| 摘要 | 第7-13页 |
| ABSTRACT | 第13-18页 |
| 缩略词表 | 第19-21页 |
| 第一章 绪论 | 第21-53页 |
| 1.1 里氏木霉纤维素酶研究概述 | 第22-24页 |
| 1.2 里氏木霉纤维素酶基因表达调控研究进展 | 第24-37页 |
| 1.2.1 参与纤维素酶基因表达调控的转录因子 | 第25-27页 |
| 1.2.2 Xyr1是里氏木霉纤维素酶基因诱导表达最关键的转录因子 | 第27-30页 |
| 1.2.3 光信号影响纤维素酶基因表达 | 第30-32页 |
| 1.2.4 G蛋白信号与纤维素酶基因表达调控 | 第32-33页 |
| 1.2.5 参与纤维素酶基因诱导表达的转运蛋白 | 第33页 |
| 1.2.6 β-葡萄糖苷酶参与纤维素酶基因表达调控 | 第33-34页 |
| 1.2.7 Velvet/Lae1复合物调控纤维素酶基因表达 | 第34-36页 |
| 1.2.8 组蛋白乙酰化修饰和染色质结构调控与纤维素酶基因表达 | 第36-37页 |
| 1.3 真菌基因转录调控研究概述 | 第37-51页 |
| 1.3.1 转录因子分类和真菌Zn(Ⅱ)2Cys6锌指双核簇蛋白功能特征 | 第38-43页 |
| 1.3.2 SAGA复合物 | 第43-47页 |
| 1.3.3 Mediator复合物与转录调控 | 第47-49页 |
| 1.3.4 转录调控机制的经典案例——酿酒酵母半乳糖代谢基因的转录调控 | 第49-51页 |
| 1.4 论文立题依据以及主要内容 | 第51-53页 |
| 第二章 Xyr1相互作用蛋白的筛选及其功能研究 | 第53-93页 |
| 2.1 材料与方法 | 第54-70页 |
| 2.1.1 菌株和质粒 | 第54页 |
| 2.1.2 引物 | 第54-55页 |
| 2.1.3 培养基和培养条件 | 第55-58页 |
| 2.1.4 主要试剂和仪器 | 第58页 |
| 2.1.5 实验方法步骤 | 第58-70页 |
| 2.2 结果与讨论 | 第70-90页 |
| 2.2.1 里氏木霉cDNA表达文库构建 | 第70-72页 |
| 2.2.2 Xyr1相互作用蛋白筛选和鉴定分析 | 第72-74页 |
| 2.2.3 MATa1与Xyr1相互作用验证 | 第74-75页 |
| 2.2.4 MATa1缺失菌构建和生长表型分析 | 第75-80页 |
| 2.2.5 MATa1参与光照下纤维素酶基因诱导表达调控 | 第80-82页 |
| 2.2.6 MATa1在乳糖诱导纤维素酶表达过程中发挥重要作用 | 第82-83页 |
| 2.2.7 GFP-MATa1定位及其与Xyr1共定位分析 | 第83-85页 |
| 2.2.8 过表达MATa1抑制纤维素酶的诱导表达 | 第85页 |
| 2.2.9 MATa1以纤维素诱导依赖的方式结合到纤维素酶基因启动子区 | 第85-88页 |
| 2.2.10 MATa1在纤维素酶基因启动子上的募集依赖于Xyr1 | 第88-90页 |
| 2.3 本章小结 | 第90-93页 |
| 第三章 组蛋白乙酰化修饰复合物GCN5/ADA2/ADA3调控纤维素酶基因表达及其机制探究 | 第93-119页 |
| 3.1 材料与方法 | 第94-99页 |
| 3.1.1 菌株和质粒 | 第94页 |
| 3.1.2 引物 | 第94-96页 |
| 3.1.3 培养基和培养条件 | 第96页 |
| 3.1.4 主要试剂和仪器 | 第96页 |
| 3.1.5 实验方案和方法 | 第96-99页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第99-117页 |
| 3.2.1 Ptcu1-gcn5启动子置换菌株构建和生长表型分析 | 第99-104页 |
| 3.2.2 Ada2、Ada3鉴定和系统发育分析 | 第104-105页 |
| 3.2.3 Ada2在里氏木霉生长、无性繁殖和纤维素酶诱导过程中发挥重要作用 | 第105-108页 |
| 3.2.4 Ada2在里氏木霉对不同逆境响应过程中发挥重要作用 | 第108-110页 |
| 3.2.5 Ada3参与里氏木霉纤维素酶基因表达调控 | 第110-111页 |
