| 摘要 | 第6-7页 |
| abstract | 第7-8页 |
| 第一章 引言 | 第14-41页 |
| 1.1 黄单胞菌属概述 | 第14-30页 |
| 1.1.1 黄单胞菌属简介 | 第14-20页 |
| 1.1.2 检疫性黄单胞菌简介 | 第20-24页 |
| 1.1.3 检疫性黄单胞菌检测方法简介 | 第24-30页 |
| 1.2 DNA条形码概述 | 第30-36页 |
| 1.2.1 DNA条形码检测技术简介 | 第30-31页 |
| 1.2.2 细菌DNA条形码检测技术 | 第31-36页 |
| 1.3 数字PCR检测方法概述 | 第36-39页 |
| 1.3.1 数字PCR检测方法简介 | 第36-38页 |
| 1.3.2 数字PCR检测方法的应用 | 第38-39页 |
| 1.4 研究内容及目的意义 | 第39-41页 |
| 1.4.1 研究内容 | 第39页 |
| 1.4.2 目的及意义 | 第39-40页 |
| 1.4.3 技术路线 | 第40-41页 |
| 第二章 黄单胞菌属DNA条形码基因的筛选 | 第41-75页 |
| 2.1 实验材料与试剂 | 第41-51页 |
| 2.1.1 实验用菌株材料 | 第41-50页 |
| 2.1.2 主要试剂及仪器 | 第50-51页 |
| 2.2 实验方法 | 第51-54页 |
| 2.2.1 菌株培养及保存 | 第51页 |
| 2.2.2 供试菌株基因组DNA的提取 | 第51-52页 |
| 2.2.3 候选DNA条形码基因的选取 | 第52页 |
| 2.2.4 DNA条形码基因序列的测定 | 第52-53页 |
| 2.2.5 黄单胞菌属DNA条形码基因的评价与分析 | 第53-54页 |
| 2.3 结果与分析 | 第54-72页 |
| 2.3.1 候选DNA条形码基因的确定 | 第54-56页 |
| 2.3.2 候选DNA条形码基因扩增引物的筛选与设计 | 第56-59页 |
| 2.3.3 PCR扩增效率、测序成功率及序列信息 | 第59-61页 |
| 2.3.4 基于系统发育树的分析 | 第61-70页 |
| 2.3.5 基于遗传距离的分析 | 第70-72页 |
| 2.4 小结与讨论 | 第72-75页 |
| 第三章 黄单胞菌属DNA条形码方法验证与应用 | 第75-88页 |
| 3.1 实验材料与试剂 | 第75页 |
| 3.1.1 实验用病害材料 | 第75页 |
| 3.1.2 主要试剂及仪器 | 第75页 |
| 3.2 试验方法 | 第75-77页 |
| 3.2.1 病原菌的分离培养 | 第75页 |
| 3.2.2 利用DNA条形码方法进行病原菌鉴定 | 第75-76页 |
| 3.2.3 利用常规方法进行病原菌鉴定 | 第76-77页 |
| 3.3 结果与分析 | 第77-87页 |
| 3.3.1 柑橘上病原菌的鉴定 | 第77-81页 |
| 3.3.2 红掌上病原菌的鉴定 | 第81-84页 |
| 3.3.3 桃上病原菌的鉴定 | 第84-87页 |
| 3.4 小结与讨论 | 第87-88页 |
| 第四章 黄单胞菌属重要致病变种数字PCR检测体系的建立及应用 | 第88-107页 |
| 4.1 实验材料与试剂 | 第88-90页 |
| 4.1.1 实验用菌株及种子材料 | 第88-90页 |
| 4.1.2 主要试剂及仪器 | 第90页 |
| 4.2 试验方法 | 第90-93页 |
| 4.2.1 菌株培养及保存 | 第90页 |
| 4.2.2 供试菌株及样品DNA的提取 | 第90-91页 |
| 4.2.3 引物及探针的设计筛选 | 第91-92页 |
| 4.2.4 Bio-Rad数字PCR检测体系的建立 | 第92页 |
| 4.2.5 数字PCR检测方法特异性验证 | 第92页 |
| 4.2.6 数字PCR检测方法灵敏度验证 | 第92页 |
| 4.2.7 数字PCR检测方法重复性试验 | 第92-93页 |
| 4.2.8 种子样品的数字PCR检测 | 第93页 |
| 4.3 结果与分析 | 第93-105页 |
| 4.3.1 数字PCR检测引物及探针的筛选 | 第93-98页 |
| 4.3.2 数字PCR检测体系评价 | 第98-99页 |
| 4.3.3 数字PCR方法特异性检测结果 | 第99-100页 |
| 4.3.4 数字PCR方法灵敏度检测结果 | 第100-102页 |
| 4.3.5 数字PCR方法重复性分析 | 第102-103页 |
| 4.3.6 模拟带菌水稻种子样品的数字PCR检测 | 第103-105页 |
| 4.3.7 自然带菌水稻种子样品的数字PCR检测 | 第105页 |
| 4.4 小结与讨论 | 第105-107页 |
| 第五章 全文结论 | 第107-109页 |
| 参考文献 | 第109-119页 |
| 附录 | 第119-121页 |
| 致谢 | 第121-122页 |
| 作者简历 | 第122页 |
