| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第1章 绪论 | 第14-19页 |
| 1.1 研究背景 | 第14-17页 |
| 1.1.1 桑树简介 | 第14页 |
| 1.1.2 桑树扦插繁育现状 | 第14-15页 |
| 1.1.3 扦插不定根形成的研究进展 | 第15-16页 |
| 1.1.4 生根相关转录因子的研究进展 | 第16-17页 |
| 1.1.5 转录组测序 | 第17页 |
| 1.1.6 MYB家族基因的研究现状 | 第17页 |
| 1.2 研究目的及意义 | 第17-18页 |
| 1.3 研究内容 | 第18-19页 |
| 1.3.1 基于Illumina Solexa转录组测序分析桑树硬枝扦插关键基因与信号通路 | 第18页 |
| 1.3.2 桑树MYB基因家族的综合研究 | 第18-19页 |
| 第2章 桑树硬枝扦插转录组数据分析 | 第19-39页 |
| 2.1 材料选取 | 第19-20页 |
| 2.2 实验步骤 | 第20-21页 |
| 2.2.1 转录组数据构建 | 第20-21页 |
| 2.2.2 转录组数据分析方案 | 第21页 |
| 2.3 转录组数据结果分析 | 第21-34页 |
| 2.3.1 数据预处理与质量检测 | 第21-22页 |
| 2.3.2 重叠群的长度分布统计 | 第22-23页 |
| 2.3.3 蛋白注释 | 第23页 |
| 2.3.4 GO基因注释与功能分类 | 第23-25页 |
| 2.3.5 KEGG代谢途径分类 | 第25-26页 |
| 2.3.6 差异基因分析 | 第26-32页 |
| 2.3.7 转录组数据验证 | 第32-34页 |
| 2.4 讨论 | 第34-39页 |
| 第3章 桑树MYB基因家族的综合分析 | 第39-53页 |
| 3.1 扦插材料处理 | 第39-40页 |
| 3.2 MYB基因鉴定方案 | 第40页 |
| 3.3 实验方法 | 第40-46页 |
| 3.3.1 材料与试剂 | 第40-41页 |
| 3.3.2 桑树组织总RNA提取 | 第41-42页 |
| 3.3.3 反转录cDNA文库构建 | 第42页 |
| 3.3.4 普通PCR克隆与扩增 | 第42-43页 |
| 3.3.5 目的片段回收 | 第43页 |
| 3.3.6 感受态细胞制备与目的片段的链接转化 | 第43-44页 |
| 3.3.7 实时荧光定量分析 | 第44-46页 |
| 3.4 结果与分析 | 第46-53页 |
| 3.4.1 基因鉴定和MYB家族基因保守结构域分析 | 第46-48页 |
| 3.4.2 桑树扦插生根中R2R3-MYB基因的表达分析 | 第48-50页 |
| 3.4.3 外源激素处理下插穗生长过程中R2R3-MYB基因表达水平的变化趋势 | 第50-53页 |
| 结论 | 第53-55页 |
| 参考文献 | 第55-64页 |
| 附录 | 第64-65页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第65-66页 |
| 致谢 | 第66页 |
