| 摘要 | 第1-11页 |
| Abstract | 第11-14页 |
| 缩略词表 | 第14-15页 |
| 1 绪论 | 第15-25页 |
| ·前言 | 第15-16页 |
| ·系统生物学与基因网络生物学 | 第16-23页 |
| ·系统生物学的定义 | 第16-17页 |
| ·生物网络类型 | 第17-21页 |
| ·生物网络的获取方法 | 第21页 |
| ·生物网络的特征 | 第21-22页 |
| ·生物网络在后基因组时代的应用 | 第22-23页 |
| ·本文的研究内容与创新 | 第23-24页 |
| ·本文的内容写作安排 | 第24-25页 |
| 2 免疫基因网络的构建、评估 | 第25-41页 |
| ·前言 | 第25-27页 |
| ·问题的由来 | 第25-26页 |
| ·免疫基因网络概述 | 第26页 |
| ·免疫基因网络建立的假设 | 第26-27页 |
| ·免疫基因网络的作用、目的及意义 | 第27页 |
| ·材料与方法 | 第27-28页 |
| ·生物网络数据 | 第27页 |
| ·免疫基因数据 | 第27页 |
| ·免疫基因网络的构建 | 第27-28页 |
| ·免疫基因网络的评估 | 第28页 |
| ·实验结果 | 第28-41页 |
| ·互作数据的收集与整理 | 第28-30页 |
| ·免疫基因的收集与整理 | 第30-32页 |
| ·免疫基因网络的构建 | 第32页 |
| ·免疫基因网络的评估 | 第32-36页 |
| ·免疫基因网络的分子组成 | 第33-34页 |
| ·免疫基因网络的拓扑学结构评估 | 第34-36页 |
| ·免疫基因网络的可靠性和全面性评估 | 第36-41页 |
| 3 免疫基因网络应用于高通量表达谱基因芯片 | 第41-50页 |
| ·前言 | 第41-42页 |
| ·问题的由来 | 第41页 |
| ·文献综述 | 第41-42页 |
| ·实验材料与方法 | 第42-43页 |
| ·实验动物群体及设计 | 第42-43页 |
| ·实验材料 | 第43页 |
| ·试验方法 | 第43页 |
| ·实验结果 | 第43-50页 |
| ·差异表达基因分析 | 第43-46页 |
| ·基因集富集分析(GSEA) | 第46-50页 |
| 4 免疫基因网络应用于猪外周血淋巴细胞亚型全基因组关联分析(GWAS)和转录组芯片的整合分析研究 | 第50-80页 |
| ·前言 | 第50-54页 |
| ·问题的由来 | 第50页 |
| ·关于血液表型的GWAS研究综述 | 第50-51页 |
| ·T淋巴细胞及亚群在临床诊断当中的应用 | 第51-53页 |
| ·关于淋巴细胞的全基因组关联分析(GWAS)进展 | 第53页 |
| ·全基因组关联分析进展及碰到的问题 | 第53-54页 |
| ·实验材料与方法 | 第54-56页 |
| ·实验动物群体及设计 | 第54页 |
| ·试验材料 | 第54-55页 |
| ·全基因组SNP数据 | 第54页 |
| ·T细胞亚型表型数据 | 第54-55页 |
| ·GWAS结果极端个体的表达谱芯片 | 第55页 |
| ·实验方法 | 第55-56页 |
| ·全基因组关联分析的方法 | 第55页 |
| ·表达谱芯片分析 | 第55页 |
| ·致因网络的构建 | 第55页 |
| ·致因网络应用与表达谱芯片分析 | 第55-56页 |
| ·实验结果 | 第56-80页 |
| ·PolyI：C刺激前后T细胞亚型表型的变化 | 第56-57页 |
| ·各类型细胞表型的GWAS结果 | 第57-76页 |
| ·T淋巴细胞亚型细胞的GWAS结果 | 第58-68页 |
| ·CD4 T细胞与CD8 T细胞比率的GWAS分析结果 | 第68-75页 |
| ·非T淋巴细胞亚型的分析结果 | 第75-76页 |
| ·区域内候选基因致因网络的构建 | 第76-77页 |
| ·GWAS显著区间内候选基因的网络分析 | 第77-80页 |
| 5 讨论 | 第80-85页 |
| 6 小结 | 第85-86页 |
| 参考文献 | 第86-96页 |
| 攻读学位期间撰写论文题录 | 第96-97页 |
| 致谢 | 第97-98页 |