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中国大豆地方品种群体的遗传结构和连锁不平衡特征及主要育种性状QTL的关联分析

摘要第1-10页
ABSTRACT第10-13页
第一章 文献综述第13-33页
 1 大豆种质资源研究概述第13-16页
   ·大豆种质资源为遗传育种提供基本素材第13-14页
   ·大豆地方品种资源研究的必要性第14-15页
   ·中国栽培大豆生态区的划分第15-16页
   ·大豆资源的保存、研究与利用概况第16页
 2 种质资源研究中的遗传标记第16-20页
   ·遗传标记的发展第16-17页
   ·形态学标记第17页
   ·细胞学标记第17页
   ·生物化学标记第17-18页
   ·免疫学标记第18页
   ·分子标记第18-20页
 3 大豆分子育种及相关研究现状与进展第20-22页
   ·大豆分子遗传图谱第20页
   ·大豆重要农艺品质性状QTL定位第20-21页
   ·大豆转基因育种第21页
   ·大豆结构基因组研究第21-22页
   ·大豆功能基因组研究第22页
   ·大豆生物信息数据库第22页
 4 群体的遗传多样性和群体遗传结构分析的方法第22-24页
   ·遗传多样性分析的方法与指标第22-23页
   ·遗传距离第23页
   ·基于STRUCTURE软件的遗传多样性和遗传结构分析方法第23-24页
 5 关联分析是基因组和表型的一座桥梁第24-26页
   ·连锁不平衡第24-25页
   ·影响连锁不平衡的因素第25页
   ·连锁不平衡分析实验设计第25-26页
   ·连锁不平衡分析存在的问题第26页
   ·关联分析的主要方法第26页
 6 大豆资源群体遗传结构及关联分析研究进展第26-29页
   ·栽培大豆遗传结构和遗传多样性研究的进展第26-27页
   ·大豆基因组的LD结构研究进展第27-28页
   ·关联分析的研究进展第28-29页
 7 本研究的目的与内容第29-33页
   ·研究目的与意义第29-30页
   ·研究的基本思路第30-31页
   ·本研究的主要内容第31-33页
第二章 材料与方法第33-37页
 1 材料第33页
 2 方法第33-37页
   ·SSR分子标记第33页
   ·田间试验及性状的观测第33-34页
   ·数据处理第34-37页
第三章 中国大豆地方品种群体的遗传结构特征和连锁不平衡第37-49页
 1 中国大豆地方品种群体结构第37-44页
   ·SSR位点的等位变异数第37-38页
   ·中国大豆地方品种生态群体间的遗传关系第38-39页
   ·中国大豆地方品种生态群体的遗传多样性第39-40页
   ·基于STRUCTURE的聚类来推断种群结构第40页
   ·遗传多样性和遗传结构第40-42页
   ·分子方差分析(AMOVA)第42页
   ·模型划分组间遗传关系第42-43页
   ·模型划分组内遗传多样性第43-44页
 2 中国大豆地方品种群体SSR标记位点间的连锁不平衡及其衰减第44-47页
   ·大豆地方品种SSR标记位点的连锁不平衡第44页
   ·LD的衰减度第44-47页
 3 讨论第47-49页
   ·中国栽培大豆地方品种的遗传结构第47页
   ·连锁不平衡和衰减度第47-49页
第四章 主要育种性状的关联分析及优异等位变异和典型材料的挖掘第49-83页
 1 与大豆农艺品质性状相关联的SSR标记第49-53页
   ·与农艺性状关联的SSR标记第49-51页
   ·与品质性状关联的SSR标记第51-53页
 2 与主要育种性状相关联的SSR标记优异等位变异的发掘第53-60页
   ·农艺性状优异等位变异的发掘第53-57页
   ·加工品质性状优异等位变异的发掘第57-60页
 3 携带主要育种性状的优异等位变异的载体材料的发掘第60-76页
   ·农艺育种性状的优异等位变异的载体材料的发掘第60-70页
   ·加工品质育种性状的优异等位变异的载体材料的发掘第70-76页
 4 讨论第76-83页
   ·关联作图与连锁作图定位的比较第76-77页
   ·主要育种性状的优异等位变异的分析第77-78页
   ·最优异等位变异的效应值和典型载体材料的确定第78-81页
   ·将大豆育成品种群体关联分析结果用于设计聚合育种第81-83页
第五章 全文讨论、结论与创新之处第83-89页
 1 全文讨论第83-85页
   ·中国大豆地方品种种质资源存在现状、多样性评价标准及现实意义第83-84页
   ·关联定位的方法应用前景和展望第84页
   ·大豆地方品种群体关联分析结果用于设计育种第84-85页
 2 全文结论第85-86页
 3 论文创新点第86-89页
参考文献第89-97页
附录第97-109页
 附录1 DNA提取(CTAB)法第97-102页
  1. DNA提取第97-98页
  2. SSR标记分析第98-102页
 附录2 供试材料及与各性状显著关联位点、等位变异及表型效应表第102-109页
致谢第109页

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