| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-22页 |
| 引言 | 第12页 |
| 第一节 微生物基因组学研究 | 第12-17页 |
| 1 微生物基因组研究方法 | 第12-14页 |
| ·模式微生物基因组的研究 | 第12-13页 |
| ·最小基因组研究 | 第13页 |
| ·比较基因组学研究 | 第13-14页 |
| ·生物信息学研究 | 第14页 |
| 2 病原微生物功能基因组学的研究 | 第14-17页 |
| ·对Koch 氏原则和毒力基因概念的新认识 | 第14-15页 |
| ·病原菌功能基因组学的研究 | 第15-17页 |
| 第二节 鳗弧菌毒力相关基因的研究进展 | 第17-22页 |
| 引言 | 第17页 |
| 1 外毒素(exotoxin) | 第17-18页 |
| ·溶血素(hemolysin) | 第17-18页 |
| ·重复序列毒素(repeat in toxin，RTX) | 第18页 |
| 2 粘附因子(adherence／clonization factor) | 第18-19页 |
| ·鞭毛(flagellum) | 第18-19页 |
| ·菌毛(pilus) | 第19页 |
| 3 侵袭因子(invasion factor) | 第19-20页 |
| 4 细胞表面成分(cell surface components) | 第20页 |
| 5 铁吸收系统(iron uptake system) | 第20-22页 |
| 第二章 鳗弧菌Fosmid 基因组文库的构建和特性分析 | 第22-47页 |
| 第一节 鳗弧菌Fosmid 基因组文库的构建 | 第22-35页 |
| 引言 | 第22页 |
| 1 材料与方法 | 第22-28页 |
| ·菌株 | 第22页 |
| ·试剂 | 第22-23页 |
| ·仪器 | 第23-28页 |
| 2 结果与讨论 | 第28-35页 |
| ·高质量基因组DNA 的获得 | 第28-29页 |
| ·末端修复及合适片断的回收 | 第29-30页 |
| ·包装及转导 | 第30-31页 |
| ·克隆的保存 | 第31页 |
| ·超级池的构建 | 第31-32页 |
| ·文库鉴定 | 第32-35页 |
| 第二节 鳗弧菌基因组的特征分析 | 第35-47页 |
| 引言 | 第35页 |
| 1 材料与方法 | 第35页 |
| ·材料 | 第35页 |
| ·方法 | 第35页 |
| 2 结果与分析 | 第35-44页 |
| ·测序结果 | 第36页 |
| ·生物信息学分析 | 第36-43页 |
| ·影响鳗弧菌毒力基因的预测 | 第43-44页 |
| 3 讨论 | 第44-47页 |
| ·测序结果 | 第44页 |
| ·毒力基因的预测 | 第44-47页 |
| 第三章 从鳗弧菌M3 Fosmid 文库筛选aroA 基因 | 第47-55页 |
| 引言 | 第47页 |
| 1 材料和方法 | 第47-48页 |
| ·从鳗弧菌M3 Fosmid 文库筛选aroA 基因的策略 | 第47-48页 |
| ·生物信息学分析 | 第48页 |
| 2 结果 | 第48-52页 |
| ·从鳗弧菌M3 Fosmid 文库中克隆aroA 基因 | 第48-50页 |
| ·鳗弧菌M3 aroA 基因核苷酸序列分析 | 第50页 |
| ·鳗弧菌aroA 基因氨基酸序列分析 | 第50-52页 |
| 3 讨论 | 第52-55页 |
| 第四章 鳗弧菌 PrtV 基因的功能鉴定 | 第55-73页 |
| 引言 | 第55页 |
| 1 材料和方法 | 第55-62页 |
| ·从鳗弧菌M3 Fosmid 文库筛选PrtV 基因 | 第55-56页 |
| ·鳗弧菌PrtV 基因插入失活突变株构建策略 | 第56-59页 |
| ·鳗弧菌PrtV 基因插入失活突变株互补株的构建 | 第59-61页 |
| ·鳗弧菌PrtV 基因插入失活突变株及互补株的毒力及生化鉴定 | 第61-62页 |
| 2 结果 | 第62-71页 |
| ·从鳗弧菌M3 Fosmid 文库中克隆PrtV 基因 | 第62-65页 |
| ·PrtV 基因插入失活突变株的构建和互补株的构建 | 第65-66页 |
| ·毒力及生化鉴定 | 第66-71页 |
| 3 讨论 | 第71-73页 |
| 个人简介 | 第73页 |
| 学术成果 | 第73-74页 |
| 参考文献 | 第74-81页 |
| 致谢 | 第81页 |
