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转录因子RUNX1a调控胚胎干细胞造血定向分化机制研究

致谢第1-6页
摘要第6-7页
ABSTRACT第7-8页
专业词汇中英文对照表第8-11页
第1章 绪论第11-19页
   ·干细胞研究综述第11-12页
     ·干细胞概念与分类第11页
     ·干细胞相关研究与应用第11-12页
   ·胚胎干细胞向造血干细胞定向分化的研究进展第12-19页
     ·体外诱导分化造血干细胞转录调控机制的研究第12-13页
     ·RUNX1参与正常造血系统形成第13-15页
     ·RUNX1a可变剪切体在早期造血干细胞形成中的作用第15-19页
第2章 研究目的与策略第19-23页
   ·课题研究目的第19-20页
     ·异位表达RUNX1a促进造血干细胞生成分子机制研究第19页
     ·异位表达RUNX1a造血基础研究有助于将来应用于临床第19-20页
   ·课题研究策略第20-23页
     ·早期造血发生关键时间点样本选取第20页
     ·应用高通量测序技术研究转录组变化趋势第20页
     ·技术路线流程图第20-23页
第3章 分析方法第23-27页
   ·ChIP-seq技术第23页
   ·Bowtie序列比对工具第23页
   ·MACS寻找DNA结合位点(peak)工具第23页
   ·基因注释第23-24页
   ·RNA-seq技术第24页
   ·Tophat序列对比工具第24页
   ·Cuffdiff差异基因分析工具第24页
   ·GO基因注释及KEGG通路分析第24页
   ·IPA挖掘通路信息第24页
   ·转录因子调控网络构建第24-25页
   ·Metacore数据库第25-27页
第4章 结果与讨论第27-50页
   ·RUNX1a全基因组靶向定位分析第27-33页
     ·RUNX1a ChIP-seq数据基础分析第27-29页
     ·RUNX1a靶基因功能及通路富集第29-33页
   ·异位表达RUNX1a不同时间点转录组数据分析第33页
   ·RUNX1a RNA-seq数据基础分析第33-37页
     ·RNA-seq分析得出RUNX1a调控基因第36-37页
   ·异位表达RUNX1a转录调控机制的探索第37-50页
     ·造血发育早期不同时间点特异性调控网络构建第37-43页
     ·异位表达RUNX1a动态时序性功能变化第43-45页
     ·早期造血干细胞发育相关转录因子变化趋势第45-46页
     ·异位表达RUNX1a信号通路的变化第46-50页
第5章 结论第50-53页
参考文献第53-59页
附录第59-61页
作者简介及在学期间发表的学术论文与研究成果第61页

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