致谢 | 第6-7页 |
摘要 | 第7-9页 |
ABSTRACT | 第9-11页 |
1 前言 | 第16-29页 |
1.1 DNA条形码 | 第16-21页 |
1.1.1 DNA条形码技术 | 第16-17页 |
1.1.2 DNA条形码技术的原理及条形码基因的选择 | 第17页 |
1.1.3 DNA条形码在动物鉴定中的应用 | 第17-18页 |
1.1.4 DNA条形码在植物鉴定中的应用 | 第18-19页 |
1.1.5 DNA条形码在微生物及原生生物鉴定中的应用 | 第19-20页 |
1.1.6 DNA条形码的局限性以及展望 | 第20-21页 |
1.2 线粒体基因组 | 第21-27页 |
1.2.1 线粒体基因组结构特点 | 第21-23页 |
1.2.2 蜘蛛线粒体基因组 | 第23-27页 |
1.2.2.1 蜘蛛目系统发育研究 | 第23-26页 |
1.2.2.2 蜘蛛线粒体基因组特征 | 第26-27页 |
1.2.2.3 蜘蛛线粒体基因研究进展 | 第27页 |
1.3 课题的研究背景和意义 | 第27-29页 |
1.3.1 研究物种的介绍 | 第27-28页 |
1.3.2 研究的背景和意义 | 第28-29页 |
2 材料与方法 | 第29-39页 |
2.1 实验材料 | 第29-33页 |
2.1.1 样本采集和物种鉴定 | 第29页 |
2.1.2 实验主要仪器 | 第29页 |
2.1.3 实验主要试剂 | 第29页 |
2.1.4 生物信息学软件 | 第29-33页 |
2.2 实验方法 | 第33-38页 |
2.2.1 总DNA的提取和检测 | 第33-34页 |
2.2.2 引物的设计 | 第34-36页 |
2.2.3 PCR扩增和产物纯化 | 第36-37页 |
2.2.4 PCR产物的克隆和测序 | 第37页 |
2.2.5 线粒体基因组序列拼接、注释和分析 | 第37-38页 |
2.3 蜘蛛物种鉴定分析 | 第38-39页 |
2.3.1 基于条形码基因的物种分析鉴定 | 第38页 |
2.3.2 基于全线粒体基因的系统发育及物种鉴定分析 | 第38-39页 |
3 结果分析与讨论 | 第39-73页 |
3.1 基于DNA条形码基因的物种鉴定分析 | 第39-54页 |
3.1.1 基于COI基因的物种鉴定分析 | 第39-47页 |
3.1.1.1 COI基因碱基组成分析 | 第39页 |
3.1.1.2 碱基组成替换型式和替换频率分析 | 第39-41页 |
3.1.1.3 蜘蛛COI基因密码子使用情况分析 | 第41页 |
3.1.1.4 ABGD分析结果 | 第41-42页 |
3.1.1.5 基于COI基因的蜘蛛鉴定及系统发育分析 | 第42-47页 |
3.1.2 基于 16S基因的物种鉴定分析 | 第47-49页 |
3.1.2.1 16S基因碱基组成分析 | 第47页 |
3.1.2.2 碱基组成替换型式和替换频率分析 | 第47-48页 |
3.1.2.3 蜘蛛 16S基因密码子使用情况分析 | 第48页 |
3.1.2.4 ABGD划分结果分析 | 第48-49页 |
3.1.2.5 基于 16S基因的蜘蛛鉴定及系统发育分析 | 第49页 |
3.1.3 小结 | 第49-54页 |
3.2 基于全线粒体基因组的进化分析 | 第54-73页 |
3.2.1 线粒体基因的组成 | 第54-58页 |
3.2.2 蛋白编码基因 | 第58页 |
3.2.3 tRNA和rRNA基因 | 第58-67页 |
3.2.4 非编码区(Non-Coding Regions) | 第67页 |
3.2.5 线粒体基因组重排 | 第67-68页 |
3.2.6 基于线粒体基因组系统发育分析 | 第68页 |
3.2.7 小结 | 第68-73页 |
4 结论与展望 | 第73-75页 |
4.1 结论 | 第73-74页 |
4.2 展望 | 第74-75页 |
参考文献 | 第75-82页 |
作者简介 | 第82-83页 |