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假丝酵母(Candida sp.)99-125胞外脂肪酶的基因克隆、重组表达以及N-糖基化对脂肪酶功能影响的研究

学位论文数据集第3-4页
摘要第4-8页
ABSTRACT第8-11页
第一章 文献综述第16-53页
    1.1 脂肪酶简介第16-17页
    1.2 微生物脂肪酶的生产第17-20页
    1.3 微生物脂肪酶的纯化和性质第20-24页
        1.3.1 细菌脂肪酶的纯化第20-21页
        1.3.2 酵母脂肪酶的纯化第21-22页
        1.3.3 真菌脂肪酶的纯化第22-24页
    1.4 微生物脂肪酶基因的克隆第24-29页
        1.4.1 真菌脂肪酶第24-27页
        1.4.2 细菌脂肪酶第27-29页
    1.5 脂肪酶的重组表达第29-33页
        1.5.1 表达系统的比较第29-31页
            1.5.1.1 原核表达系统第29-30页
            1.5.1.2 真核表达系统第30-31页
        1.5.2 前肽对表达的影响第31-32页
        1.5.3 遗传密码识别的差异第32页
        1.5.4 N-糖基化对脂肪酶的影响第32-33页
    1.6 脂肪酶的空间结构第33-37页
    1.7 脂肪酶的应用第37-39页
    1.8 本课题的设计思路和研究内容第39页
    参考文献第39-53页
第二章 Candida sp.99-125胞外脂肪酶的分离纯化和性质分析第53-82页
    2.1 前言第53页
    2.2 材料和方法第53-63页
        2.2.1 材料和设备第53-54页
        2.2.2 试验方法第54-63页
            2.2.2.1 脂肪酶活性的测定第54页
            2.2.2.2 蛋白质浓度测定第54-55页
            2.2.2.3 粗酶粉的制备第55页
            2.2.2.4 离子交换层析第55-56页
            2.2.2.5 疏水层析第56页
            2.2.2.6 超滤第56页
            2.2.2.7 脂肪酶糖基化分析第56-57页
            2.2.2.8 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)第57页
            2.2.2.9 非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)第57-58页
            2.2.2.10 脂肪酶等电聚焦分析第58-59页
            2.2.2.11 橄榄油—罗丹明(Rhodamine)平板脂肪酶活性分析第59页
            2.2.2.12 双向电泳第59-60页
            2.2.2.13 N—末端氨基酸残基的测定第60-61页
            2.2.2.14 脂肪酶的MALDI—TOF质谱检测第61-62页
            2.2.2.15 温度对脂肪酶活性和稳定性的影响第62页
            2.2.2.16 pH对脂肪酶活性和稳定性的影响第62页
            2.2.2.17 有机溶剂对脂肪酶活性的影响第62-63页
            2.2.2.18 不同的金属离子对脂肪酶活性的影响第63页
            2.2.2.19 不同表面活性剂和酶抑制剂对脂肪酶活性的影响第63页
            2.2.2.20 脂肪酶对几种油脂的活性第63页
    2.3 结果与讨论第63-80页
        2.3.1 脂肪酶的分离纯化第63-68页
            2.3.1.1 粗酶粉的制备第63页
            2.3.1.2 离子交换层析第63-65页
            2.3.1.3 疏水层析第65-68页
        2.3.2 脂肪酶同工酶的鉴定和分离第68-70页
            2.3.2.1 非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)第68页
            2.3.2.2 等电聚焦电泳(IEF)第68-69页
            2.3.2.3 双向电泳第69-70页
        2.3.3 脂肪酶同工酶的原因分析第70-75页
            2.3.3.1 N—端氨基酸的测序第70页
            2.3.3.2 MALDI—TOF质谱分析第70-73页
            2.3.3.3 脂肪酶N—糖基化分析第73-75页
        2.3.4 脂肪酶的性质第75-80页
            2.3.4.1 温度对脂肪酶活性和稳定的影响第75-76页
            2.3.4.2 pH对脂肪酶活性和稳定性的影响第76-77页
            2.3.4.3 极性有机溶剂对脂肪酶活性的影响第77-78页
            2.3.4.4 不同金属离子对脂肪酶活性的影响第78页
            2.3.4.5 表面活性剂和抑制剂对脂肪酶活性的影响第78-79页
            2.3.4.6 脂肪酶对几种油脂的活性第79-80页
    2.4 小结第80页
    参考文献第80-82页
第三章 Candida sp.99—125胞外脂肪酶基因的克隆和在毕赤酵母中的表达第82-113页
    3.1 前言第82页
    3.2 材料与方法第82-96页
        3.2.1 菌株和质粒第82页
        3.2.2 试剂和试剂盒第82-83页
        3.2.3 培养基第83页
        3.2.4 试验方法第83-96页
            3.2.4.1 酵母基因组的提取第83-84页
            3.2.4.2 PCR扩增脂肪酶基因第84-85页
            3.2.4.3 从琼脂糖凝胶中回收DNA片段第85-86页
            3.2.4.4 重组质粒pPICZaA-CLlip的构建第86-87页
            3.2.4.5 重组质粒的大肠杆菌电转化第87-88页
