| 中文摘要 | 第7-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 1 前言 | 第10-18页 |
| 1.1 松材线虫概述 | 第10页 |
| 1.2 松材线虫的生物学分类地位 | 第10页 |
| 1.3 松材线虫的形态学特征表述 | 第10-11页 |
| 1.4 松材线虫病的危害 | 第11页 |
| 1.5 松材线虫的生活史 | 第11-12页 |
| 1.6 松材线虫传播方式及主要寄生树种 | 第12页 |
| 1.7 松材线虫的致病机理 | 第12-14页 |
| 1.8 松材线虫行为的研究 | 第14-15页 |
| 1.9 松材线虫的防治情况 | 第15-16页 |
| 1.10 5 -羟色胺研究进展 | 第16页 |
| 1.11 乙酰胆碱酯酶 | 第16-17页 |
| 1.11.1 乙酰胆碱酯酶研究进展 | 第16页 |
| 1.11.2 松材线虫乙酰胆碱酯酶研究进展 | 第16-17页 |
| 1.12 试验目的与意义 | 第17-18页 |
| 2 试验材料与方法 | 第18-27页 |
| 2.1 供试虫株与菌株 | 第18页 |
| 2.2 主要试剂及实验器材 | 第18页 |
| 2.3 线虫的培养、分离与收集 | 第18-19页 |
| 2.3.1 松材线虫卵的获得 | 第18页 |
| 2.3.2 不同龄期线虫幼虫的获得 | 第18-19页 |
| 2.4 提取松材线虫RNA | 第19页 |
| 2.5 松材线虫NXY61转录组测序分析 | 第19-22页 |
| 2.5.1 松材线虫卵的收集 | 第19页 |
| 2.5.2 二龄幼虫及成虫的获得 | 第19页 |
| 2.5.3 不同虫态松材线虫总RNA的提取 | 第19页 |
| 2.5.4 RNA质量检测 | 第19-20页 |
| 2.5.5 文库构建 | 第20页 |
| 2.5.6 库检 | 第20页 |
| 2.5.7 上机测序 | 第20页 |
| 2.5.8 基因表达水平分析 | 第20-21页 |
| 2.5.9 可变剪切分析 | 第21页 |
| 2.5.10 RNA-seq整体质量评估 | 第21-22页 |
| 2.5.11 基因差异表达分析 | 第22页 |
| 2.5.12 差异基因KEGG富集分析 | 第22页 |
| 2.6 松材线虫5-羟色胺受体基因ser-1扩增 | 第22-23页 |
| 2.7 松材线虫乙酰胆碱酯酶基因ACE-1扩增 | 第23-25页 |
| 2.7.1 反转录获得cDNA | 第23-24页 |
| 2.7.2 扩增产物胶回收 | 第24-25页 |
| 2.7.3 回收产物送样测序 | 第25页 |
| 2.8 松材线虫乙酰胆碱酯酶基因ACE-1干扰 | 第25页 |
| 2.9 浸染后松材线虫的收集培养与蠕动行为检测 | 第25-27页 |
| 2.9.1 RNAi松材线虫后亲代幼虫蠕动行为检测 | 第26页 |
| 2.9.2 RNAi松材线虫后亲代成虫蠕动行为检测 | 第26页 |
| 2.9.3 RNAi松材线虫后子一代幼虫蠕动行为检测 | 第26页 |
| 2.9.4 RNAi松材线虫后子一代成虫蠕动行为检测 | 第26-27页 |
| 3 结果与分析 | 第27-53页 |
| 3.1 不同虫态松材线虫转录组测序结果分析 | 第27-44页 |
| 3.1.1 总RNA提取及质量检测 | 第27-28页 |
| 3.1.2 Reads与参考基因组比对情况统计 | 第28-29页 |
| 3.1.3 可变剪切事件分类和数量统计 | 第29-30页 |
| 3.1.4 基因表达水平分析 | 第30-31页 |
| 3.1.5 RNA-seq整体质量评估 | 第31-32页 |
| 3.1.6 差异表达分析 | 第32-34页 |
| 3.1.7 差异基因聚类分析 | 第34页 |
| 3.1.8 差异基因维恩图 | 第34-35页 |
| 3.1.9 差异基因GO富集分析 | 第35-38页 |
| 3.1.10 差异基因KEGG富集分析 | 第38-44页 |
| 3.1.10.1 差异基因富集散点图分析 | 第38-40页 |
| 3.1.10.2 差异基因KEGG富集通路分析 | 第40-44页 |
| 3.2 松材线虫5-羟色胺受体基因ser-1扩增检测及结构分析 | 第44-46页 |
| 3.3 松材线虫乙酰胆碱酯酶基因ACE-1扩增检测及结构分析 | 第46-49页 |
| 3.4 RNAi松材线虫乙酰胆碱酯酶基因ACE-1对线虫蠕动行为的影响 | 第49-53页 |
| 3.4.1 二龄幼虫受RNAi后发育至三龄幼虫时的线虫收集及其蠕动行为检测 | 第49-50页 |
| 3.4.2 二龄幼虫受RNAi后发育至成虫时的线虫收集及其蠕动行为检测 | 第50-51页 |
| 3.4.3 二龄幼虫受RNAi后其子一代三龄幼虫的收集及其蠕动行为检测 | 第51-52页 |
| 3.4.4 二龄幼虫受RNAi后其子一代成虫的收集及其蠕动行为检测 | 第52-53页 |
| 4 讨论 | 第53-55页 |
| 5 结论 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-62页 |
| 致谢 | 第62页 |
