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烟曲霉酸合成基因簇中后修饰基因的分析和应用研究

摘要第1-7页
Abstract第7-9页
缩略语对照表第9-15页
第1章 前言第15-29页
   ·甾体药物与甾型抗生素第15-21页
     ·甾体化合物、甾体药物与甾型抗生素第15-16页
     ·甾型抗生素第16-17页
     ·产烟曲霉酸真菌烟曲霉和金龟子绿僵菌第17-20页
       ·烟曲霉(Aspergillus fumigatus)第17-18页
       ·金龟子绿僵菌(Metarhizium anisopliae)第18页
       ·产甾型抗生素的丝状真菌对甾体药物的生物转化作用第18-20页
     ·烟曲霉酸的生物合成机制与合成基因簇第20-21页
     ·甾型抗生素的后修饰反应在甾体转化方面潜在的价值第21页
   ·甾体药物的微生物转化第21-27页
     ·微生物转化在甾体药物制备中的重要地位第21-22页
     ·甾体微生物转化反应第22-24页
       ·甾体微生物转化类型第22-23页
       ·重要甾体微生物转化反应举例第23-24页
     ·3-甾酮-Δ~1-脱氢酶(3-keto-Δ~1-dehydrogenase,KsdD)对甾体C1,2位的转化作用及其工业应用第24-27页
       ·3-甾酮-Δ~1-脱氢酶的简介第24-25页
       ·3-甾酮-Δ~1-脱氢酶的催化机理第25页
       ·3-甾酮-Δ~1-脱氢酶的异源表达第25-26页
       ·雄甾-4-烯-3,17-二酮和雄甾-1,4-二烯-3,17-二酮的研究进展第26-27页
   ·本课题的研究目的与内容第27-29页
第2章 金龟子绿僵菌基因簇的获取和基因功能分析第29-38页
   ·引言第29页
   ·实验材料第29-31页
     ·菌株与载体第29页
     ·培养基及实验试剂第29-30页
       ·培养基第29页
       ·生化与分子生物学试剂第29-30页
       ·主要化学试剂第30页
       ·常用溶液的配制第30页
     ·菌种保藏第30页
     ·主要仪器第30-31页
     ·主要引物第31页
   ·实验方法第31-33页
     ·金龟子绿僵菌基因组的提取第31-32页
     ·基因文库的构建第32页
     ·基因簇的钓取第32-33页
       ·基因文库中大肠杆菌的培养第32页
       ·克隆的鉴定第32-33页
       ·阳性克隆的测序和序列拼接第33页
       ·基因簇全长的获得第33页
   ·结果与分析第33-36页
     ·金龟子绿僵菌基因组的获得第33页
     ·基因簇的钓取第33-34页
     ·基因簇完整序列的获取第34-35页
     ·基因簇基因功能的推测以及与烟曲霉基因簇基因的比较第35-36页
   ·本章小结第36-38页
第3章 农杆菌介导的烟曲霉P450基因敲除第38-50页
   ·引言第38页
   ·实验材料第38-40页
     ·菌株与材料第38页
     ·培养基及实验试剂第38-39页
       ·培养基第38-39页
       ·实验试剂第39页
     ·主要仪器第39页
     ·主要引物第39-40页
   ·实验方法第40-45页
     ·烟曲霉基因组的提取第40页
     ·农杆菌介导质粒的构建第40-43页
       ·烟曲霉P450(Af4g14780)基因片段的克隆第40页
       ·PCR产物的纯化与回收第40-41页
       ·pPK2质粒的提取第41页
       ·P450基因片段RB’与pPK2载体的双酶切第41页
       ·RB’与pPK2载体的连接第41-42页
       ·感受态细胞的制备第42页
       ·连接产物转化大肠杆菌第42页
       ·阳性重组子的菌落PCR鉴定第42页
       ·阳性重组子的序列分析第42页
       ·含RB’阳性重组子的质粒提取第42-43页
       ·P450 LB’基因的克隆第43页
       ·阳性重组子与LB’的连接及验证第43页
     ·根癌农杆菌感受态细胞的制备第43页
     ·电转法转化RB’/LB’::pPK2入农杆菌GV3101感受态第43页
     ·烟曲霉孢子的获取第43页
     ·根癌农杆菌介导的转化第43-44页
     ·转化子的鉴定第44页
     ·烟曲霉P450敲除株产烟曲霉酸能力的检测第44-45页
       ·烟曲霉的培养和发酵产物的萃取第44页
       ·转化反应的HPLC分析第44-45页
   ·结果与分析第45-48页
     ·PCR扩增RB’和LB’第45页
     ·构建RB’/LB’::pPK2载体第45-47页
     ·转化子的鉴定第47页
     ·烟曲霉P450敲除株产烟曲霉酸能力的检测第47-48页
   ·本章小结第48-50页
第4章 烟曲霉3-甾酮-Δ~1-脱氢酶的异源表达以及高效转化AD的基因工程菌构建第50-84页
   ·引言第50页
   ·实验材料第50-52页
     ·菌株与载体第50页
     ·培养基和实验材料第50-51页
       ·培养基第50-51页
       ·实验试剂第51页
     ·主要仪器第51页
     ·主要引物第51-52页
   ·实验方法第52-61页
     ·3-甾酮-Δ~1-脱氢酶(ksdD_F)在大肠杆菌(E.coli)中的表达基因的获取第52-53页
       ·烟曲霉基因组的提取第52页
       ·PCR扩增目的基因第52页
       ·PCR产物的纯化与回收第52页
       ·pET28(a)质粒的提取第52页
       ·PCR产物与pET28(a)载体的双酶切第52-53页