            3.2.4.6 大肠杆菌阳性克隆的筛选第88-89页
            3.2.4.7 重组质粒序列分析第89页
            3.2.4.8 重组质粒的酶切线性化第89-90页
            3.2.4.9 毕赤酵母感受态细胞制备第90页
            3.2.4.10 毕赤酵母电转化第90-91页
            3.2.4.11 高浓度抗生素平板筛选第91页
            3.2.4.12 产脂肪酶重组子的平板筛选第91页
            3.2.4.13 产脂肪酶重组子的摇瓶筛选第91-92页
            3.2.4.14 生物量的测定第92页
            3.2.4.15 脂肪酶活性测定第92页
            3.2.4.16 重组蛋白的SDS-PAGE分析第92-93页
            3.2.4.17 Southern Blot杂交分析第93-95页
            3.2.4.18 生物信息学分析所用的软件和网址第95-96页
    3.3 结果与讨论第96-111页
        3.3.1 胞外脂肪酶基因(ClLip)的克隆第96-97页
            3.3.1.1 Candida sp.99—125基因组的提取第96页
            3.3.1.2 ClLip基因的PCR扩增第96-97页
            3.3.1.3 重组子的筛选和鉴定第97页
        3.3.2 ClLip序列分析第97-101页
        3.3.3 ClLip空间结构的模拟第101-102页
        3.3.4 毕赤酵母表达ClLip脂肪酶第102-111页
            3.3.4.1 重组酵母产脂肪酶平板筛选第102-104页
            3.3.4.2 重组酵母产脂肪酶的摇瓶筛选第104-107页
            3.3.4.3 2L摇瓶中脂肪酶的诱导表达第107-109页
            3.3.4.4 Southern blot分析第109-111页
    3.4 小结第111-112页
    参考文献第112-113页
第四章 重组脂肪酶的毕赤酵母发酵生产、纯化以及性质分析第113-135页
    4.1 前言第113页
    4.2 材料和方法第113-118页
        4.2.1 菌种第113页
        4.2.2 材料和设备第113-114页
        4.2.3 培养基第114页
        4.2.4 试验方法第114-118页
            4.2.4.1 发酵种子液的培养第114页
            4.2.4.2 通过溶氧控制发酵过程第114-115页
            4.2.4.3 恒定甲醇浓度的发酵过程第115页
            4.2.4.4 菌体生长情况监测第115页
            4.2.4.5 重组脂肪酶rClLip的分离纯化第115-116页
            4.2.4.6 温度和pH对重组脂肪酶活性和稳定性的影响第116页
            4.2.4.7 重组脂肪酶的底物特异性第116-117页
            4.2.4.8 重组脂肪酶酯化选择性第117-118页
            4.2.4.9 重组脂肪酶的去糖基化分析第118页
    4.3 结果与讨论第118-131页
        4.3.1 溶氧控制甲醇流加发酵生产脂肪酶rClLip第118-121页
        4.3.2 恒定甲醇浓度的发酵过程第121-125页
        4.3.3 重组脂肪酶rClLip分离纯化第125-126页
        4.3.4 重组脂肪酶rClLip性质分析第126-131页
            4.3.4.1 温度对rClLip的活性和稳定性的影响第126-127页
            4.3.4.2 pH对rClLip活性和稳定性的影响第127-128页
            4.3.4.3 rClLip的底物特异性第128-129页
            4.3.4.4 酯化选择性第129-130页
            4.3.4.5 重组脂肪酶的N-糖基化分析第130-131页
    4.4 rClLip与ClLip性质的比较第131-133页
    4.5 小结第133页
    参考文献第133-135页
第五章 N-糖基化对脂肪酶分泌和酶学性质的影响第135-150页
    5.1 前言第135页
    5.2 材料和方法第135-140页
        5.2.1 菌种与质粒第135页
        5.2.2 试剂和试剂盒第135-136页
        5.2.3 培养基第136页
        5.2.4 引物第136-137页
        5.2.5 试验方法第137-140页
            5.2.5.1 脂肪酶基因的定点突变第137-139页
            5.2.5.2 突变基因的重组质粒的构建第139页
            5.2.5.3 重组质粒的大肠杆菌电转化第139页
            5.2.5.4 重组质粒线性化和毕赤酵母的转化第139页
            5.2.5.5 产脂肪酶重组子的筛选第139页
            5.2.5.6 突变脂肪酶的纯化第139-140页
            5.2.5.7 突变脂肪酶性质分析第140页
    5.3 结果与讨论第140-147页
        5.3.1 脂肪酶基因的定点突变第140-142页
        5.3.2 突变脂肪酶的分子量分析第142-143页
        5.3.3 N-糖基化对脂肪酶分泌的影响第143-144页
        5.3.4 突变脂肪酶的温度稳定性分析第144-146页
        5.3.5 酶动力学参数的分析第146-147页
    5.4 小结第147-148页
    参考文献第148-150页
第六章 结论第150-153页
本论文创新点第153-154页
问题与建议第154-155页
附录第155-163页
研究成果及发表的学术论文第163-164页
致谢第164-165页
作者和导师简介第165页

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