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辣木多个组织转录组数据的组装及辅助辣木基因组重注释

摘要第4-6页
Abstract第6-7页
第一章 前言第10-24页
    1 辣木概述第10-18页
        1.1 辣木的生物学特性第10-12页
        1.2 辣木的营养价值第12-14页
        1.3 辣木的健康功效研究现状第14-17页
            1.3.1 辣木的降三高作用第15页
            1.3.2 辣木的抗炎症作用第15页
            1.3.3 辣木的癌症化学预防作用第15-16页
            1.3.4 辣木的抗菌作用第16页
            1.3.5 辣木的抗病毒作用第16页
            1.3.6 辣木的抗氧化作用第16页
            1.3.7 辣木对肝、肾的保护作用第16-17页
        1.4 辣木基因组研究进展第17-18页
    2 转录组学研究概述第18-22页
        2.1 转录组概念第18-19页
        2.2 转录组研究方法概述第19-22页
            2.2.1 转录组研究传统方法概述第19-20页
            2.2.2 新一代高通量转录组测序技术第20-22页
            2.2.3 第三代测序技术第22页
    3 本研究目的及意义第22-24页
第二章 研究内容第24-47页
    1 材料第24页
    2 实验过程与方法第24-37页
        2.1 辣木各组织total RNA的提取第24-26页
        2.2 RNA质量检查及浓度测定第26页
        2.3 cDNA文库的构建第26-31页
        2.4 新一代测序技术测序第31-32页
        2.5 Hiseq2000测序序列和质量值生成第32-33页
        2.6 测序数据的过滤第33页
        2.7 转录组数据组装第33-35页
        2.8 表达量的统计第35页
        2.9 更新蛋白质编码基因的注释——重注释辣木基因组第35-36页
        2.10 蛋白质编码功能注释第36-37页
    3 结果与分析第37-45页
        3.1 测序数据与组装情况第37-38页
        3.2 辣木基因组重注释第38-39页
        3.3 蛋白功能注释第39-40页
        3.4 辣木各组织基因表达量的统计第40-45页
    4 讨论与小结第45-47页
第三章 总结第47-48页
参考文献第48-55页
个人简介及在学期间所取得的科研成果第55-56页
致谢第56页

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