       ·目的基因与pET28(a)载体的连接第53页
       ·大肠杆菌DH5α或BL21(λDE3)感受态细胞的制备第53页
       ·连接产物转化大肠杆菌DH5a第53页
       ·阳性重组子的菌落PCR鉴定第53页
       ·阳性重组子的序列分析第53页
       ·重组质粒转化大肠杆菌BL21(λDE3)第53页
       ·阳性重组子的菌落PCR鉴定第53页
       ·KsdD_F跨膜结构的预测第53页
     ·3-甾酮-Δ~1-脱氢酶(ksdD_F)在大肠杆菌(E.coli)中的诱导表达第53-56页
       ·重组KsdD_F的诱导表达第53-54页
       ·表达产物的SDS-PAGE电泳鉴定第54页
       ·KsdD_F重组大肠杆菌的全细胞转化反应第54-55页
       ·ksdD_F重组大肠杆菌各细胞组分的酶活测定以及KsdD_F的酶活定位第55页
       ·KsdD_F大肠杆菌表达酶动力学参数的测定第55-56页
     ·重组毕赤酵母KM71(pPIC3.5K-ksdD_F)和GS115(pPIC3.5K-ksdD_F)的构建第56-58页
       ·PCR引物的设计与合成第56页
       ·PCR扩增目的DNA第56页
       ·PCR产物的纯化与回收第56页
       ·pPIC3.5K质粒的提取第56页
       ·PCR产物与pPIC3.5K载体的双酶切第56页
       ·目的基因与pPIC3.5K载体的连接第56页
       ·大肠杆菌DH5α或BL21(λDE3)感受态细胞的制备第56-57页
       ·连接产物转化大肠杆菌DH5α第57页
       ·阳性重组子的菌落PCR鉴定第57页
       ·阳性重组子的序列分析第57页
       ·毕赤酵母KM71和GS115感受态细胞的制备和电转化构建第57页
       ·重组毕赤酵母的PCR鉴定以及阳性克隆子的基因型鉴定第57-58页
     ·毕赤酵母的诱导表达第58-60页
       ·生长曲线的测定第58页
       ·毕赤酵母的诱导表达第58页
       ·目的蛋白的电泳检测第58页
       ·工程菌的酶活检测第58-59页
       ·诱导条件的优化实验第59页
       ·工程菌最高转化能力的检测第59页
       ·ksdD_F重组毕赤酵母KM71_I和GS115_I各细胞组分的酶活测定以及KsdD_F的酶活定位第59页
       ·毕赤酵母表达KsdD_F酶动力学参数的测定第59-60页
       ·毕赤酵母高产菌株GS115_I积累宝丹酮的优化第60页
     ·重组毕赤酵母KM71(pPIC9K-ksdD_F)和GS115(pPIC9K-ksdD_F)的构建第60-61页
       ·重组载体pPIC3.5K-ksdD_F和pPIC9K质粒的提取第60-61页
       ·重组载体pPIC3.5K-ksdD_F与pPIC9K载体的双酶切第61页
       ·目的基因与pPIC9K载体的连接第61页
       ·重组毕赤酵母KM71(pPIC9K-ksdD_F)和GS115(pPIC9K-ksdD_F)的构建第61页
     ·毕赤酵母胞外表达的蛋白电泳和酶活检测第61页
       ·毕赤酵母胞外表达的蛋白电泳第61页
       ·毕赤酵母胞外表达重组KM71_E和GS115_E的酶活测定第61页
   ·结果与分析第61-82页
     ·3-甾酮-Δ~1-脱氢酶(ksdD_F)在大肠杆菌(E.coli)中的表达基因的获取第61-65页
       ·烟曲霉ksdD_F的克隆第61-62页
       ·KsdD_F跨膜结构的预测第62-63页
       ·在大肠杆菌中异源表达KsdD_F第63-65页
     ·ksdD_F的诱导表达及甾体药物转化活性第65-68页
       ·ksdD_F的诱导表达第65-66页
       ·BL21-pET28a-ksdD_F对AD的全细胞转化第66页
       ·细胞中KsdD_F的酶活定位分析第66-67页
       ·大肠杆菌表达的KsdD_F酶动力学参数的测定第67-68页
     ·重组毕赤酵母KM71(pPIC3.5K-ksdD_F)和GS115(pPIC3.5K-ksdD_F)的构建第68-69页
       ·烟曲霉ksdD_F基因的克隆第68页
       ·构建ksdD_F::pPIC3.5K载体及毕赤酵母转化第68-69页
     ·KsdD_F在毕赤酵母中的胞内表达第69-80页
       ·生长曲线的测定第69-70页
       ·毕赤酵母的诱导表达及目的蛋白的电泳检测第70页
       ·诱导条件的优化实验第70-71页
       ·转化能力检测第71-73页
       ·KM71_I和GS115_I转化AD生成BD的鉴定第73-77页
       ·KsdD_F在KM71_I和GS115_I中的酶活定位第77-78页
       ·毕赤酵母表达KsdD_F酶学动力学参数的测定第78-80页
     ·ksdD_F在KM71(pPIC9K-ksdD_F)和GS115(pPIC9K-ksdD_F)中的胞外表达第80-81页
       ·ksdDF::pPIC9K载体的构建第80页
       ·毕赤酵母电转化第80-81页
     ·KsdD_F毕赤酵母的胞外表达第81-82页
       ·毕赤酵母的诱导表达及目的蛋白的电泳检测第81页
       ·重组KM71_E和GS115_E酶活的检测第81-82页
   ·本章小结第82-84页
第5章 结论与展望第84-86页
   ·结论第84-85页
   ·课题展望第85-86页
参考文献第86-91页
致谢第91页

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