| 摘要 | 第1-11页 |
| Abstract | 第11-14页 |
| 第一章 前言 | 第14-25页 |
| 1 土壤理化性质与微生物的关系 | 第14-16页 |
| ·土壤理化性质对微生物多样性的影响 | 第14页 |
| ·土壤理化性质对微生物活性的影响 | 第14-15页 |
| ·土壤理化性质对微生物量的影响 | 第15-16页 |
| 2 土壤微生物的研究方法 | 第16-21页 |
| ·传统的微生物培养法 | 第16页 |
| ·可培养分子生物学方法 | 第16-18页 |
| ·扩增片段长度多态性 | 第16-17页 |
| ·随即扩增多态性DNA | 第17页 |
| ·扩增片段长度多态性 | 第17-18页 |
| ·基因组简单重复序列PCR标记 | 第18页 |
| ·免培养分子生物学方法 | 第18-21页 |
| ·变性梯度凝胶电脉(DGGE) | 第18-19页 |
| ·单链构象多态性分析(SSCP) | 第19-20页 |
| ·核糖体间隔基因自动分析(ARISA) | 第20页 |
| ·末端限制性片段长度多样性(T-RFLP) | 第20-21页 |
| ·长度多态性片段PCR(LH-PCR) | 第21页 |
| 3 烟草土壤微生物研究进展 | 第21-24页 |
| ·根际及根际微生物 | 第21-22页 |
| ·烟草根际土壤采集 | 第22页 |
| ·烟草根际微生物研究进展 | 第22-23页 |
| ·烟草根际微生物数量 | 第23页 |
| ·烟草根际优势微生物种群 | 第23-24页 |
| 4 研究目的与意义 | 第24-25页 |
| 第二章 土壤理化性质对部分微生物特性的影响 | 第25-34页 |
| 1. 材料与方法 | 第25-26页 |
| ·样品采集 | 第25页 |
| ·土壤理化性质的分析 | 第25-26页 |
| ·土壤微生物生物量碳分析 | 第26页 |
| ·土壤真菌生物量分析 | 第26页 |
| ·土壤酶活性的测定 | 第26页 |
| ·数据处理 | 第26页 |
| 2 结果与分析 | 第26-31页 |
| ·烟草土壤理化性质分析 | 第26-28页 |
| ·微生物学特性分析 | 第28-29页 |
| ·土壤理化性质对微生物学特性的影响 | 第29-31页 |
| ·典型对应分析 | 第29-30页 |
| ·多元回归树分析 | 第30-31页 |
| 3. 讨论与结论 | 第31-34页 |
| ·理化特性在烟草土壤中的表现 | 第31-32页 |
| ·微生物特性对根际效应的响应 | 第32页 |
| ·理化性质对微生物特性的影响 | 第32-33页 |
| ·小结 | 第33-34页 |
| 第三章 烟草种植对可培养微生物数量、群落结构及多样性影响 | 第34-67页 |
| 1. 材料与方法 | 第34-38页 |
| ·可培养微生物数量分析 | 第34页 |
| ·可培养细菌遗传多样性分析 | 第34-35页 |
| ·供试菌株DNA提取 | 第34页 |
| ·细菌16S rDNA PCR-RFLP指纹图谱分析 | 第34-35页 |
| ·代表菌株16S rDNA序列测序分析 | 第35页 |
| ·可培养放线菌遗传多样性分析 | 第35-36页 |
| ·供试菌株DNA的提取 | 第35页 |
| ·放线菌16S rDNA PCR-RFLP指纹图谱分析 | 第35-36页 |
| ·代表菌株16S rDNA序列测序 | 第36页 |
| ·可培养真菌遗传多样性分析 | 第36-37页 |
| ·供试菌株DNA的提取 | 第36-37页 |
| ·真菌18S rDNA PCR-RFLP指纹图谱分析 | 第37页 |
| ·代表菌株18S rDNA序列测序分析 | 第37页 |
| ·可培养固氮菌遗传多样性分析 | 第37-38页 |
