木薯BAC-pooling策略模拟与功能分析
| 致谢 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 专业词汇中英文对照表 | 第10-11页 |
| 目录 | 第11-13页 |
| 图目录 | 第13-14页 |
| 表目录 | 第14-15页 |
| 第一章 绪论 | 第15-21页 |
| ·引言 | 第15-20页 |
| ·测序技术简介 | 第15-16页 |
| ·植物基因组学研究 | 第16页 |
| ·BAC-pooling测序策略简介 | 第16-19页 |
| ·木薯基因组学研究进展 | 第19-20页 |
| ·本文主要工作内容 | 第20-21页 |
| 第二章 木薯BAC-pooling策略模拟与分析 | 第21-39页 |
| ·简介 | 第21页 |
| ·材料与方法 | 第21-23页 |
| ·试剂与耗材 | 第21页 |
| ·DNA提取流程 | 第21-22页 |
| ·上机测序 | 第22-23页 |
| ·测序结果 | 第23-26页 |
| ·测序数据 | 第23页 |
| ·数据预处理 | 第23-26页 |
| ·模拟与分析 | 第26-37页 |
| ·数据模拟处理软件、模拟流程与方法 | 第26-29页 |
| ·木薯BAC-pooling策略模拟结果分析 | 第29-37页 |
| ·讨论与小结 | 第37-39页 |
| 第三章 木薯BAC基因组功能分析 | 第39-49页 |
| ·研究背景 | 第39页 |
| ·材料与方法 | 第39-42页 |
| ·数据来源与数据处理 | 第39-40页 |
| ·木薯BAC基因组序列组装 | 第40页 |
| ·长插入片段库的数据预处理与序列组装 | 第40-41页 |
| ·注释软件及流程图 | 第41-42页 |
| ·长插入片段库影响分析 | 第42-44页 |
| ·木薯BAC序列组装结果注释 | 第44-46页 |
| ·基因组注释结果比较分析 | 第46-48页 |
| ·小结 | 第48-49页 |
| 第四章 总结 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-57页 |
| 附录 | 第57-69页 |
| 附录1 | 第57-60页 |
| 附录2 | 第60-69页 |
| 作者简介及在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第69页 |