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外来植物小冠花根瘤菌多样性及系统发育研究

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-13页
第一章 文献综述第13-43页
   ·引言第13-14页
   ·根瘤菌的发现及分类第14-20页
     ·根瘤菌的发现第14页
     ·根瘤菌的分类第14-18页
     ·现有根瘤菌属的简介第18-20页
   ·根瘤菌的多样性第20-29页
     ·生物多样性第20-21页
     ·根瘤菌表型多样性及研究方法第21-24页
     ·根瘤菌遗传多样性及研究方法第24-29页
   ·环境因子对根瘤菌多样性的影响第29-33页
     ·土壤水分缺乏第30页
     ·土壤盐胁迫第30-31页
     ·土壤 pH第31页
     ·高温和热胁迫第31页
     ·土壤肥力第31-32页
     ·重金属第32页
     ·土壤管理措施第32-33页
   ·外来植物及其入侵第33-39页
     ·外来入侵植物的概念第33页
     ·外来入侵植物的危害第33-35页
     ·外来植物入侵的机制第35-37页
     ·根瘤菌共生与豆科植物入侵第37-39页
   ·小冠花及其根瘤菌研究概况第39-42页
     ·小冠花的植物学特性第39-40页
     ·小冠花的应用价值第40-41页
     ·小冠花根瘤菌第41-42页
     ·小冠花的入侵性第42页
   ·本研究的立题和研究意义第42-43页
第二章 试验内容与方法第43-55页
   ·根瘤的采集第43页
   ·土壤的采集及土壤成分分析第43-44页
   ·根瘤菌的分离和纯化第44页
     ·根瘤菌的分离第44页
     ·根瘤菌的纯化第44页
     ·根瘤菌的染色和镜检第44页
   ·回接试验第44-45页
     ·种子硬实处理及表面消毒第44-45页
     ·种子催芽第45页
     ·回接试管的制备第45页
     ·菌悬液的制备第45页
     ·接种和培养第45页
     ·观察记录第45页
   ·表型特征分析第45-48页
     ·对 NaCl 的抗性(1-5)第45-46页
     ·对抗生素的抗性(6-25)第46页
     ·对化学药物的抗性(26-29)第46页
     ·对染料的抗性(30-49)第46页
     ·耐酸碱性(50-55)第46页
     ·对重金属的抗性(56-80)第46-47页
     ·唯一氮源利用(81-96)第47页
     ·唯一碳源利用(97-114)第47页
     ·生长温度测定(115-118)第47页
     ·过氧化氢酶测定(119)第47-48页
     ·氧化酶测定(120)第48页
     ·肉质蛋白胨生长反应(121)第48页
     ·产酸产碱反应(122-123)第48页
   ·总 DNA 的提取第48-50页
     ·提取用的主要试剂第48页
     ·提取用的主要仪器第48页
     ·提取过程第48-50页
   ·16S rRNA PCR-RFLP 分析第50-51页
     ·扩增引物第50页
     ·反应体系第50页
     ·反应程序第50页
     ·16S rRNA 扩增片段的检测第50-51页
     ·16S rRNA 的酶切及图谱分析第51页
     ·16S rRNA 全序列测定及分析第51页
   ·持家基因 recA 的分析第51-52页
     ·recA 基因的扩增引物第51页
     ·recA 基因的反应体系第51页
     ·recA 基因的反应程序第51-52页
     ·recA 基因扩增产物的检测第52页
     ·recA 基因的全序列测定及分析第52页
   ·结瘤基因 nodC PCR-RFLP 分析第52-53页
     ·结瘤基因 nodC 的扩增引物第52页
     ·nodC 的反应体系第52页
     ·nodC 扩增的程序第52页
     ·nodC 扩增产物的检测第52页
     ·nodC 的酶切及图谱分析第52页
     ·nodC 全序列测定及分析第52-53页
   ·固氮基因 nifH PCR-RFLP 分析第53页
     ·固氮基因 nifH 的扩增引物第53页
     ·nifH 的反应体系第53页
     ·nifH 扩增的程序第53页
     ·nifH 扩增产物的检测第53页
     ·nifH 的酶切及图谱分析第53页
     ·nifH 全序列测定及分析第53页
   ·小冠花根瘤菌多样性与土壤因子相关性分析第53-55页
     ·多样性分析第53-54页
     ·相关性分析第54-55页
第三章 结果与分析第55-77页
   ·回接试验结果与分析第55页
   ·表型特征结果与分析第55-58页
     ·对 NaCl 的抗性第55-56页
     ·对抗生素的抗性第56页
     ·对化学药物的抗性第56页
     ·对染料的抗性第56页
     ·耐酸碱性第56-57页
     ·对重金属的抗性第57页
     ·唯一氮源利用第57页
     ·唯一碳源利用第57页
     ·生长温度第57页
     ·过氧化氢酶测定第57页
     ·氧化酶测定第57页
     ·肉质蛋白胨生长反应第57-58页
     ·产酸产碱反应第58页
   ·16S rRNA PCR-RFLP 结果与分析第58-63页
     ·16S rRNA PCR 扩增结果第58页
     ·16S rRNA RFLP 酶切电泳结果第58-60页
     ·16S rRNA RFLP 遗传分析第60-61页
     ·16S rRNA 全序列系统发育树第61-63页
   ·持家基因 recA 的结果与分析第63-64页
     ·recA 的 PCR 扩增结果第63页
     ·recA 基因全序列系统发育分析第63-64页
   ·结瘤基因 nodC PCR-RFLP 结果与分析第64-69页
     ·小冠花根瘤菌 nodC 的 PCR 扩增结果第64-65页
     ·小冠花根瘤菌 nodC RFLP 酶切电泳结果第65-67页
     ·小冠花根瘤菌 nodC RFLP 遗传分析第67-68页
     ·小冠花根瘤菌 nodC 基因全序列系统发育树第68-69页
   ·固氮基因 nifH PCR-RFLP 结果与分析第69-74页
     ·小冠花根瘤菌 nifH 的 PCR 扩增结果第69-70页
     ·小冠花根瘤菌 nifH RFLP 酶切电泳结果第70-72页
     ·小冠花根瘤菌 nifH RFLP 遗传分析第72-73页
     ·小冠花根瘤菌 nifH 基因全序列系统发育树第73-74页
   ·小冠花根瘤菌 16S rRNA 多样性与土壤因子的相关性分析第74-77页
     ·不同地点的小冠花根瘤菌 16S rRNA 多样性分析第74-75页
     ·小冠花根瘤菌 16S rRNA 多样性与土壤因子的相关性分析第75-77页
第四章 讨论、结论与创新点第77-83页
   ·讨论第77-81页
     ·环境因素与抗逆根瘤菌种质资源的筛选第77-78页
     ·小冠花根瘤菌的多样性第78页
     ·小冠花根瘤菌共生基因的转移与进化第78-79页
     ·土壤 pH 与小冠花根瘤菌多样性第79-80页
     ·根瘤菌共生对豆科植物入侵的影响第80-81页
   ·结论第81-82页
   ·创新点第82-83页
参考文献第83-101页
缩略词第101-102页
致谢第102-103页
作者简介第103页

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