| ·供试菌株DNA的提取 | 第37页 |
| ·固氮菌16S rDNA PCR-RFLP指纹图谱分析 | 第37-38页 |
| ·代表菌株16S rDNA序列测序分析 | 第38页 |
| ·数据分析和处理 | 第38页 |
| 2 结果与分析 | 第38-62页 |
| ·土壤环境因子对微生物数量的影响 | 第38-40页 |
| ·可培养微生物数量分析 | 第38-39页 |
| ·环境因子对微生物数量的影响 | 第39-40页 |
| ·可培养细菌遗传多样性 | 第40-46页 |
| ·16S rDNA PCR-RFLP酶切聚类分析 | 第40-43页 |
| ·16S rDNA PCR-RFLP主成分分析 | 第43-44页 |
| ·代表菌株16S rDNA基因序列分析 | 第44-46页 |
| ·可培养放线菌遗传多样性 | 第46-52页 |
| ·16S rDNA RFLP酶切聚类分析 | 第46-49页 |
| ·16S rDNA RFLP主成分分析 | 第49-50页 |
| ·代表菌株16S rDNA序列分析 | 第50-52页 |
| ·可培养真菌遗传多样性 | 第52-57页 |
| ·可培养真菌PCR-RFLP酶切聚类分析 | 第52-54页 |
| ·真菌18S rDNA PCR-RFLP主成分分析 | 第54-55页 |
| ·代表菌株18S rDNA序列分析 | 第55-57页 |
| ·可培养固氮菌遗传多样性 | 第57-62页 |
| ·16S rDNA PCR-RFLP酶切聚类分析 | 第57-60页 |
| ·16S rDNA PCR-RFLP主成分分析 | 第60-61页 |
| ·代表菌株16S rDNA序列分析 | 第61-62页 |
| 3 讨论与结论 | 第62-67页 |
| ·烟草种植对微生物数量的影响 | 第62-63页 |
| ·烟草种植对可培养细菌的影响 | 第63-64页 |
| ·烟草种植对可培养放线菌的影响 | 第64页 |
| ·烟草种植对可培养真菌的影响 | 第64-65页 |
| ·烟草种植对可培养固氮细菌的影响 | 第65-66页 |
| ·小结 | 第66-67页 |
| 第四章 烟草种植对免培养微生物群落结构及多样性的影响 | 第67-137页 |
| 1 材料与方法 | 第67-74页 |
| ·土壤总DNA的提取与纯化 | 第67页 |
| ·运用DGGE分析土壤微生物群落结构 | 第67-72页 |
| ·细菌16S rDNA的扩增 | 第67页 |
| ·放线菌16S rDNA的扩增 | 第67-68页 |
| ·真菌18S rDNA的扩增 | 第68页 |
| ·真菌ITS rDNA的扩增 | 第68-69页 |
| ·AM真菌18S rDNA扩增 | 第69-70页 |
| ·nifH基因的扩增 | 第70页 |
| ·硝化细菌16S rDNA的扩增 | 第70-71页 |
| ·PCR产物检测 | 第71页 |
| ·PCR产物的变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析 | 第71-72页 |
| ·DGGE优势及特异条带的回收分析 | 第72页 |
| ·运用LH-PCR分析土壤细菌群落结构 | 第72-73页 |
| ·土壤细菌PCR扩增 | 第72页 |
| ·分子标准的制作 | 第72-73页 |
| ·毛细管电泳 | 第73页 |
| ·数据分析与处理 | 第73-74页 |
| ·DGGE数据分析 | 第73-74页 |
| ·LH-PCR数据分析 | 第74页 |
| ·方差及统计分析 | 第74页 |
| 2 结果与分析 | 第74-129页 |
| ·烟草种植对免培养细菌的影响 | 第74-87页 |
