 序列分析第38页
    2.4 番茄花叶病毒全基因组PCR的扩增第38-40页
        2.4.1 感病植株RNA的提取第38页
        2.4.2 引物的设计及合成第38-39页
        2.4.3 反转录cDNA的合成第39页
        2.4.4 ToMV全基因组PCR的扩增第39页
        2.4.5 PCR产物的克隆及测序第39页
        2.4.6 序列分析第39-40页
3 结果与分析第40-59页
    3.1 北方三省区番茄感病样品DNA病毒病原的检测结果第40-42页
        3.1.1 北方三省区侵染番茄的DNA病毒种类检测情况第40-41页
        3.1.2 北方三省区番茄DNA病毒病检出率第41页
        3.1.3 北方三省区番茄TYLCV病毒病分布情况第41-42页
    3.2 北方三省区番茄感病样品RNA病毒病原的检测结果第42-45页
        3.2.1 北方三省区番茄RNA病毒病检出率第42-43页
        3.2.2 北方三省区番茄病毒病分布情况第43-45页
    3.3 北方三省区番茄病毒病复合侵染情况第45-48页
    3.4 番茄花叶病毒分离物的全基因组扩增及序列分析第48-50页
        3.4.1 北方三省部分地区番茄花叶病毒分离物全基因组序列扩增第48-49页
        3.4.2 ToMV全基因组结构分析第49页
        3.4.3 ToMV与Tobamovirus属病毒部分分离物的一致性比较第49-50页
    3.5 番茄GS100分离物与Tobamovirus属部分分离物进行一致性比较分析第50-59页
    3.6 ToMV全基因组序列突变分析第59页
4 ToMV分离物的核苷酸系统进化关系分析第59-63页
    4.1 ToMV分离物的CP和MP蛋白核苷酸系统进化分析第59-62页
    4.2 ToMV全基因组的核苷酸系统进化分析第62-63页
5 ToMV分离物的氨基酸系统进化关系分析第63-69页
    5.1 ToMV分离物的CP和MP蛋白氨基酸系统进化分析第63-67页
    5.2 ToMV分离物的全基因组氨基酸系统进化分析第67-69页
6 结论与讨论第69-71页
参考文献第71-82页
致谢第82页

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