| 中文摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-12页 |
| 前言 | 第12-14页 |
| 论文 | 第14-64页 |
| 第一章 盐生杜氏藻CPD光裂合酶基因DSPHR2的克隆 | 第14-29页 |
| 1 材料和方法 | 第14-23页 |
| ·材料 | 第14-16页 |
| ·藻种 | 第14页 |
| ·菌种 | 第14页 |
| ·酶和试剂盒 | 第14-15页 |
| ·培养基 | 第15页 |
| ·引物和测序 | 第15-16页 |
| ·仪器设备 | 第16页 |
| ·方法 | 第16-23页 |
| ·盐生杜氏藻总RNA的提取及质量的检测 | 第16页 |
| ·反转录PCR | 第16-17页 |
| ·简并引物的设计以及同源克隆PCR | 第17-18页 |
| ·胶回收和TA克隆 | 第18-19页 |
| ·测序结果的分析 | 第19页 |
| ·3’RACE和5’RACE引物设计 | 第19页 |
| ·盐藻CPD光裂合酶基因3’端序列的克隆 | 第19-21页 |
| ·盐藻CPD光裂合酶基因5’端序列的克隆 | 第21-23页 |
| ·cDNA全长的拼接和初步的BLASTX分析 | 第23页 |
| 2 结果和分析 | 第23-27页 |
| ·盐藻总RNA的质量检测 | 第23-25页 |
| ·盐藻CPD光裂合酶基因EST的克隆及分析 | 第25页 |
| ·盐藻CPD光裂合酶基因的3’端序列的克隆 | 第25页 |
| ·3’端测序结果的拼接 | 第25-26页 |
| ·盐藻CPD光裂合酶基因的5’端序列的克隆 | 第26页 |
| ·测序结果的拼接 | 第26-27页 |
| 3 讨论 | 第27-29页 |
| ·高质量RNA的提取及检测 | 第27页 |
| ·简并引物的设计 | 第27-29页 |
| 第二章 盐生杜氏藻CPD光裂合酶基因DSPHR2的生物信息学分析 | 第29-39页 |
| 1 分析方法 | 第29-30页 |
| ·核酸序列的相关分析 | 第29页 |
| ·GC含量的分布 | 第29页 |
| ·ORF的分析 | 第29页 |
| ·蛋白质序列的相关分析 | 第29-30页 |
| ·蛋白质的基本性质分析 | 第29页 |
| ·氨基酸序列比对 | 第29-30页 |
| ·功能结构域的预测 | 第30页 |
| ·系统发育分析 | 第30页 |
| ·三级结构的预测 | 第30页 |
| 2 结果与分析 | 第30-36页 |
| ·核苷酸序列的相关分析 | 第30-31页 |
| ·GC含量的分布 | 第30-31页 |
| ·ORF的分析 | 第31页 |
| ·蛋白质序列的相关分析 | 第31-36页 |
| ·蛋白质的基本性质分析 | 第31-32页 |
| ·氨基酸序列比对 | 第32-34页 |
| ·功能结构域的预测 | 第34-35页 |
| ·系统发育分析 | 第35页 |
| ·三级结构的预测 | 第35-36页 |
| 3 讨论 | 第36-39页 |
| ·盐藻和衣藻CPD光裂合酶 | 第36页 |
| ·CPD光裂合酶三级结构的比较 | 第36-39页 |
| 第三章 基因DSPHR2在大肠杆菌紫外损伤修复缺陷株SY2中的功能互补 | 第39-52页 |
| 1 材料和方法 | 第39-47页 |
| ·材料 | 第39-41页 |
| ·菌种和载体 | 第39页 |
| ·试剂 | 第39-41页 |
| ·酶和试剂盒 | 第41页 |
| ·合成引物及测序 | 第41页 |
| ·仪器和设备 | 第41页 |
| ·方法 | 第41-47页 |
| ·盐生杜氏藻CPD光裂合酶基因ORF的克隆 | 第41-42页 |
| ·盐藻CPD光裂合酶基因的测序及比对 | 第42页 |
| ·SY2感受态的制备 | 第42-43页 |
| ·表达载体pGEX-DsPHR2的构建及验证 | 第43-44页 |
| ·SY2的高效转化 | 第44页 |
| ·SDS-PAGE蛋白质凝胶电泳 | 第44-45页 |
| ·SY2/pGEX-DsPHR2的表达 | 第45-46页 |
| ·盐藻CPD光裂合酶基因DsPHR2在SY2中的功能互补 | 第46-47页 |
| 2 结果和分析 | 第47-50页 |
| ·盐藻CPD光裂合酶基因ORF的克隆 | 第47-48页 |
| ·载体pGEX-DsPHR2的构建 | 第48页 |
| ·菌株SY2/DGEX-DsPHR2的验证 | 第48-49页 |
| ·盐藻CPD光裂合酶基因DsPHR2在SY2中的功能互补 | 第49-50页 |
| 3 讨论 | 第50-52页 |
| ·宿主菌的选择 | 第50页 |
| ·实验条件的优化 | 第50-51页 |
| ·盐藻CPD光裂合酶基因DsPHR2的一些特性 | 第51-52页 |
| 第四章 盐生杜氏藻CPD光裂合酶基因DSPHR2的差异表达 | 第52-64页 |
| 1 材料和方法 | 第52-56页 |
| ·材料 | 第52-53页 |
| ·藻种 | 第52页 |
| ·试剂和试剂盒 | 第52页 |
| ·引物合成 | 第52页 |
| ·仪器及设备 | 第52-53页 |
| ·方法 | 第53-56页 |
| ·胁迫处理 | 第53页 |
| ·盐藻总RNA的提取 | 第53页 |
| ·反转录 | 第53-54页 |
| ·Real time PCR引物的设计 | 第54页 |
| ·引物的验证 | 第54页 |
| ·Real time PCR | 第54-55页 |
| ·标准曲线的制作 | 第55页 |
| ·相对定量的计算方法 | 第55-56页 |
| 2 结果与分析 | 第56-61页 |
| ·目的基因特异引物的验证 | 第56页 |
| ·荧光定量PCR | 第56-58页 |
| ·标准曲线 | 第56-58页 |
| ·融解曲线 | 第58页 |
| ·荧光定量PCR的数据处理与分析 | 第58-61页 |
| ·光照胁迫条件下盐藻DsPHR2基因mRNA的表达情况 | 第58-59页 |
| ·紫外胁迫条件下盐藻DsPHR2基因mRNA的表达情况 | 第59-60页 |
| ·高浓度盐胁迫条件下盐藻DsPHR2基因mRNA的表达情况 | 第60-61页 |
| ·氧化胁迫条件下盐藻DsPHR2基因mRNA的表达情况 | 第61页 |
| 3 讨论 | 第61-64页 |
| ·荧光定量PCR染料法对引物设计的要求 | 第61-62页 |
| ·CPD光裂合酶基因的表达特性 | 第62-64页 |
| 结论 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-68页 |
| 在读期间科研成果 | 第68-70页 |
| 致谢 | 第70-71页 |
| 综述 | 第71-87页 |
