Gluconobacter oxydans 621H全基因组自动注释结果的分析评估
| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 第一章 绪论 | 第7-17页 |
| ·基因组注释概况 | 第7页 |
| ·原核生物基因识别的发展 | 第7-9页 |
| ·基因识别的基本流程和方法 | 第8-9页 |
| ·评估基因起始位点识别的重要性 | 第9页 |
| ·国内外关于原核生物基因起始位点识别的研究进展 | 第9-13页 |
| ·通过算法识别起始位点的难点 | 第10页 |
| ·用于基因识别的工具概览 | 第10-12页 |
| ·基因识别中使用的蛋白质数据库 | 第12-13页 |
| ·本论文关于起始位点识别的工作 | 第13-14页 |
| ·氧化葡糖杆菌注释结果的分析评估 | 第13-14页 |
| ·制定评估基因起始位点的规则 | 第14页 |
| ·发展前景 | 第14-17页 |
| 第二章 材料与方法 | 第17-23页 |
| ·材料 | 第17-20页 |
| ·基因组数据 | 第17-18页 |
| ·基因组注释服务器 | 第18页 |
| ·综合微生物基因组(IMG) | 第18-19页 |
| ·快速注释系统（RAST） | 第19页 |
| ·合成基因组学(JCVI) | 第19-20页 |
| ·方法 | 第20-23页 |
| ·获取基因组注释数据 | 第20页 |
| ·三种注释服务器结果的分类比较 | 第20-21页 |
| ·利用同源性知识评估基因起始位点 | 第21-23页 |
| 第三章 结果与讨论 | 第23-42页 |
| ·注释基因的分布特征 | 第23-28页 |
| ·预测的编码基因比较 | 第23-26页 |
| ·三种服务器预测的基因的起始位点的比较 | 第26-28页 |
| ·利用同源性方法评估有争议起始位点的编码基因 | 第28-31页 |
| ·评估有争议起始位点基因的规则总结 | 第31-39页 |
| ·明显支持长版本对应的起始位点 | 第32-34页 |
| ·明显支持短版本对应的起始位点 | 第34-35页 |
| ·不支持短版本对应的起始位点 | 第35-36页 |
| ·倾向支持短版本对应的起始位点 | 第36页 |
| ·同源性建议完全不同的起始位点 | 第36-37页 |
| ·同源性证据不足以判断 | 第37-38页 |
| ·三种起始位点都不相同的序列同源比对 | 第38-39页 |
| ·遗漏基因的判断 | 第39-42页 |
| 主要结论与展望 | 第42-43页 |
| 致谢 | 第43-44页 |
| 参考文献 | 第44-49页 |
| 附录：作者在攻读硕士学位期间发表的论文 | 第49页 |
