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猪胚胎骨骼肌中基因间长非编码RNA的鉴定、特征及功能的初步分析

摘要第1-6页
Abstract第6-13页
第一章 文献综述第13-26页
   ·肌肉发育的分子基础第13页
   ·猪骨骼肌发育的研究进展第13-15页
     ·猪骨骼肌发育的生长过程第13-14页
     ·猪骨骼肌发育的研究现状第14-15页
   ·LNCRNA 的研究进展第15-22页
     ·lncRNA 的概述第15-16页
     ·lncRNA 的生物学功能第16-22页
   ·LNCRNA 在肌肉发育中的研究进展第22-24页
     ·Msx1 antisense RNA (Msx1-AS RNA)与肌细胞分化第22页
     ·Dnm3os 与肌肉发育第22页
     ·SRA RNA 与肌源发生第22页
     ·linc-MD1 与竞争性内源 RNA第22-23页
     ·GTL2 与肌肉肥大第23-24页
     ·half(1/2)-sbsRNAs 与 SMD第24页
   ·LNCRNA 在猪骨骼肌发育中的研究现状第24-25页
   ·研究的目的与意义第25-26页
第二章 猪胚胎骨骼肌中 LINCRNA 的鉴定与分子特征分析第26-43页
   ·前言第26页
   ·试验材料与实验方法第26-30页
     ·试验动物及样本第26页
     ·主要仪器与试剂耗材第26-27页
     ·RNA 提取第27页
     ·DNaseI 处理及 RNA 纯化第27-28页
     ·RNA 反转录第28页
     ·荧光定量 PCR(qPCR)第28-29页
     ·DNA 纯化与回收第29页
     ·连接转化第29页
     ·菌液 PCR 鉴定测序第29-30页
   ·LINCRNA 分析流程第30-33页
     ·测序流程简介第30页
     ·转录本组装第30页
     ·lincRNA 过滤流程第30-33页
   ·LINCRNA 的分子特征分析第33-34页
     ·lincRNA 序列的保守性分析第33页
     ·lincRNA 的重复序列分析第33页
     ·lincRNA 两侧蛋白编码基因的 Gene Ontology 分析第33页
     ·lincRNA 在肌肉发育中的表达分析第33-34页
   ·结果与分析第34-40页
     ·lincRNA 的鉴定结果第34-37页
     ·lincRNA 序列的保守性分析第37页
     ·lincRNA 的重复序列分析第37-38页
     ·lincRNA 两侧蛋白编码基因的 Gene Ontology 分析第38-40页
     ·lincRNA 基因在肌肉发育中的表达分析第40页
   ·讨论第40-43页
第三章 LINCRNA 在肌肉发育中功能的初步研究第43-67页
   ·前言第43页
   ·试验材料和方法第43-50页
     ·试验材料第43页
     ·主要仪器和试剂耗材第43-44页
     ·细胞培养第44-45页
     ·siRNA 设计第45页
     ·细胞转染第45页
     ·RNA 提取、纯化及反转录第45-46页
     ·荧光定量 PCR(qPCR)第46-47页
     ·cDNA3 末端快速扩增(3’RACE)第47-48页
     ·细胞核和细胞质 RNA 提取第48页
     ·RNA 免疫共沉淀(RIP)第48-50页
   ·结果第50-65页
     ·保守 lincRNA 的结构信息第50-53页
     ·猪 CUFF.8631 基因在肌肉发育中的表达分析第53-54页
     ·小鼠 ENSMUSG00000090086 基因在 C2C12 细胞分化中的表达情况第54-57页
     ·iso1 和 iso4 转录本的 3 末端结构第57-59页
     ·iso1 和 iso4 转录本在肌肉发育中的表达分析第59-60页
     ·RNA 干扰 iso1 和 iso4 对肌细胞分化标记基因的影响第60-62页
     ·iso1 和 iso4 转录本在细胞内的表达分布第62-63页
     ·iso1 和 iso4 转录本与 PRC2 蛋白的关系第63-65页
   ·讨论第65-67页
第四章 DNA 甲基化对小鼠 LINCRNA 的表达调控第67-77页
   ·前言第67页
   ·试验材料和方法第67-69页
     ·主要仪器和试剂第67页
     ·c2c12 细胞分化的基因组第67页
     ·小鼠 lincRNA 基因转录上游片段甲基化检测第67-69页
     ·5-Aza-dc 处理 c2c12 细胞第69页
     ·RNA 提取、纯化及反转录第69页
     ·荧光定量 PCR(qPCR)第69页
   ·结果第69-75页
     ·c2c12 细胞分化的 DNA 提取第69-70页
     ·iso1 和 iso4 转录上游的 CpG 岛区域第70页
     ·iso1 和 iso4 转录上游的 CpG 岛扩增第70-71页
     ·iso1 和 iso4 转录上游的 CpG 岛甲基化状态第71-74页
     ·5-Aza-dc 处理 c2c12 细胞后 iso1 和 iso4 的表达量变化第74-75页
   ·讨论第75-77页
第五章 全文结论第77-78页
 主要结论第77页
 主要创新点第77-78页
参考文献第78-90页
致谢第90-91页
作者简历第91-92页
附录第92-97页

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