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基于树核的蛋白质相互作用关系提取研究

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
第一章 绪论第11-18页
    1.1 研究背景和意义第11-13页
    1.2 相关研究工作第13-16页
        1.2.1 基于规则的方法第13-14页
        1.2.2 基于计算语言学的方法第14页
        1.2.3 基于机器学习的方法第14-16页
    1.3 本文的研究内容第16-17页
    1.4 本文的组织结构第17-18页
第二章 蛋白质关系提取相关知识第18-34页
    2.1 PPI提取基本概念第18-19页
    2.2 支撑技术第19-21页
    2.3 相关资源及工具第21-31页
        2.3.1 PPI语料库第21-22页
        2.3.2 句法分析器第22-25页
        2.3.3 SVM分类器第25-27页
        2.3.4 卷积树核函数第27-31页
    2.4 实验方法及评价标准第31-34页
        2.4.1 k倍交叉验证法第31-32页
        2.4.2 常用性能评价标准第32-34页
第三章 有效优化路径指导的成分分析树算法EOP-CPT第34-51页
    3.1 SDP-CPT算法描述第34-39页
    3.2 SDP-CPT算法同位语依存关系的噪音问题第39-41页
    3.3 EOP-CPT算法描述第41-45页
    3.4 实验结果及分析第45-51页
        3.4.1 语料库预处理第45-48页
        3.4.2 实验方法及设置第48页
        3.4.3 与其他PPI提取系统在AIMed语料库上的性能比较第48-49页
        3.4.4 与其他PPI提取系统在多个语料库上的性能比较第49-50页
        3.4.5 交叉语料库实验第50-51页
第四章 有效优化和扩展路径指导的成分分析树算法EOEP-CPT第51-61页
    4.1 SDP-CPT算法关键动词遗漏问题第51-52页
    4.2 EOEP-CPT算法描述第52-56页
    4.3 实验及结果分析第56-61页
        4.3.1 参数c对PPI提取性能的影响第56-57页
        4.3.2 与其他成分句法树结构的比较第57-59页
        4.3.3 与其他PPI提取系统在AIMed语料库上的性能比较第59页
        4.3.4 与其他PPI提取系统在多个语料库上的性能比较第59-60页
        4.3.5 交叉语料库实验第60-61页
第五章 总结与展望第61-63页
    5.1 本文的工作总结第61-62页
    5.2 下一步的工作展望第62-63页
参考文献第63-68页
在校期间发表的论文和参加的科研项目第68-69页
致谢第69页

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