致谢 | 第1-6页 |
摘要 | 第6-7页 |
ABSTRACT | 第7-8页 |
专业词汇中英文对照表 | 第8-11页 |
第1章 绪论 | 第11-19页 |
·干细胞研究综述 | 第11-12页 |
·干细胞概念与分类 | 第11页 |
·干细胞相关研究与应用 | 第11-12页 |
·胚胎干细胞向造血干细胞定向分化的研究进展 | 第12-19页 |
·体外诱导分化造血干细胞转录调控机制的研究 | 第12-13页 |
·RUNX1参与正常造血系统形成 | 第13-15页 |
·RUNX1a可变剪切体在早期造血干细胞形成中的作用 | 第15-19页 |
第2章 研究目的与策略 | 第19-23页 |
·课题研究目的 | 第19-20页 |
·异位表达RUNX1a促进造血干细胞生成分子机制研究 | 第19页 |
·异位表达RUNX1a造血基础研究有助于将来应用于临床 | 第19-20页 |
·课题研究策略 | 第20-23页 |
·早期造血发生关键时间点样本选取 | 第20页 |
·应用高通量测序技术研究转录组变化趋势 | 第20页 |
·技术路线流程图 | 第20-23页 |
第3章 分析方法 | 第23-27页 |
·ChIP-seq技术 | 第23页 |
·Bowtie序列比对工具 | 第23页 |
·MACS寻找DNA结合位点(peak)工具 | 第23页 |
·基因注释 | 第23-24页 |
·RNA-seq技术 | 第24页 |
·Tophat序列对比工具 | 第24页 |
·Cuffdiff差异基因分析工具 | 第24页 |
·GO基因注释及KEGG通路分析 | 第24页 |
·IPA挖掘通路信息 | 第24页 |
·转录因子调控网络构建 | 第24-25页 |
·Metacore数据库 | 第25-27页 |
第4章 结果与讨论 | 第27-50页 |
·RUNX1a全基因组靶向定位分析 | 第27-33页 |
·RUNX1a ChIP-seq数据基础分析 | 第27-29页 |
·RUNX1a靶基因功能及通路富集 | 第29-33页 |
·异位表达RUNX1a不同时间点转录组数据分析 | 第33页 |
·RUNX1a RNA-seq数据基础分析 | 第33-37页 |
·RNA-seq分析得出RUNX1a调控基因 | 第36-37页 |
·异位表达RUNX1a转录调控机制的探索 | 第37-50页 |
·造血发育早期不同时间点特异性调控网络构建 | 第37-43页 |
·异位表达RUNX1a动态时序性功能变化 | 第43-45页 |
·早期造血干细胞发育相关转录因子变化趋势 | 第45-46页 |
·异位表达RUNX1a信号通路的变化 | 第46-50页 |
第5章 结论 | 第50-53页 |
参考文献 | 第53-59页 |
附录 | 第59-61页 |
作者简介及在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第61页 |