C40类胡萝卜素代谢网络重建预测及大肠杆菌产番茄红素的通量分析
| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-24页 |
| ·系统生物学概述 | 第12页 |
| ·代谢网络的研究现状 | 第12-14页 |
| ·基于约束的通量分析算法 | 第14-20页 |
| ·FBA 代谢通量平衡分析 | 第16-18页 |
| ·OptKnock | 第18-20页 |
| ·类胡萝卜素概述 | 第20-22页 |
| ·类胡萝卜素种类和分布 | 第20页 |
| ·类胡萝卜素生理功能及代谢工程 | 第20-21页 |
| ·番茄红素(Lycopene)的合成 | 第21-22页 |
| ·本课题的主要研究工作 | 第22-24页 |
| 第二章 C40 类胡萝卜素代谢网络重建及预测 | 第24-48页 |
| ·研究背景 | 第24页 |
| ·材料和方法 | 第24-33页 |
| ·类胡萝卜素数据库构建 | 第24-27页 |
| ·类胡萝卜素化合物数据库的构建 | 第25-26页 |
| ·类胡萝卜素生化代谢反应数据库的构建 | 第26-27页 |
| ·简化的类胡萝卜素化合物数据库构建 | 第27页 |
| ·转化规则的产生 | 第27-29页 |
| ·反应产生过程 | 第29-30页 |
| ·最短路径算法的实施 | 第30-33页 |
| ·结果与讨论 | 第33-46页 |
| ·简化数据库代谢网络的构建 | 第33-35页 |
| ·类胡萝卜素合成中间代谢物的预测 | 第35-36页 |
| ·类胡萝卜素代谢网络构建 | 第36-38页 |
| ·代谢网络的连接度 | 第38-39页 |
| ·验证文献中提出的假设途径 | 第39-41页 |
| ·预测新的类胡萝卜素代谢途径 | 第41-43页 |
| ·获取整个网络的子集 | 第43-46页 |
| ·结论 | 第46-48页 |
| 第三章 大肠杆菌产番茄红素系统生物学研究 | 第48-68页 |
| ·研究背景 | 第48-49页 |
| ·材料和方法 | 第49-54页 |
| ·实验材料 | 第49页 |
| ·实验技术方案 | 第49-54页 |
| ·产番茄红素的大肠杆菌代谢网络的重建 | 第49-52页 |
| ·FBA 计算 | 第52-53页 |
| ·OptKnock 计算 | 第53-54页 |
| ·结果与讨论 | 第54-67页 |
| ·FBA 计算结果 | 第54-63页 |
| ·OptKnock 计算结果 | 第63-67页 |
| ·计算时间 | 第67页 |
| ·结论 | 第67-68页 |
| 第四章 结论与建议 | 第68-70页 |
| ·全文小结 | 第68页 |
| ·建议 | 第68-70页 |
| 参考文献 | 第70-76页 |
| 附录 | 第76-78页 |
| 致谢 | 第78-79页 |
| 研究成果及发表的学术论文 | 第79-80页 |
| 作者简介 | 第80-81页 |
| 导师简介 | 第81-82页 |
| 附件 | 第82-83页 |
