| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第—章 文献综述及研究意义 | 第10-22页 |
| 1.1 海洋微生物物种多样性 | 第10-13页 |
| 1.1.1 海洋微生物物种多样性概述 | 第10-11页 |
| 1.1.2 海洋微生物物种多样性的研究现状 | 第11-12页 |
| 1.1.3 海洋细菌物种多样性的研究意义 | 第12-13页 |
| 1.2 响应面法优化分菌条件 | 第13-17页 |
| 1.2.1 分离培养条件影响可培养微生物的多样性 | 第13页 |
| 1.2.2 海洋沉积环境微生物纯培养方法概述 | 第13-17页 |
| 1.2.3 Box-Behnken方法的优势 | 第17页 |
| 1.3 链霉菌类群的MLSA分析 | 第17-18页 |
| 1.3.1 海洋链霉菌简述 | 第17-18页 |
| 1.3.2 MLSA简介 | 第18页 |
| 1.4 本文的研究意义、主要内容和创新点 | 第18-20页 |
| 1.5 技术路线 | 第20-22页 |
| 第二章 样品纯培养分离条件的优化 | 第22-34页 |
| 2.1 材料和方法 | 第22-25页 |
| 2.1.1 样品来源及分离方法 | 第22页 |
| 2.1.2 优化因素选择及优化设计 | 第22-25页 |
| 2.2 结果与讨论 | 第25-33页 |
| 2.2.1 Box-Behnken 优化数据处理 | 第25-28页 |
| 2.2.2 等值线及曲面图分析 | 第28-32页 |
| 2.2.3 响应优化分析 | 第32-33页 |
| 2.3 本章小结 | 第33-34页 |
| 第三章 印度洋部分深海沉积物可培养细菌多样性研究 | 第34-54页 |
| 3.1 材料与方法 | 第34-37页 |
| 3.1.1 样品来源 | 第34-35页 |
| 3.1.2 培养基 | 第35-37页 |
| 3.1.3 DNA提取、16S rRNA扩增及测序 | 第37页 |
| 3.1.4 基于16S rRNA基因的系统发育分析 | 第37页 |
| 3.2 结果与讨论 | 第37-53页 |
| 3.2.1 菌株的分离结果 | 第37-42页 |
| 3.2.2 菌株的系统分布情况 | 第42-45页 |
| 3.2.3 不同样点的菌株多样性比较 | 第45-46页 |
| 3.2.4 菌株的多样性与分离培养基及海洋深度的关系 | 第46-48页 |
| 3.2.5 潜在新的分类单元 | 第48-49页 |
| 3.2.6 菌株的系统发育分析 | 第49-53页 |
| 3.3 本章小结 | 第53-54页 |
| 第四章 潜在新物种的多相分类 | 第54-68页 |
| 4.1 材料与方法 | 第54-56页 |
| 4.1.1 实验菌株 | 第54页 |
| 4.1.2 分子分类实验 | 第54页 |
| 4.1.3 形态学实验 | 第54-55页 |
| 4.1.4 生理生化实验 | 第55页 |
| 4.1.5 化学分类实验 | 第55-56页 |
| 4.2 结果与讨论 | 第56-66页 |
| 4.2.1 新属YIM M12140~T的确定 | 第56-59页 |
| 4.2.2 新种YIM M12148~T的确定 | 第59-62页 |
| 4.2.3 新种YIM M13062~T的确定 | 第62-66页 |
| 4.3 本章小结 | 第66-68页 |
| 第五章 链霉菌的多序列位点分析(MLSA) | 第68-96页 |
| 5.1 材料与方法 | 第68-73页 |
| 5.1.1 实验菌株 | 第68-70页 |
| 5.1.2 管家基因引物的选择及扩增条件 | 第70-71页 |
| 5.1.3 管家基因的获得、纯化、克隆及测序 | 第71-73页 |
| 5.1.4 管家基因基因类型比对 | 第73页 |
| 5.1.5 管家基因及串联后系统进化树的构建 | 第73页 |
| 5.2 结果与讨论 | 第73-93页 |
| 5.2.1 部分菌株的基因比对结果 | 第73-75页 |
| 5.2.2 Streptomyces pratensis相似菌株的MLSA分析 | 第75-86页 |
| 5.2.3 32株链霉菌的MLSA分析 | 第86-91页 |
| 5.2.4 全部60株链霉菌MLSA分析与16S rRNA分析比较 | 第91-93页 |
| 5.3 本章小结 | 第93-96页 |
| 总结与展望 | 第96-98页 |
| 参考文献 | 第98-104页 |
| 硕士期间成果 | 第104-106页 |
| 致谢 | 第106页 |
