| 摘要 | 第6-7页 |
| abstract | 第7-8页 |
| 英文缩略表 | 第14-15页 |
| 第一章 引言 | 第15-21页 |
| 1.1 分子标记研究进展 | 第15-16页 |
| 1.1.1 以分子杂交为基础的分子标记 | 第15页 |
| 1.1.2 以PCR技术为核心的分子标记 | 第15-16页 |
| 1.1.3 以基因组序列比较为基础的分子标记 | 第16页 |
| 1.2 作图群体类型 | 第16-17页 |
| 1.3 QTL定位方法 | 第17-18页 |
| 1.3.1 单标记分析法 | 第17页 |
| 1.3.2 区间作图法 | 第17页 |
| 1.3.3 复合区间作图 | 第17-18页 |
| 1.3.4 多重区间作图 | 第18页 |
| 1.3.5 基于混合线性模型的复合区间作图 | 第18页 |
| 1.3.6 完备区间作图法 | 第18页 |
| 1.4 高通量测序 | 第18-19页 |
| 1.5 QTL定位研究进展 | 第19-20页 |
| 1.5.1 QTL定位 | 第19页 |
| 1.5.2 棉花株高与纤维品质QTL定位研究进展 | 第19页 |
| 1.5.3 棉花株高与纤维品质QTL定位存在的问题及展望 | 第19-20页 |
| 1.6 棉花耐盐性机理 | 第20页 |
| 1.7 本研究的目的与意义 | 第20-21页 |
| 第二章 高密度遗传图谱构建 | 第21-30页 |
| 2.1 材料与方法 | 第21-24页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第21页 |
| 2.1.2 基因组DNA提取及检测 | 第21-22页 |
| 2.1.3 文库构建及测序 | 第22页 |
| 2.1.4 SNP标记开发与基因分型 | 第22-23页 |
| 2.1.5 遗传图谱构建与评估 | 第23-24页 |
| 2.2 结果与分析 | 第24-28页 |
| 2.2.1 高通量测序和基因分型 | 第24-25页 |
| 2.2.2 遗传图谱构建 | 第25-27页 |
| 2.2.3 遗传图谱质量评估 | 第27-28页 |
| 2.3 讨论与结论 | 第28-30页 |
| 2.3.1 重测序与SLAF测序结合的特点 | 第28-29页 |
| 2.3.2 遗传图谱构建 | 第29-30页 |
| 第三章 株高与纤维品质QTL定位及候选基因功能注释 | 第30-63页 |
| 3.1 材料与方法 | 第30-31页 |
| 3.1.1 试验材料与种植方法 | 第30页 |
| 3.1.2 表型数据的获得与分析 | 第30页 |
| 3.1.3 QTL定位的方法 | 第30页 |
| 3.1.4 QTL定位结果与BSA联合分析 | 第30页 |
| 3.1.5 候选基因的筛选与注释 | 第30-31页 |
| 3.1.6 RNA提取和cDNA合成 | 第31页 |
| 3.1.7 实时荧光定量PCR | 第31页 |
| 3.2 结果与分析 | 第31-59页 |
| 3.2.1 株高及纤维品质表型数据分析 | 第31-37页 |
| 3.2.2 株高QTL定位的结果与分析 | 第37-42页 |
| 3.2.3 纤维品质QTL定位 | 第42-55页 |
| 3.2.4 纤维品质QTL候选区域内的基因功能注释 | 第55-59页 |
| 3.3 讨论与结论 | 第59-63页 |
| 3.3.1 株高与纤维品质各指标间的表型分析 | 第59页 |
| 3.3.2 株高QTL的精细定位 | 第59-60页 |
| 3.3.3 株高候选基因的功能注释分析 | 第60-61页 |
| 3.3.4 纤维品质相关QTL定位 | 第61页 |
| 3.3.5 纤维品质QTL区域内候选基因的挖掘 | 第61-63页 |
| 第四章 亲本及其他材料的抗盐性探讨 | 第63-68页 |
| 4.1 材料与方法 | 第63页 |
| 4.1.1 试验材料与方法 | 第63页 |
| 4.1.2 RNA提取及荧光定量PCR | 第63页 |
| 4.1.3 生理指标的测定方法 | 第63页 |
| 4.2 结果与分析 | 第63-66页 |
| 4.2.1 几个生理指标的测定 | 第63-65页 |
| 4.2.2 基因表达量的计算与分析 | 第65-66页 |
| 4.3 讨论与结论 | 第66-68页 |
| 4.3.1 盐胁迫对种子萌发的影响 | 第66页 |
| 4.3.2 不同基因的作用方式 | 第66-68页 |
| 第五章 全文结论 | 第68-69页 |
| 参考文献 | 第69-76页 |
| 附录 | 第76-77页 |
| 致谢 | 第77-78页 |
| 作者简历 | 第78页 |
