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急性冠脉综合征全基因组甲基化差异及其功能的生物信息学分析

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第一章 绪论第9-23页
    一、急性冠脉综合征与DNA甲基化第9-18页
        1.1 急性冠脉综合征第9页
        1.2 ACS的发病机制第9-10页
            1.2.1 斑块破裂第10页
            1.2.2 血栓形成第10页
            1.2.3 其他机制第10页
        1.3 ACS的诊断第10-12页
        1.4 DNA甲基化与心血管疾病第12-17页
        1.5 DNA甲基化与ACS第17-18页
    二、DNA甲基化的检测方法第18-21页
        2.1 特异位点DNA甲基化检测方法第18-20页
        2.2 高通量DNA甲基化检测方法第20-21页
    三、生物信息学功能分析第21-23页
        3.1 GO分析(Gene Ontology Analysis,GO;http://geneontology.org/)第21-22页
        3.2 京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG;http://www.kegg.jp/)功能分析第22-23页
第二章 450K Infinium Methylation BeadChip芯片的ACS甲基化差异性分析第23-47页
    一、引言第23-24页
    二、实验材料与方法第24-36页
        2.1 研究对象与血样收集第24-25页
        2.2 仪器与试剂第25-26页
        2.3 全血DNA的提取第26页
        2.4 450K Infinium Methylation BeadChip的检测第26-34页
        2.5 数据处理第34-36页
    三、实验结果第36-45页
        3.1 DNA的定量及其完整性第36-37页
        3.2 标准化的数据整体分布图第37-38页
        3.3 差异甲基化位点及基因的筛选第38-40页
        3.4 差异甲基化位点功能分析第40-45页
    四、讨论第45-47页
第三章 NPC1在CAD患者中DNA甲基化水平的变化及临床意义第47-54页
    一、引言第47页
    二、实验材料与方法第47-49页
        2.1 研究对象与标本收集第47-48页
        2.2 仪器与试剂第48页
        2.3 全血DNA提取及转化具体步骤第48页
        2.4 MSP具体步骤第48-49页
        2.5 数据分析第49页
    三、实验结果第49-51页
        3.1 nMSP检测NPC1甲基化水平的结果第49-50页
        3.2 BSP对nMSP的验证结果第50-51页
    四、讨论第51-54页
全文小结第54-55页
参考文献第55-63页
攻读硕士期间发表论文及获得奖励第63-64页
致谢第64-65页

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