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玉米12个农艺性状的全基因组关联分析及玉米氮响应相关基因的鉴定

摘要第1-4页
Abstract第4-5页
缩略表第5-9页
第一章 文献综述第9-20页
   ·重测序技术在作物遗传学研究中的应用第9-10页
   ·植物数量性状遗传构成的解析方法第10-16页
     ·植物数量性状的连锁分析第10-11页
     ·植物QTL的图位克隆第11-12页
     ·植物数量性状的关联分析第12-15页
     ·连锁分析与关联分析联合第15-16页
   ·玉米主要农艺性状的研究进展第16-19页
   ·本研究的目的与意义第19-20页
第二章 玉米12个农艺性状表型鉴定及基因型分析第20-31页
   ·引言第20页
   ·材料与方法第20-22页
     ·关联群体的构建与田间实验第20页
     ·玉米12个主要农艺性状的表型鉴定及分析方法第20-21页
     ·群体基因型检测第21页
     ·群体参数的计算第21-22页
   ·结果与分析第22-30页
     ·关联群体的表型变异第22-26页
     ·关联群体的基因型分析第26页
     ·关联群体部分群体参数的计算第26-30页
   ·讨论第30-31页
     ·不同年代育种材料在表型和基因组上的变化第30-31页
第三章 玉米12个农艺性状的全基因组关联分析第31-50页
   ·引言第31页
   ·材料与方法第31-33页
     ·关联群体与群体基因型选择第31-32页
     ·700份玉米自交系群体结构和亲缘关系评估第32页
     ·关联群体12个农艺性状的全基因组关联分析与候选位点的确定第32页
     ·关联分析结果与连锁分析结果的比较第32页
     ·定位区间内基因注释及候选基因提名第32-33页
   ·结果与分析第33-47页
     ·群体LD衰减速率及群体结构分析第33-36页
     ·群体内SNPs缺失位点的推测第36-38页
     ·关联群体12个农艺性状的全基因组关联分析及关联位点可靠性分析第38-45页
     ·关联位点中候选基因的挖掘第45-47页
   ·讨论第47-50页
     ·群体大小和分子标记对全基因组关联分析的影响第47-48页
     ·关联分析和连锁分析在解析数量性状方面的优势互补第48页
     ·低深度重测序全基因组关联分析的优势和不足第48页
     ·玉米农艺性状遠传基础的构成第48-50页
第四章 通过转录组测序鉴定不同氮素水平条件下基因型与环境互作表达差异基因第50-61页
   ·前言第50-51页
   ·材料与方法第51-53页
     ·田间试验及样品的采集第51页
     ·RNA测序及序列分析第51页
     ·基因差异表达分析第51-52页
     ·G×E互作基因GO条目注释及基因富集分析第52-53页
   ·结果与分析第53-60页
     ·不同氮水平条件下两个材料的表型差异第53-54页
     ·转录组测序数据的比对和分析第54页
     ·G×E互作基因的鉴定及其表达模式分析第54-58页
     ·G×E互作基因的功能特点第58-60页
   ·主要结果与讨论第60-61页
参考文献第61-68页
致谢第68-70页
附录第70-100页
个人简历第100-101页

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