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纳米孔在DNA及蛋白质分子检测应用中的关键技术研究

摘要第5-8页
Abstract第8-11页
第一章 绪论第16-36页
    1.1 课题的研究背景及意义第16-19页
    1.2 国内外研究现状第19-34页
        1.2.1 核酸分子的检测第19-31页
            1.2.1.1 DNA在溶液中的动力学行为研究第19-21页
            1.2.1.2 DNA过孔电流信号检测第21-27页
            1.2.1.3 DNA力信号的检测第27-29页
            1.2.1.4 控制并降低DNA的过孔速度第29-31页
        1.2.2 蛋白质折叠-解折叠研究第31-34页
            1.2.2.1 传统蛋白质折叠-解折叠研究方法第32页
            1.2.2.2 单分子检测方法在蛋白质折叠-解折叠研究中的应用第32-33页
            1.2.2.3 纳米孔技术在蛋白质折叠-解折叠检测中的应用第33-34页
    1.3 本文主要研究内容第34-36页
第二章 石墨烯纳米孔对DNA单碱基识别的可行性研究第36-49页
    2.1 引言第36页
    2.2 分子动力学模拟方法第36-39页
        2.2.1 分子动力学模拟简介第36-37页
        2.2.2 模型搭建及模拟细节第37-39页
    2.3 石墨烯纳米孔检测DNA分子可行性分析第39-44页
        2.3.1 石墨烯纳米孔开孔电流研究第39-40页
        2.3.2 双链DNA过孔阻塞离子电流研究第40-42页
        2.3.3 双链DNA过孔时间研究第42-44页
    2.4 石墨烯纳米孔对单链DNA均聚物的检测与辨识第44-47页
        2.4.1 单链DNA均聚物过孔离子电流检测第45-46页
        2.4.2 单链DNA均聚物过孔时间研究第46-47页
    2.5 本章小结第47-49页
第三章 纳米孔尺度对DNA过孔行为的影响第49-61页
    3.1 引言第49-50页
    3.2 实验准备工作及方法第50-51页
    3.3 氮化硅纳米孔尺寸对λ-DNA过孔的影响第51-54页
        3.3.1 λ-DNA过孔阻塞电流第51-53页
        3.3.2 λ-DNA的过孔时间第53-54页
    3.4 受限环境下DNA过孔的输运机理第54-59页
        3.4.1 孔径对poly(dT)_(30)过孔阻塞电流的影响第56-57页
        3.4.2 孔径对poly(dT)_(30)过孔时间的影响第57-59页
    3.5 本章小结第59-61页
第四章 柔性DNA均聚物在受限纳米孔内的动力学行为第61-70页
    4.1 引言第61-62页
    4.2 实验准备工作及方法第62-63页
    4.3 外加电势对poly(dT)_(20)捕获率的影响第63-64页
    4.4 外加电势对poly(dT)_(20)过孔阻塞电流幅值的影响第64-66页
    4.5 外加电势对poly(dT)_(20)过孔时间的影响第66-67页
    4.6 poly(dT)_(20)柔性结构研究第67-68页
    4.7 本章小结第68-70页
第五章 纳米孔接入电阻的影响机制第70-86页
    5.1 引言第70-71页
    5.2 实验准备工作及方法第71-73页
    5.3 探针扫描纳米孔区域对纳米孔离子电流的影响第73-76页
    5.4 探针工作模式对纳米孔接入电阻的影响第76-78页
    5.5 基于三维几何精度的阻塞电流理论模型第78-82页
    5.6 探针扫描速度对纳米孔接入电阻的影响第82-83页
    5.7 外加电势对纳米孔接入电阻的影响第83页
    5.8 纳米孔直径对作用长度的影响第83-84页
    5.9 本章小结第84-86页
第六章 基于原子力显微镜的DNA高精度操控过孔检测研究第86-98页
    6.1 引言第86-87页
    6.2 实验准备工作及方法第87-88页
    6.3 含巯基的poly(dT)_(130)在探针上的吸附表征第88-90页
    6.4 带巯基长链DNA的制备及表征第90-92页
    6.5 AFM探针操控DNA过孔研究第92-96页
    6.6 本章小结第96-98页
第七章 纳米孔对蛋白质折叠与解折叠的检测第98-117页
    7.1 引言第98-99页
    7.2 分子动力学模拟方法第99-102页
    7.3 纳米孔对蛋白质单一折叠态与解折叠态的检测与区分第102-107页
    7.4 蛋白质阻塞离子电流的理论计算模型第107-109页
    7.5 蛋白质取向性,离子溶液浓度及温度对纳米孔调制电流的影响第109-112页
    7.6 纳米孔对蛋白质折叠态-解折叠态的互变以及折叠中间态的实时检测第112-115页
    7.7 本章小结第115-117页
第八章 结论与展望第117-122页
    8.1 本文研究工作总结第117-120页
    8.2 未来工作展望第120-122页
致谢第122-124页
参考文献第124-136页
攻读博士学位期间发表学术论文第136-140页

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