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尖孢镰刀菌古巴专化型4号生理小种T-DNA插入突变体库的构建及部分致病相关突变体插入位点的定位

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-12页
1 前言第12-32页
   ·香蕉枯萎病概况第12-13页
   ·香蕉枯萎病菌的分子生物学研究进展第13-15页
     ·香蕉枯萎病菌的遗传多态性研究进展第13-14页
     ·香蕉枯萎病病原菌致病分子机理研究进展第14-15页
     ·研究香蕉枯萎病菌致病相关基因的意义第15页
   ·香蕉枯萎病菌基因功能研究策略第15-23页
     ·香蕉枯萎病病原菌正向遗传学研究中常用的两种转化方法第16-18页
       ·PEG介导原生质体转化法第16-17页
       ·农杆菌介导T-DNA插入转化法第17-18页
     ·香蕉枯萎病病原菌基因功能研究中的已用到的两种反向遗传学技术第18-20页
       ·基于基因同源性的克隆法第19页
       ·基于蛋白质的克隆法第19-20页
     ·香蕉枯萎病菌基因功能研究中需要同时运用反向遗传学技术与正向遗传学相关技术第20-21页
     ·农杆菌介导T-DNA插入转化法在真菌转化中的优势第21-22页
     ·农杆菌介导T-DNA插入后T-DNA整合方式的研究第22-23页
   ·插入突变侧翼序列的克隆方法第23-30页
     ·连接成环PCR策略第23-24页
     ·外源接头介导PCR第24-25页
       ·双链接头第24-25页
       ·单链接头第25页
     ·半随机引物PCR第25-30页
       ·新Alu-PCR第26页
       ·TAIL-PCR第26-27页
       ·DW-ACPTM技术第27-30页
     ·PCR方法外经常用到的质粒拯救技术第30页
   ·选题意义和目标第30页
   ·T-DNA介导的香蕉枯萎镰刀菌4号生理小种遗传转化及致病相关基因克隆的技术路线第30-32页
2 材料与方法第32-50页
   ·材料第32-34页
     ·供试香蕉枯萎病病原菌第32页
     ·菌株和质粒第32-33页
     ·供试香蕉叶片第33页
     ·主要生化试剂第33页
     ·引物合成第33页
     ·培养基第33-34页
     ·供试巴西蕉组培苗第34页
   ·香蕉枯萎病病原菌分离鉴定及致病性测定方法第34-39页
     ·菌株的培养第34页
     ·香蕉枯萎病病原菌分离与纯化第34页
     ·病原菌经典病理学鉴定方法第34页
     ·病原菌致病性测定方法第34-35页
     ·病原菌种类分子鉴定方法第35-36页
       ·菌丝的培养及处理第35页
       ·基因组DNA的提取第35-36页
     ·菌株rDNA-ITS序列扩增第36-39页
       ·PCR反应第36页
       ·PCR产物回收第36-37页
       ·E.coli DH5α感受态细胞的制备第37页
       ·目的片段的连接第37-38页
       ·大肠杆菌转化第38页
       ·蓝白斑筛选鉴定阳性克隆第38页
       ·Colony PCR鉴定阳性克隆第38-39页
       ·测序与生物信息学分析第39页
   ·根癌农杆菌介导的香蕉枯萎病菌4号生理小种转化方法第39-43页
     ·碱裂解法提取质粒DNA第39-40页
     ·农杆菌感受态细胞的制备第40页
     ·农杆菌转化第40页
     ·农杆菌菌种的保存第40-41页
     ·实验所用的野生型香蕉枯萎病菌4号小种的获得第41页
     ·香蕉枯萎病菌4号小种的单孢分离第41页
     ·插入突变所用的野生型香蕉枯萎病菌4号小种的筛选第41页
     ·香蕉枯萎病菌4号生理小种菌种的保存第41-42页
     ·香蕉枯萎病菌4号小种的遗传转化第42-43页
       ·野生型菌株对潮霉素B的敏感性检测第42页
       ·ATMT转化体系中根癌农杆菌的处理第42页
       ·香蕉枯萎病4号小种193-6分生孢子的准备第42页
       ·4号小种病原菌的转化及筛选第42页
       ·转化中影响因子的优化第42-43页
   ·香蕉枯萎病菌4号小种转化子的分析第43-45页
     ·转化子的纯化保存及遗传稳定性检测第43页
     ·转化子致病力的测定第43-44页
     ·转化子的PCR验证第44-45页
