构建基于约束的微生物代谢模型的计算分析平台

内容提要	第1-6页
第1章 引言	第6-11页
·系统生物学背景	第6-8页
·代谢网络概述	第8-9页
·本文内容	第9-11页
第2章 基于约束的微生物代谢模型	第11-22页
·代谢模型建立过程概述	第11-16页
·代谢网络重构	第12-13页
·代谢模型构建	第13-15页
·代谢模型分析	第15-16页
·基于约束的建模方法	第16-18页
·约束模型构建流程	第16-17页
·约束的数学表示	第17-18页
·流平衡分析	第18-22页
第3章 分析平台的构建	第22-49页
·建模工具	第22-29页
·代谢模型描述语言SBML	第22-26页
·GNU 线性编程工具包GLPK	第26-28页
·建模语言Perl	第28-29页
·搭建分析平台的计算机环境	第29-41页
·Linux 环境下Perl 安装	第29-30页
·GNU 线性编程工具包安装	第30页
·Perl 模块安装	第30-34页
·编写用户模块sbm12flux	第34-40页
·设置相关的环境变量	第40-41页
·微生物代谢模型计算机分析平台的实现	第41-49页
第4章 模拟策略	第49-58页
·模拟细胞生长	第49-54页
·计算机模拟过程	第49-52页
·时间复杂度与结果数据	第52-54页
·结果分析	第54-58页
·生物质成分的灵敏性分析	第55-57页
·结论	第57-58页
第5章 结束语	第58-60页
·总结	第58-59页
·展望	第59-60页
参考文献	第60-62页
摘要	第62-66页
Abstract	第66-70页
致谢	第70页