| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-29页 |
| 1.1 猪骨骼肌生长发育的研究 | 第11-14页 |
| 1.1.1 猪骨骼肌的发育特点 | 第11页 |
| 1.1.2 骨骼肌发育的调节 | 第11-14页 |
| 1.2 影响肉品质的主要因素 | 第14-15页 |
| 1.2.1 品种和性别 | 第14-15页 |
| 1.2.2 年龄和营养 | 第15页 |
| 1.3 猪骨骼肌生长发育相关的研究进展 | 第15-16页 |
| 1.4 评价肉品质的主要指标 | 第16-19页 |
| 1.4.1 pH值 | 第16-17页 |
| 1.4.2 猪肉系水力 | 第17页 |
| 1.4.3 肉的嫩度 | 第17-18页 |
| 1.4.4 肌肉中的脂肪含量 | 第18-19页 |
| 1.5 肉质性状分子遗传学的研究 | 第19-20页 |
| 1.6 转录组分析研究进展 | 第20-25页 |
| 1.6.1 转录组测序(RNA-seq)原理 | 第20-21页 |
| 1.6.2 转录组测序技术平台 | 第21-23页 |
| 1.6.3 转录组测序的应用 | 第23-25页 |
| 1.7 蛋白质组分析研究进展 | 第25-28页 |
| 1.7.1 蛋白质组学研究方法 | 第25-27页 |
| 1.7.2 蛋白质组学在肉质科学中的应用 | 第27-28页 |
| 1.8 研究目的意义 | 第28-29页 |
| 第二章 沙子岭猪与大白猪肌肉转录组学研究 | 第29-47页 |
| 2.1 材料与方法 | 第29-35页 |
| 2.1.1 试验动物 | 第29页 |
| 2.1.2 主要仪器及试剂 | 第29页 |
| 2.1.3 总RNA提取 | 第29-30页 |
| 2.1.4 总RNA质量检测 | 第30页 |
| 2.1.5 cDNA文库构建与测序 | 第30-33页 |
| 2.1.6 转录组测序原始数据质控 | 第33-34页 |
| 2.1.7 转录本的拼接、注释及表达水平统计 | 第34-35页 |
| 2.2. 结果与分析 | 第35-45页 |
| 2.2.1 背最长肌RNA提取质量检测 | 第35-36页 |
| 2.2.2 测序结果质控分析 | 第36页 |
| 2.2.3 数据预处理结果 | 第36-37页 |
| 2.2.4 De novo拼接结果 | 第37-38页 |
| 2.2.5 转录本功能注释 | 第38-39页 |
| 2.2.6 GO功能分类 | 第39-41页 |
| 2.2.7 KOG功能分类 | 第41-42页 |
| 2.2.8 KEGG通路分析 | 第42页 |
| 2.2.9 SSR重复序列注释 | 第42页 |
| 2.2.10 差异表达基因统计结果 | 第42-45页 |
| 2.3 讨论 | 第45-47页 |
| 2.3.1 测序质量的评估与转录本组装 | 第45页 |
| 2.3.2 GO、KOG及KEGG分析 | 第45-46页 |
| 2.3.3 差异表达基因的相关分析 | 第46-47页 |
| 第三章 沙子岭猪与大白猪肌肉组织差异蛋白组学研究 | 第47-64页 |
| 3.1 材料与方法 | 第47-51页 |
| 3.1.1 试验材料 | 第47页 |
| 3.1.2 主要仪器与试剂 | 第47-48页 |
| 3.1.3 试验方法 | 第48-51页 |
| 3.2 结果与分析 | 第51-62页 |
| 3.2.1 蛋白质定量 | 第51页 |
| 3.2.2 沙子岭猪与大白猪背最长肌差异蛋白组学分析 | 第51-56页 |
| 3.2.3 不同品种间差异蛋白的鉴定 | 第56页 |
| 3.2.4 差异蛋白GO分析 | 第56-62页 |
| 3.3 讨论 | 第62-64页 |
| 3.3.1 差异蛋白选取及鉴定 | 第62页 |
| 3.3.2 差异蛋白主要功能 | 第62-64页 |
| 第四章 沙子岭猪与大白猪部分差异表达基因的验证 | 第64-69页 |
| 4.1 材料与方法 | 第64-66页 |
| 4.1.1 试验材料 | 第64页 |
| 4.1.2 主要试剂 | 第64页 |
| 4.1.3 主要仪器及耗材 | 第64页 |
| 4.1.4 RNA提取 | 第64页 |
| 4.1.5 引物设计 | 第64-65页 |
| 4.1.6 cDNA第一链合成 | 第65页 |
| 4.1.7 实时荧光定量PCR | 第65-66页 |
| 4.2 结果与分析 | 第66-68页 |
| 4.2.1 qRT-PCR熔解曲线结果 | 第66-67页 |
| 4.2.2 差异表达基因的qRT-PCR结果 | 第67-68页 |
| 4.3 讨论 | 第68-69页 |
| 第五章 猪NR1H4基因克隆及表达分析 | 第69-82页 |
| 5.1 材料与方法 | 第69-74页 |
| 5.1.1 试验材料 | 第69页 |
| 5.1.2 试验方法 | 第69-74页 |
| 5.2 结果与分析 | 第74-80页 |
| 5.2.1 猪NR1H4基因cDNA全长序列及特征分析 | 第74-75页 |
| 5.2.2 氨基酸序列比对及系统进化分析 | 第75-78页 |
| 5.2.3 NR1H4蛋白结构及理化性质分析 | 第78-79页 |
| 5.2.4 SNP检测及酶切结果 | 第79-80页 |
| 5.2.5 猪NR1H4基因的组织表达分析 | 第80页 |
| 5.3 讨论 | 第80-82页 |
| 第六章 猪JAZF1基因克隆及表达分析 | 第82-89页 |
| 6.1 材料与方法 | 第82-83页 |
| 6.1.1 试验材料与方法 | 第82页 |
| 6.1.2 引物设计 | 第82页 |
| 6.1.3 目的基因cDNA合成及RACE扩增 | 第82-83页 |
| 6.2 结果与分析 | 第83-87页 |
| 6.2.1 猪JAZF1基因cDNA全长序列及特征分析 | 第83-84页 |
| 6.2.2 猪JAZF1基因同源性分析和系统发育树分析 | 第84-85页 |
| 6.2.3 猪JAZF1蛋白结构分析 | 第85-87页 |
| 6.3 讨论 | 第87-89页 |
| 第七章 结论 | 第89-91页 |
| 7.1 主要结论 | 第89页 |
| 7.2 主要创新点 | 第89-90页 |
| 7.3 下一步研究工作 | 第90-91页 |
| 参考文献 | 第91-108页 |
| 附录 | 第108-121页 |
| 主要英文对照缩略表 | 第121-122页 |
| 致谢 | 第122-123页 |
| 作者简介 | 第123-124页 |
