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稻瘟病菌中假定Rho-GEF蛋白MoRgf1的功能研究

摘要第7-8页
ABSTRACT第8-9页
第一部分 引言第10-20页
    1 小GTP结合蛋白第10-13页
        1.1 小G蛋白的结构第10页
        1.2 小G蛋白的分类第10-11页
        1.3 小G蛋白的定位第11-12页
        1.4 小G蛋白的调控机理第12-13页
            1.4.1 鸟苷酸转换因子(Guanine nucleotide exchange factors-GEFs)第12页
            1.4.2 GTP酶激活蛋白(GTPase activating proteins-GAPs)第12-13页
            1.4.3 鸟苷酸解离抑制因子(Guanine nucleotide dissociation inhibitors-GDIs)第13页
    2 Rho族蛋白及RhoGEF蛋白第13-17页
        2.1 Rho族蛋白结构第13-14页
        2.2 Rho族蛋白的生物学功能第14-15页
        2.3 真菌中的Rho蛋白及RhoGEF蛋白的研究第15-17页
    3 稻瘟病及稻瘟病菌第17-18页
        3.1 稻瘟病第17-18页
        3.2 稻瘟病菌及其侵染致病过程第18页
    4 稻瘟病菌Rho族蛋白及其GEF蛋白的研究意义第18-20页
第二部分 材料与方法第20-34页
    1 实验材料第20-23页
        1.1 细菌菌株以及稻瘟病菌菌株第20页
        1.2 各类培养基第20-22页
            1.2.1 E.coli DH5α细菌培养基第20页
            1.2.2 表达培养基(固体)第20-21页
            1.2.3 表达培养基(液体)第21页
            1.2.4 CM培养基第21页
            1.2.5 淀粉酵母培养基(SYM)第21页
            1.2.6 米糠培养基第21-22页
            1.2.7 TB3培养基第22页
            1.2.8 SD培养基第22页
            1.2.9 YPDA培养基(100mL)第22页
        1.3 生化试剂第22-23页
        1.4 抗生素第23页
        1.5 植物材料第23页
    2 实验方法第23-34页
        2.1 生物信息学分析第23-24页
            2.1.1 Morgf1与其它真菌Rho-GEF系统进化关系的分析第23页
            2.1.2 蛋白结构域的分析第23-24页
        2.2 常规PCR第24页
        2.3 PCR产物的克隆第24页
        2.4 质粒酶切与连接第24-25页
        2.5 DNA的琼脂糖电泳第25-26页
        2.6 DNA片段的凝胶回收第26页
        2.7 质粒DNA的提取第26-27页
        2.8 E.coil DH5α感受态细胞的制备第27页
        2.9 大肠杆菌转化第27-28页
        2.10 稻瘟病菌原生质体制备和转化第28页
        2.11 稻瘟病菌基因组DNA的提取第28-29页
        2.12 Southern杂交第29-32页
            2.12.1 DNA转印第29页
            2.12.2 探针的扩增第29页
            2.12.3 探针的标记第29-30页
            2.12.4 探针标记效价的检测第30-31页
            2.12.5 杂交及洗膜第31页
            2.12.6 免疫显色第31-32页
        2.13 酵母双杂交第32页
            2.13.1 AH109感受态细胞的制备第32页
            2.13.2 重组质粒的转化第32页
        2.14 互补载体的构建第32页
        2.15 稻瘟病菌生长速率的测定第32-33页
        2.16 菌丝隔膜染色及观察第33页
        2.17 分生孢子梗的观察第33页
        2.18 水稻及大麦致病性鉴定第33-34页
第三部分 结果及分析第34-47页
    1 生物信息学分析第34-38页
        1.1 稻瘟病菌中MoRgf1(MGG_03064)蛋白结构及功能的预测第34-35页
        1.2 MoRgf1(MGG_03064)在真菌中同源蛋白序列的比对、同源蛋白结构域的比对以及系统演化分析第35-37页
        1.3 分子量及等电点的预测分析第37-38页
    2 稻瘟病菌中MoRGF1(MGG_03064)的功能分析第38-46页
        2.1 MoRGF1敲除突变体的获得及PCR验证第38-39页
        2.2 Southern杂交验证敲除突变体第39-40页
        2.3 功能互补突变体的获得及鉴定第40页
        2.4 突变体表型分析第40-46页
    3 酵母双杂交第46-47页
第四部分 小结与讨论第47-50页
    1 稻瘟病菌中MoRgf1蛋白的生物信息学分析第47页
    2 稻瘟病菌中MoRGF1突变体表型分析中Rho1功能的体现第47-48页
    3 进一步研究的展望第48-50页
参考文献第50-62页
附表第62-63页
致谢第63页

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