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基于DNA条形码和线粒体基因组的农田蜘蛛种类鉴定及系统发育分析

致谢第6-7页
摘要第7-9页
ABSTRACT第9-11页
1 前言第16-29页
    1.1 DNA条形码第16-21页
        1.1.1 DNA条形码技术第16-17页
        1.1.2 DNA条形码技术的原理及条形码基因的选择第17页
        1.1.3 DNA条形码在动物鉴定中的应用第17-18页
        1.1.4 DNA条形码在植物鉴定中的应用第18-19页
        1.1.5 DNA条形码在微生物及原生生物鉴定中的应用第19-20页
        1.1.6 DNA条形码的局限性以及展望第20-21页
    1.2 线粒体基因组第21-27页
        1.2.1 线粒体基因组结构特点第21-23页
        1.2.2 蜘蛛线粒体基因组第23-27页
            1.2.2.1 蜘蛛目系统发育研究第23-26页
            1.2.2.2 蜘蛛线粒体基因组特征第26-27页
            1.2.2.3 蜘蛛线粒体基因研究进展第27页
    1.3 课题的研究背景和意义第27-29页
        1.3.1 研究物种的介绍第27-28页
        1.3.2 研究的背景和意义第28-29页
2 材料与方法第29-39页
    2.1 实验材料第29-33页
        2.1.1 样本采集和物种鉴定第29页
        2.1.2 实验主要仪器第29页
        2.1.3 实验主要试剂第29页
        2.1.4 生物信息学软件第29-33页
    2.2 实验方法第33-38页
        2.2.1 总DNA的提取和检测第33-34页
        2.2.2 引物的设计第34-36页
        2.2.3 PCR扩增和产物纯化第36-37页
        2.2.4 PCR产物的克隆和测序第37页
        2.2.5 线粒体基因组序列拼接、注释和分析第37-38页
    2.3 蜘蛛物种鉴定分析第38-39页
        2.3.1 基于条形码基因的物种分析鉴定第38页
        2.3.2 基于全线粒体基因的系统发育及物种鉴定分析第38-39页
3 结果分析与讨论第39-73页
    3.1 基于DNA条形码基因的物种鉴定分析第39-54页
        3.1.1 基于COI基因的物种鉴定分析第39-47页
            3.1.1.1 COI基因碱基组成分析第39页
            3.1.1.2 碱基组成替换型式和替换频率分析第39-41页
            3.1.1.3 蜘蛛COI基因密码子使用情况分析第41页
            3.1.1.4 ABGD分析结果第41-42页
            3.1.1.5 基于COI基因的蜘蛛鉴定及系统发育分析第42-47页
        3.1.2 基于 16S基因的物种鉴定分析第47-49页
            3.1.2.1 16S基因碱基组成分析第47页
            3.1.2.2 碱基组成替换型式和替换频率分析第47-48页
            3.1.2.3 蜘蛛 16S基因密码子使用情况分析第48页
            3.1.2.4 ABGD划分结果分析第48-49页
            3.1.2.5 基于 16S基因的蜘蛛鉴定及系统发育分析第49页
        3.1.3 小结第49-54页
    3.2 基于全线粒体基因组的进化分析第54-73页
        3.2.1 线粒体基因的组成第54-58页
        3.2.2 蛋白编码基因第58页
        3.2.3 tRNA和rRNA基因第58-67页
        3.2.4 非编码区(Non-Coding Regions)第67页
        3.2.5 线粒体基因组重排第67-68页
        3.2.6 基于线粒体基因组系统发育分析第68页
        3.2.7 小结第68-73页
4 结论与展望第73-75页
    4.1 结论第73-74页
    4.2 展望第74-75页
参考文献第75-82页
作者简介第82-83页

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