| ·细菌DGGE图谱群落结构 | 第74-76页 |
| ·细菌DGGE图谱多样性 | 第76-77页 |
| ·细菌DGGE代表条带序列分析 | 第77-79页 |
| ·环境因子对DGGE细菌多样性的影响 | 第79-81页 |
| ·细菌LH-PCR图谱群落结构 | 第81-83页 |
| ·细菌LH-PCR多样性 | 第83-84页 |
| ·环境因子对细菌LH-PCR多样性的影响 | 第84-85页 |
| ·环境因子对免培养细菌多样性的影响 | 第85-87页 |
| ·烟草种植对放菌菌群落结构及多样性的影响 | 第87-93页 |
| ·放线菌群落结构分析 | 第87-89页 |
| ·放线菌DGGE图谱多样性 | 第89页 |
| ·放线菌DGGE代表条带序列分析 | 第89-91页 |
| ·环境因子对免培养放线菌多样性的影响 | 第91-93页 |
| ·烟草种植对免培养真菌群落结构与多样性的影响 | 第93-108页 |
| ·真菌18S基因群落结构分析 | 第93-95页 |
| ·真菌18S基因多样性分析 | 第95页 |
| ·真菌18S基因DGGE代表条带序列分析 | 第95-98页 |
| ·环境因子对真菌18S基因多样性的影响 | 第98-100页 |
| ·真菌ITS基因群落结构分析 | 第100-102页 |
| ·真菌ITS基因多样性分析 | 第102页 |
| ·真菌ITS基因DGGE代表条带序列分析 | 第102-105页 |
| ·环境因子对真菌ITS基因多样性的影响 | 第105-107页 |
| ·环境因子对免培养真菌多样性的影响 | 第107-108页 |
| ·烟草种植对nifH基因群落结构及多样性的影响 | 第108-115页 |
| ·nifH基因群落结构分析 | 第108-110页 |
| ·nifH基因多样性分析 | 第110-111页 |
| ·nifH基因代表条带序列分析 | 第111-113页 |
| ·环境因子对nifH洲基因多样性的影响 | 第113-115页 |
| ·硝化细菌多样性及环境因子对其影响 | 第115-121页 |
| ·硝化细菌群落结构 | 第115-117页 |
| ·硝化细菌多样性分析 | 第117-118页 |
| ·硝化细菌代表条带序列分析 | 第118-119页 |
| ·环境因子对硝化细菌多样性的影响 | 第119-121页 |
| ·烟草种植对丛枝菌根真菌的影响 | 第121-128页 |
| ·丛枝菌根真菌群落结构分析 | 第121-123页 |
| ·丛枝菌根真菌多样性分析 | 第123页 |
| ·丛枝菌根真菌代表条带序列分析 | 第123-126页 |
| ·环境因子对丛枝菌根真菌多样性的影响 | 第126-128页 |
| ·环境因子对免培养微生物多样性的影响 | 第128-129页 |
| 3 讨论与结论 | 第129-137页 |
| ·烟草种植对免培养细菌的影响 | 第129-131页 |
| ·烟草种植对免培养放线菌的影响 | 第131页 |
| ·烟草种植对免培养真菌的影响 | 第131-132页 |
| ·烟草种植对免培养nifH基因的影响 | 第132-133页 |
| ·烟草种植对免培养硝化细菌的影响 | 第133页 |
| ·烟草种植对免培养丛枝菌根真菌的影响 | 第133-134页 |
| ·烟草种植对免培养总微生物的影响 | 第134-135页 |
| ·小结 | 第135-137页 |
| 第五章 综合成果、创新点与展望 | 第137-139页 |
| 1 研究成果 | 第137页 |
| 2 创新点 | 第137-138页 |
| 3 展望 | 第138-139页 |
| 参考文献 | 第139-149页 |
| 致谢 | 第149-150页 |
| 攻读博士学位期间发表论文情况 | 第150页 |