| 3.2.6 里氏木霉纤维素酶基因诱导表达过程伴随着启动子区组蛋白H3K9和H3K14发生依赖于Gcn5和Xyr1的乙酰化修饰 | 第111-113页 |
| 3.2.7 Xyr1和Gcn5、Ada3之间存在相互作用 | 第113-114页 |
| 3.2.8 Gcn5在诱导下能被招募至纤维素酶基因启动子区 | 第114页 |
| 3.2.9 过表达Xyr1能组成型招募Gcn5至纤维素酶基因启动子区 | 第114-115页 |
| 3.2.10 过表达Xyr1能促使纤维素酶基因的表达摆脱对Gcn5的依赖 | 第115-117页 |
| 3.3 本章小结 | 第117-119页 |
| 第四章 Mediator复合物亚基Gal11在纤维素酶基因诱导表达过程中的功能和机理探究 | 第119-149页 |
| 4.1 材料与方法 | 第120-124页 |
| 4.1.1 菌株和质粒 | 第120页 |
| 4.1.2 引物 | 第120-121页 |
| 4.1.3 培养基和培养条件 | 第121页 |
| 4.1.4 仪器和试剂 | 第121-122页 |
| 4.1.5 试验方法步骤 | 第122-124页 |
| 4.2 结果与讨论 | 第124-147页 |
| 4.2.1 里氏木霉Mediator复合物亚基Gal11的鉴定和结构分析 | 第124-126页 |
| 4.2.2 里氏木霉Gal11缺失对生长、生孢和次级代谢影响分析 | 第126-130页 |
| 4.2.3 Gal11差异调控里氏木霉纤维素酶基因的诱导表达 | 第130-132页 |
| 4.2.4 Gal11差异调控纤维素酶基因核心启动子区RNA聚合酶Ⅱ的募集水平 | 第132-133页 |
| 4.2.5 过表达Xyr1无法恢复gal11缺失引起的纤维素酶基因表达水平的下调 | 第133-134页 |
| 4.2.6 Gal11缺失提高了Xyr1在纤维素酶基因启动子上的结合水平 | 第134-136页 |
| 4.2.7 Gal11在OExyr1菌株非诱导下纤维素酶基因表达过程中发挥关键作用 | 第136-139页 |
| 4.2.8 Gal11和Xyr1相互作用分析 | 第139-140页 |
| 4.2.9 Gal11对Xyr1稳定性影响分析 | 第140-141页 |
| 4.2.10 Mediator复合物CDK模块亚基Srb10在纤维素酶基因的诱导表达中发挥十分重要作用 | 第141-145页 |
| 4.2.11 Gal11差异调控里氏木霉对不同逆境的抗性 | 第145-147页 |
| 4.3 本章小结 | 第147-149页 |
| 第五章 Xyr1过表达组成型激活纤维素酶基因的作用模式和机制探究 | 第149-168页 |
| 5.1 材料方法 | 第149-153页 |
| 5.1.1 菌株、培养基和培养条件 | 第149页 |
| 5.1.2 实验方法 | 第149-151页 |
| 5.1.3 转录组数据分析 | 第151-153页 |
| 5.2 结果与讨论 | 第153-167页 |
| 5.2.1 过表达Xyr1组成型激活纤维素酶基因表达 | 第153-155页 |
| 5.2.2 关闭Xyr1导致OExyr1菌株纤维素酶基因表达丧失 | 第155-157页 |
| 5.2.3 Xyr1调控纤维素酶基因启动子区染色质结构 | 第157-158页 |
| 5.2.4 RNA-Seq样品制备和质量检测 | 第158页 |
| 5.2.5 差异表达基因筛选、统计和聚类分析 | 第158-162页 |
| 5.2.6 木质纤维素降解相关基因表达差异分析 | 第162-163页 |
| 5.2.7 转录因子、转运蛋白和蛋白折叠分泌途径相关基因的表达差异分析 | 第163-167页 |
| 5.3 本章小结 | 第167-168页 |
| 全文总结与展望 | 第168-171页 |
| 参考文献 | 第171-181页 |
| 攻读博士学位期间发表和待发表的学术论文 | 第181-182页 |
| 致谢 | 第182-183页 |
| 附件 | 第183-195页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第195页 |
