| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-23页 |
| ·高通量转录组测序研究概述 | 第9-12页 |
| ·基本原理和流程 | 第10页 |
| ·数据分析和应用 | 第10-12页 |
| ·分子标记技术的研究概述 | 第12-15页 |
| ·分子标记技术导论和特点 | 第12页 |
| ·分子标记技术的类型 | 第12-15页 |
| ·SNP 标记研究进展 | 第15-23页 |
| ·SNP 标记技术的原理 | 第15页 |
| ·SNP 标记的检测方法 | 第15-20页 |
| ·SNP 标记在水产动物中的应用 | 第20-23页 |
| 第二章 大菱鲆 SNP 标记的开发和多态性分析 | 第23-43页 |
| ·实验材料 | 第24-26页 |
| ·主要设备与仪器 | 第24页 |
| ·主要试剂 | 第24-25页 |
| ·实验样本 | 第25-26页 |
| ·实验方法 | 第26-31页 |
| ·转录组测序 | 第26-27页 |
| ·SNP 位点的筛选 | 第27-28页 |
| ·基因组 DNA 提取及检测 | 第28页 |
| ·小片段法引物的设计 | 第28页 |
| ·PCR 反应体系优化 | 第28-29页 |
| ·引物验证 | 第29-30页 |
| ·PCR 扩增及变性 | 第30页 |
| ·HRM 法 SNP 分型 | 第30页 |
| ·SNP 位点多态性检测 | 第30-31页 |
| ·实验结果 | 第31-41页 |
| ·转录组结果分析 | 第31-32页 |
| ·模板 DNA 的制备 | 第32页 |
| ·PCR 反应体系优化结果 | 第32-33页 |
| ·引物检测结果 | 第33页 |
| ·小片段法 HRM 分型 | 第33-36页 |
| ·测序分析 | 第36-37页 |
| ·SNP 位点多态性分析 | 第37-38页 |
| ·SNP 位点序列的功能分析 | 第38-41页 |
| ·讨论 | 第41-43页 |
| 第三章 大菱鲆雌雄相关 SNP 标记筛选 | 第43-53页 |
| ·实验材料 | 第43-45页 |
| ·主要设备与仪器 | 第43-44页 |
| ·主要试剂 | 第44页 |
| ·实验样本 | 第44页 |
| ·SNP 引物 | 第44-45页 |
| ·实验方法 | 第45-47页 |
| ·基因组 DNA 提取及检测 | 第45页 |
| ·PCR 扩增及变性 | 第45-46页 |
| ·数据统计与统计分析 | 第46-47页 |
| ·实验结果 | 第47-51页 |
| ·DNA 模板检测 | 第47页 |
| ·各 SNP 位点的遗传多态性 | 第47-49页 |
| ·两个群体的遗传变化 | 第49页 |
| ·5 个 SNP 位点在雌性群体和雄性群体中的基因型分布频率差异 | 第49-51页 |
| ·讨论 | 第51-53页 |
| 第四章 大菱鲆 ATPase-α基因的全长 cDNA 克隆 | 第53-70页 |
| ·实验材料 | 第54-55页 |
| ·主要设备与仪器 | 第54页 |
| ·主要试剂 | 第54-55页 |
| ·实验样本 | 第55页 |
| ·实验方法 | 第55-61页 |
| ·大菱鲆组织获取 | 第55页 |
| ·总 RNA 的提取和检测 | 第55-56页 |
| ·ATPase-α cDNA 核心片段的克隆 | 第56-57页 |
| ·cDNA 第一链的合成 | 第57-59页 |
| ·3'-RACE 和 5'-RACE 引物设计 | 第59页 |
| ·3'-RACE 片段克隆和测序 | 第59-60页 |
| ·5'-RACE 片段克隆和测序 | 第60页 |
| ·ATPase-α基因的全长序列的拼接和分析 | 第60-61页 |
| ·实验结果 | 第61-68页 |
| ·总 RNA 质量检测 | 第61页 |
| ·核心片段克隆与测序结果 | 第61-62页 |
| ·cDNA 模板质量检测 | 第62页 |
| ·3'-RACE 片段克隆和测序结果 | 第62-63页 |
| ·5'-RACE 片段克隆和测序结果 | 第63-64页 |
| ·ATPase-α基因的全长序列的拼接和分析 | 第64-65页 |
| ·ATPase-α的氨基酸序列的分析 | 第65-68页 |
| ·讨论 | 第68-70页 |
| 参考文献 | 第70-76页 |
| 攻读硕士学位期间发表及参与的学术论文 | 第76-78页 |
| 致谢 | 第78-79页 |