| 摘要 | 第5-10页 |
| ABSTRACT | 第10-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第20-84页 |
| 1.1 胃肠道微生物研究进展 | 第20-51页 |
| 1.1.1 微生物生态学研究方法 | 第20-29页 |
| 1.1.1.1 依赖培养的分析方法 | 第20-21页 |
| 1.1.1.2 分子分析方法 | 第21-29页 |
| 1.1.2 微生物在人类胃肠道的分布特征 | 第29-38页 |
| 1.1.2.1 胃肠道各段黏膜黏附菌群与内容物菌的组成 | 第30-34页 |
| 1.1.2.2 粪便肠道菌群的组成 | 第34-36页 |
| 1.1.2.3 粪便菌群与黏膜黏附菌的差异 | 第36-38页 |
| 1.1.3 肠道内有重要生理学意义的微生物组成 | 第38-42页 |
| 1.1.3.1 拟杆菌 | 第39页 |
| 1.1.3.2 梭菌 | 第39-40页 |
| 1.1.3.3 双歧杆菌 | 第40-41页 |
| 1.1.3.4 乳酸菌（lactic acid bacteria，LAB） | 第41-42页 |
| 1.1.4 肠道微生物的主要功能 | 第42-51页 |
| 1.1.4.1 营养、代谢功能 | 第42-43页 |
| 1.1.4.2 上皮细胞的生长与分化 | 第43页 |
| 1.1.4.3 与宿主的免疫功能相关 | 第43-45页 |
| 1.1.4.4 保护作用 | 第45-46页 |
| 1.1.4.5 肠道菌群与疾病 | 第46-51页 |
| 1.2 益生元的研究背景及现状 | 第51-57页 |
| 1.2.1 益生元对动物机体健康调节作用的研究进展 | 第52-57页 |
| 1.2.1.1 调节动物胃肠道的菌群 | 第52-53页 |
| 1.2.1.2 促进脂类代谢 | 第53-54页 |
| 1.2.1.3 调节肠道黏膜结构 | 第54页 |
| 1.2.1.4 促进动物对钙的吸收利用 | 第54-55页 |
| 1.2.1.5 调节动物机体免疫系统、抗肿瘤作用 | 第55-56页 |
| 1.2.1.6 抗肠道疾病 | 第56-57页 |
| 1.3 结肠癌的研究背景及现状 | 第57-84页 |
| 1.3.1 临床表现 | 第57-58页 |
| 1.3.2 结直肠癌分类 | 第58-59页 |
| 1.3.3 结肠癌发生的相关因素 | 第59-65页 |
| 1.3.3.1 饮食对结肠癌的影响 | 第59-60页 |
| 1.3.3.2 肠道菌群对结肠癌的影响 | 第60-61页 |
| 1.3.3.3 代谢性疾病以及肠道疾病对结肠癌的影响 | 第61-62页 |
| 1.3.3.4 环境因素、种族、性别与年龄对结肠癌的影响 | 第62-64页 |
| 1.3.3.5 吸烟、饮酒与运动对结肠癌的影响 | 第64-65页 |
| 1.3.4 结肠癌的临床诊断 | 第65-67页 |
| 1.3.4.1 临床表现 | 第65页 |
| 1.3.4.2 直肠指检 | 第65页 |
| 1.3.4.3 实验室检查 | 第65-67页 |
| 1.3.5 结肠癌的临床治疗 | 第67-68页 |
| 1.3.6 结肠癌的化学预防 | 第68-84页 |
| 第二章 结肠癌癌前病变大鼠模型肠道菌群组成结构的变化研究 | 第84-133页 |
| 摘要 | 第84-86页 |
| ABSTRACT | 第86-89页 |
| 引言 | 第89-91页 |
| 2.1 材料与方法 | 第91-101页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第91-92页 |
| 2.1.2 ACF（异常腺窝灶）的测定 | 第92页 |
| 2.1.3 粪便样本总DNA 的提取 | 第92-93页 |
| 2.1.4 优势细菌和四个类群细菌的扩增 | 第93-96页 |
| 2.1.5 肠道细菌组成的变性梯度凝胶电泳 | 第96页 |
| 2.1.6 变性梯度凝胶电泳的数字化分析 | 第96页 |
| 2.1.7 多变量统计分析技术 | 第96-98页 |
| 2.1.8 PCR-DGGE 凝胶回收与测序 | 第98-99页 |
| 2.1.9 DGGE 图谱中重要条带的登录号 | 第99页 |
| 2.1.10 PCR-DGGE 图谱中重要条带的实时荧光定量PCR | 第99-100页 |
| 2.1.11 双歧杆菌实时荧光定量PCR | 第100页 |
| 2.1.12 单变量统计学方法 | 第100-101页 |
| 2.2 实验结果 | 第101-121页 |
| 2.2.1 二甲肼诱发结肠癌癌前病变大鼠的肠道菌群组成改变的实验结果 | 第101-116页 |