       ·转化子总DNA的快速提取第44页
       ·PCR检测第44-45页
     ·致病性显著变化转化子生物学特性的测定第45页
       ·部分致病性明显变化转化子菌落生长形态的比较第45页
       ·部分致病性明显变化转化子菌落生长速度测定第45页
   ·致病性显著变化转化子的侧翼序列的扩增第45-50页
     ·转化子侧翼序列的扩增中DW-ACP-PCR技术的选择第45-46页
     ·目标特异性引物的设计第46页
     ·DW-ACP-PCR技术的三轮PCR反应第46-47页
     ·转化子侧翼序列的克隆第47-50页
       ·PCR产物回收第47-48页
       ·E.coli DH5α感受态细胞的制备第48页
       ·目的片段的连接第48-49页
       ·大肠杆菌转化第49页
       ·蓝白斑筛选鉴定阳性克隆第49页
       ·Colony PCR鉴定阳性克隆第49-50页
3 结果与分析第50-62页
   ·海南省不同来源香蕉枯萎病病原菌4号小种分离鉴定及致病性测定结果第50-51页
     ·海南省不同来源香蕉枯萎病病原菌经典病理学鉴定第50页
     ·海南省不同来源香蕉枯萎病病原菌病原菌种类分子鉴定第50页
     ·海南省不同来源香蕉枯萎病病原菌致病性测定结果第50页
     ·海南省不同地区的香蕉枯萎病病原的确定第50页
     ·应用于T-DNA插入突变的4号生理小种模式野生菌株的确定第50-51页
   ·香蕉枯萎病菌4号生理小种遗传转化的结果与分析第51-56页
     ·4号生理小种193-6对潮霉素B的敏感性测定第51-52页
     ·Focr4孢子浓度对转化效率的影响第52页
     ·农杆菌菌株AGL-1浓度对转化效率的影响第52-53页
     ·液体IM培养基诱导农杆菌时间对转化效率的影响第53页
     ·IM固体培养基中诱导剂AS浓度对转化效率的影响第53-54页
     ·细菌与真菌共培养时间对转化效率的影响第54-55页
     ·细菌与真菌共培养温度对转化效率的影响第55页
     ·pH值对转化效率的影响第55-56页
   ·香蕉枯萎病菌4号小种转化子的分析第56-59页
     ·转化子的PCR鉴定第56-57页
     ·转化子的遗传稳定性测定结果第57页
     ·转化子致病力的测定第57-59页
   ·部分致病性变化转化子生物学特性的测定第59-60页
     ·部分致病性明显变化转化子菌落生长形态的比较第59-60页
     ·部分致病性明显变化转化子菌落生长速度测定第60页
   ·致病性丧失或致病性严重减弱或致病性严重加强转化子的侧翼序列的扩增第60-62页
     ·DW-ACP-PCR扩增得到T-DNA插入位点的侧翼序列特异性条带第60-61页
     ·DW-ACP-PCR特异性产物的克隆第61-62页
     ·T-DNA插入侧翼目标片段的测序与分析结果第62页
4 讨论第62-67页
   ·根癌农杆菌介导的香蕉枯萎病菌4号生理小种转化条件的优化第62-63页
   ·关于香蕉枯萎病菌4号生理小种突变体的致病性测定第63-64页
   ·关于突变体侧翼序列克隆方法的分析第64-67页
     ·突变体侧翼序列克隆方法的选择第64-65页
     ·关于DW-ACP-PCR技术第65-67页
       ·DW-ACP-PCR技术中TSP引物的设计第65页
       ·DW-ACP-PCR技术的优缺点第65-66页
       ·DW-ACP技术操作体系的优化第66-67页
   ·有待进一步研究的问题第67页
5 结论第67-68页
   ·对海南省不同地区来源的香蕉枯萎病植株上的病原菌进行了鉴定第67页
   ·对香蕉枯萎病菌4号生理小种的ATMT转化体系进行了优化第67-68页
   ·构建了一个库容量为2520的香蕉枯萎病菌4号小种T-DNA插入突变体库第68页
   ·找到了一种高通量的筛选致病性显著变化突变体的致病性测定方法第68页
   ·筛选获得了一批致病性显著变化的突变体第68页
   ·运用DW-ACP技术能够很好地扩增突变体插入位点的侧翼序列第68页
参考文献第68-78页
附录第78-83页
 附录1 缩略词表第78-79页
 附录2 常用培养基、试剂配方第79-81页
  1 常用培养基配方第79页
  2 常用试剂配方第79-81页
 附录3 本实验所涉及的质粒图谱第81页
 附录4 实验主要仪器设备第81-82页
 附录5 相关序列信息第82-83页
致谢第83页

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