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甘蓝型油菜stb1突变体曲茎性状的QTL定位与转录组分析

摘要第7-9页
Abstract第9-11页
第一章 文献综述第12-22页
    1.1 油菜在国民经济中的地位及生产现状第12-13页
        1.1.1 油菜在国民经济中的地位第12页
        1.1.2 油菜的生产现状第12-13页
    1.2 作物理想株型研究概况第13-14页
        1.2.1 植物株型的概念第13页
        1.2.2 主要农作理想株型育种研究第13-14页
        1.2.3 甘蓝型油菜理想株型育种研究第14页
    1.3 油菜曲茎相关性状的研究进展第14-16页
        1.3.1 倒伏性状研究第14-15页
        1.3.2 油菜抗倒伏性状的研究进展第15-16页
        1.3.3 油菜茎倒对产量的影响第16页
    1.4 植物曲茎性状的研究进展第16-18页
        1.4.1 生长素对植物生长发育的研究第16-17页
        1.4.2 生长素与植株表型变异的关系第17-18页
        1.4.3 曲茎性状相关的基因功能研究进展第18页
    1.5 SNP技术及其应用第18-19页
        1.5.1 SNP技术简介及其特点第18-19页
        1.5.2 SNP标记技术的应用第19页
    1.6 转录组测序技术及其应用第19-21页
    1.7 本研究的目的和意义第21-22页
第二章 甘蓝型油菜stb1突变体的表型观察第22-36页
    2.1 试验材料第22-23页
        2.1.1 材料特征第22页
        2.1.2 田间试验设计第22-23页
    2.2. 主要实验仪器与试剂第23页
    2.3 试验方法第23-27页
        2.3.1 曲茎性状调查第23-24页
        2.3.2 角果长性状调查第24页
        2.3.3 生长素处理及含量的测定第24-25页
        2.3.4 木质素及木质素单体含量的测定第25-26页
        2.3.5 茎秆发育的细胞学观察第26-27页
    2.4 结果与分析第27-34页
        2.4.1 曲茎突变体的表型观察第27-28页
        2.4.2 stb1激素外处理后的植株表型观察第28-29页
        2.4.3 stb1发生突变表型前后各时期的生长激素含量第29-30页
        2.4.4 茎秆木质素、纤维素和半纤维素含量的相关性分析第30-32页
        2.4.5 ZS11和stb1的组织切片染色第32-34页
    2.5 结论第34-36页
第三章 甘蓝型油菜STB1基因的定位第36-48页
    3.1 实验材料第36页
    3.2 实验方法第36-40页
        3.2.1 实验主要试剂及仪器设备第36页
        3.2.2 植物基因组DNA提取第36-37页
        3.2.3 琼脂糖凝胶的制备第37页
        3.2.4 分子标记第37-38页
        3.2.5 遗传连锁图谱的构建及QTL位点扫描第38-39页
        3.2.6 候选基因预测第39页
        3.2.7 InDel标记的开发第39-40页
    3.3 结果与分析第40-47页
        3.3.1 甘蓝型油菜曲茎性状的遗传分析第40-41页
        3.3.2 材料总DNA的质检结果第41页
        3.3.3 SSR标记引物的筛选第41-42页
        3.3.4 SNP芯片标记分析第42页
        3.3.5 遗传连锁图谱的构建第42-44页
        3.3.6 QTL分析第44页
        3.3.7 序列比对及连锁不平衡分析第44-45页
        3.3.8 全基因组重测序分析第45-46页
        3.3.9 InDel标记单一位点的鉴定第46-47页
    3.4 结论第47-48页
        3.4.1 曲茎突变体stb1的遗传分析第47页
        3.4.2 曲茎突变体stb1的QTL定位第47-48页
第四章 甘蓝型油菜曲茎突变体stb1的转录组测序及候选基因预测第48-60页
    4.1 试验材料第48页
    4.2 试验主要试剂与仪器设备第48页
    4.3 试验方法第48-52页
        4.3.1 植物总RNA的提取第48-49页
        4.3.2 甘蓝型油菜cDNA第一链的合成第49-50页
        4.3.3 荧光定量PCR反应第50-51页
        4.3.4 油菜茎秆RNA-Seq测序第51-52页
    4.4 结果与分析第52-57页
        4.4.1 RNA纯度测定及电泳检测第52页
        4.4.2 材料cDNA合成与内标调整第52-53页
        4.4.3 差异表达基因GO富集分析第53-56页
        4.4.4 定量PCR验证第56-57页
    4.5 结论第57-60页
第五章 讨论第60-66页
    5.1 曲茎突变体的特点第60-61页
    5.2 甘蓝型油菜曲茎突变体stb1的遗传分析第61-62页
    5.3 基于甘蓝型油菜SNP遗传图谱的构建及QTL定位分析第62页
    5.4 基于甘蓝型油菜全基因组重测序的InDel标记的开发第62-63页
    5.5 基于RNA-seq对曲茎突变体stb1的候选基因预测第63-66页
主要创新之处第66页
进一步工作设想第66-68页
参考文献第68-80页
主要缩略词第80-82页
致谢第82-84页
硕士学习期间发表论文第84页
主研课题情况第84页
参与课题情况第84页

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