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粪类圆线虫两个不同发育阶段microRNAs转录组的鉴定

摘要第1-8页
Abstract第8-10页
缩略语表第10-11页
1 文献综述第11-27页
   ·粪类圆线虫介绍第11-13页
     ·粪类圆线虫生活史第11-13页
     ·粪类圆线虫的危害第13页
   ·microRNAs介绍第13-27页
     ·microRNA的生成机制第14-16页
     ·microRNA的作用机制第16-17页
     ·microRNA的鉴定及研究方法第17-18页
     ·microRNA的功能研究第18-21页
     ·microRNA在寄生虫中的研究进展第21-27页
2 研究的目的和意义第27-28页
3 材料与方法第28-41页
   ·试验材料第28-31页
     ·试验动物第28页
     ·菌种和质粒第28-29页
     ·酶和主要试剂第29页
     ·主要溶液的配制第29-30页
     ·主要仪器和设备第30-31页
   ·试验方法第31-41页
     ·粪类圆线虫寄生后一期和感染期三期幼虫的总RNA的获取第31-32页
     ·粪类圆线虫寄生后一期和三期幼虫的小RNA文库建立和高通量测序第32-33页
     ·粪类圆线虫测序数据的原始处理第33-34页
     ·粪类圆线虫测序数据的特征分析第34-37页
     ·粪类圆线虫寄生后一期和三期幼虫的miRNA分析结果验证第37-41页
4 结果与分析第41-57页
   ·粪类圆线虫ppL1和iL3的收集第41页
   ·粪类圆线虫ppL1和iL3的RNA提取第41-42页
   ·粪类圆线虫ppL1和iL3的RNA测序结果第42-45页
     ·测序数据概述第42-43页
     ·其他类型RNA的滤过第43-44页
     ·序列长度的分布统计第44-45页
   ·粪类圆线虫ppL1和iL3的测序数据的深度分析第45-57页
     ·粪类圆线虫测序数据分析第45-49页
     ·粪类圆线虫ppL1和iL3的miRNAs差异分析结果第49-51页
     ·stem-loop PCR对部分miRNAs表达结果验证第51-53页
     ·进化分析第53页
     ·靶基因预测第53-57页
5 讨论第57-62页
   ·粪类圆线虫不同时期的测序质量第57页
   ·粪类圆线虫不同时期miRNAs长度的分布特征第57-58页
   ·粪类圆线虫保守miRNA作为分子进化标志的发掘第58页
   ·粪类圆线虫保守miRNA基因簇和miRNA~*第58-59页
   ·粪类圆线虫miRNA靶点分布第59-60页
   ·粪类圆线虫两个不同时期miRNA转录组表达差异第60-62页
结论第62-63页
参考文献第63-74页
致谢第74-76页
附录第76-84页

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