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新疆阿克苏盐矿嗜盐微生物多相分类和基因组研究

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
第一章 绪论第16-44页
    1.1 新疆阿克苏地区盐矿环境概况第16-17页
    1.2 嗜盐微生物的定义和研究意义第17-25页
        1.2.1 嗜盐微生物的定义第17-18页
        1.2.2 嗜盐细菌第18-19页
        1.2.3 嗜盐古菌第19-22页
        1.2.4 嗜盐微生物的嗜盐机制研究第22-23页
        1.2.5 嗜盐微生物的研究意义第23-25页
    1.3 微生物多相分类研究方法第25-37页
        1.3.1 表型研究第26-27页
        1.3.2 化学分类研究第27-32页
        1.3.3 基因型研究第32-37页
    1.4 嗜盐古菌基因组学研究现状第37-42页
        1.4.1 嗜盐古菌适应高盐环境的基因组特点第38-39页
        1.4.2 嗜盐古菌对抗高辐射环境的基因组特点第39-41页
        1.4.3 嗜盐古菌基因组G+C含量特点第41-42页
        1.4.4 嗜盐古菌代谢途径特点第42页
    1.5 本研究的目的和意义第42-44页
第二章 新疆阿克苏盐矿嗜盐微生物资源研究第44-59页
    2.1 材料和方法第44-51页
        2.1.1 样品来源第44-45页
        2.1.2 实验仪器与试剂第45-46页
        2.1.3 菌株分离培养基第46-47页
        2.1.4 菌株的富集、分离与保藏第47-48页
        2.1.5 16S rRNA基因序列信息分析第48-51页
    2.2 结果与讨论第51-58页
        2.2.1 细菌菌株的分离结果与多样性分析第51-55页
        2.2.2 嗜盐古菌的分离与多样性分析第55-58页
    2.3 本章小结第58-59页
第三章 新疆阿克苏盐矿来源的嗜盐菌多相分类学研究第59-118页
    3.1 材料和方法第59-79页
        3.1.1 菌株来源第59-60页
        3.1.2 实验仪器与试剂第60-62页
        3.1.3 培养基第62页
        3.1.4 菌株保藏第62页
        3.1.5 表型特征第62-69页
        3.1.6 化学分类特征第69-73页
        3.1.7 基因型特征第73-79页
    3.2 结果与讨论第79-115页
        3.2.1 Halolamina属菌株的多相分类学研究第79-88页
        3.2.2 Halopiger属菌株的多相分类学研究第88-94页
        3.2.3 Halopelagius属菌株的多相分类学研究第94-99页
        3.2.4 Aquibacillus属菌株的多相分类学研究第99-107页
        3.2.5 Bacillus属菌株的多相分类学研究第107-115页
    3.3 本章小结第115-118页
第四章 嗜盐古菌Halopiger salifodinae KCY07-B2~T的基因组分析第118-137页
    4.1 材料和方法第118-120页
        4.1.1 菌株第118页
        4.1.2 嗜盐古菌基因组DNA的提取和检测第118-119页
        4.1.3 基因组测序及分析第119-120页
    4.2 结果与讨论第120-134页
        4.2.1 嗜盐古菌Hpg.salifodinae KCY07-B2~T的基因组基本特征第120-122页
        4.2.2 基因功能注释分析第122-125页
        4.2.3 渗透压胁迫耐受第125-128页
        4.2.4 DNA修复相关基因第128-133页
        4.2.5 CRISPRs序列分析第133-134页
    4.3 本章小结第134-137页
第五章 结论与展望第137-139页
    5.1 结论第137-138页
    5.2 展望第138-139页
附录Ⅰ第139-143页
参考文献第143-154页
攻读学位期间发表的学术论文(含待发表)第154-155页
致谢第155-156页

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