| 2.2.2 中药预防结肠癌癌前病变大鼠肠道菌群组成改变的实验结果 | 第116-121页 |
| 2.3 讨论 | 第121-128页 |
| 2.3.1 二甲肼诱发结肠癌癌前病变大鼠的肠道菌群组成改变的实验结果讨论 | 第121-126页 |
| 2.3.2 中药对二甲肼诱发结肠癌癌前病变大鼠的菌群组成调节作用的结果讨论 | 第126-128页 |
| 2.4 结论 | 第128-129页 |
| 参考文献 | 第129-133页 |
| 第三章 人源菌群仔猪模型大肠各段菌群组成空间分布特征以及益生元对肠道菌群组成结构的调节作用研究 | 第133-182页 |
| 摘要 | 第133-135页 |
| ABSTRACT | 第135-137页 |
| 引言 | 第137-139页 |
| 3.1 材料与方法 | 第139-146页 |
| 3.1.1 益生元 | 第139-140页 |
| 3.1.2 实验动物 | 第140-141页 |
| 3.1.3 人供体粪便菌悬液的制备和接种 | 第141页 |
| 3.1.4 仔猪大肠各段黏膜、内容物与粪便样品的采集和菌体总 DNA 的提取 | 第141-142页 |
| 3.1.5 粪便及肠道内容物中菌体的收集与菌体总DNA 的提取 | 第142页 |
| 3.1.6 肠道各段黏膜黏附细菌的总 DNA 的提取 | 第142-143页 |
| 3.1.7 优势细菌的 PCR 扩增 | 第143页 |
| 3.1.8 柔嫩梭菌类群特异性PCR 扩增 | 第143页 |
| 3.1.9 双歧杆菌属特异性PCR-DGGE | 第143-144页 |
| 3.1.10 乳酸菌特异性 PCR-DGGE | 第144页 |
| 3.1.11 Reconditioning PCR | 第144页 |
| 3.1.12 肠道细菌组成的变性梯度凝胶电泳 | 第144页 |
| 3.1.13 变性梯度凝胶电泳的数字化分析 | 第144-145页 |
| 3.1.14 多变量统计分析技术 | 第145-146页 |
| 3.1.15 PCR-DGGE 凝胶回收与测序 | 第146页 |
| 3.1.16 PCR-DGGE 图谱中重要条带的登录号 | 第146页 |
| 3.2 结果 | 第146-169页 |
| 3.2.1 HFA 仔猪大肠各段黏膜黏附、内容物及粪便菌群组成空间分布的研究结果 | 第146-161页 |
| 3.2.2 益生元对HFA 仔猪大肠各段黏膜黏附、内容物及粪便菌群组成调节的研究结果 | 第161-169页 |
| 3.3 讨论 | 第169-176页 |
| 3.3.1 HFA 仔猪大肠各段黏膜黏附、内容物及粪便菌群组成的空间分布研究结果的讨论 | 第169-173页 |
| 3.3.2 益生元对HFA 仔猪大肠各段黏膜黏附、内容物及粪便菌群组成的调节研究结果讨论 | 第173-176页 |
| 3.4 结论 | 第176-177页 |
| 参考文献 | 第177-182页 |
| 第四章 人供体源的肺炎克雷伯氏菌与人源菌群仔猪的感染 | 第182-210页 |
| 摘要 | 第182-184页 |
| ABSTRACT | 第184-187页 |
| 引言 | 第187-188页 |
| 4.1 材料与方法 | 第188-197页 |
| 4.1.1 人供体粪便菌悬液的制备和接种 | 第188页 |
| 4.1.2 实验动物 | 第188页 |
| 4.1.3 病原菌的分离与鉴定 | 第188-193页 |
| 4.1.4 发病仔猪粪便中病原菌的动态监测 | 第193-196页 |
| 4.1.5 病原菌的来源鉴定 | 第196-197页 |
| 4.1.6 病原菌回接实验 | 第197页 |
| 4.2 结果 | 第197-205页 |
| 4.2.1 病理变化 | 第197页 |
| 4.2.2 病原菌分离培养与鉴定 | 第197-200页 |
| 4.2.3 发病仔猪粪便中病原菌的动态监测 | 第200-201页 |
| 4.2.4 病原菌来源鉴定 | 第201-204页 |
| 4.2.5 细菌的药物敏感性实验 | 第204页 |
| 4.2.6 病原菌回接实验 | 第204-205页 |
| 4.3 讨论 | 第205-207页 |
| 4.4 结论 | 第207页 |
| 参考文献 | 第207-210页 |
| 本研究的创新性 | 第210-211页 |
| 附录1.五种不同的DNA提取法对二种常见院内感染菌ERIC-PCR鉴定的影响研究 | 第211-220页 |
| 附录2. 溶液及培养基配方 | 第220-222页 |
| 附录3. 仪器设备 | 第222-224页 |
| 附录4. 缩写和全名 | 第224-227页 |
| 致谢 | 第227-232页 |
| 参与科研课题 | 第232页 |
