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中国西南地区蘑菇属(Agaricus)真菌分子系统研究及地理分布

中文摘要第9-11页
Abstract第11-13页
缩略语表第14-15页
1 前言第15-26页
    1.1 蘑菇属真菌的重要性第15-17页
        1.1.1 蘑菇属真菌的食用价值第15-16页
        1.1.2 蘑菇属真菌的药用价值第16-17页
        1.1.3 蘑菇属真菌的生态价值第17页
    1.2 蘑菇属真菌研究第17-25页
        1.2.1 蘑菇属的由来第17页
        1.2.2 蘑菇属研究历史及种类第17-18页
        1.2.3 蘑菇属真菌表型特征第18-19页
        1.2.4 蘑菇属真菌形态分类系统第19-22页
        1.2.5 蘑菇属真菌分子系统学研究第22-25页
            1.2.5.1 分子系统学的定义及必要性第22-23页
            1.2.5.2 分子系统学的研究方法和程序第23页
            1.2.5.3 核糖体DNA的特点第23-24页
            1.2.5.4 蘑菇属分子系统学第24-25页
        1.2.6 蘑菇属真菌分子系统分支和表型相关性第25页
    1.3 蘑菇属真菌土壤养分特性研究第25页
    1.4 蘑菇属真菌系统学研究存在的问题第25-26页
    1.5 研究目的与意义第26页
2 材料与方法第26-43页
    2.1 实验材料第26-33页
        2.1.1 供试标本第26-27页
        2.1.2 主要试剂及配制方法第27-33页
        2.1.3 主要设备第33页
    2.2 实验方法第33-43页
        2.2.0 标本野外采集及记录第33-34页
        2.2.1 标本借阅第34页
        2.2.2 室内显微结构观察第34-39页
        2.2.3 标本总DNA提取第39-40页
            2.2.3.1 采用试剂盒提取第39-40页
            2.2.3.2 常规的CTAB方法第40页
            2.2.3.3 模板DNA的检测第40页
        2.2.4 ITS序列的PCR扩增第40-41页
            2.2.4.1 引物第40-41页
            2.2.4.2 PCR扩增反应体系配制第41页
            2.2.4.3 PCR扩增及测序第41页
            2.2.4.4 PCR产物的检测第41页
        2.2.5 分子系统学分析第41-43页
            2.2.5.1 序列分析第41-42页
            2.2.5.2 分子系统发育树的构建第42-43页
            2.2.5.3 蘑菇属非正式分类单位的解释第43页
        2.2.6 蘑菇属土壤养分特征分析第43页
            2.2.6.1 土壤样品采集和测定第43页
            2.2.6.2 土壤养分及理化数据分析第43页
3 结果与分析第43-103页
    3.1 中国西南地区蘑菇属分子系统学第43-51页
        3.1.1 Arvenses组分子系统学第48页
        3.1.2 Xanthodermatei组分子系统学第48页
        3.1.3 Spissicaules组分子系统学第48-49页
        3.1.4 Minores组分子系统学第49页
        3.1.5 Sanguinolenti组分子系统学第49页
        3.1.6 Chitonioides组与Bivelares组分子系统学第49页
        3.1.7 Agaricus组分子系统学第49-50页
        3.1.8 TRB组分子系统学第50页
        3.1.9 TRc组分子系统学第50页
        3.1.10 其他组的分子系统学第50页
        3.1.11 组间ITS分子系统学第50-51页
            3.1.11.1 Chitonioides、Bivelare、Xanthodermatei组的关系第50页
            3.1.11.2 Agaricus组的分子系统地位第50页
            3.1.11.3 Spissicaules组的分子系统地位第50-51页
            3.1.11.4 Arvenses组及TRc、TRb、TR I的分子系统地位第51页
    3.2 蘑菇属真菌表型特征第51页
    3.3 蘑菇属表型与分子分子系统分支的关系第51-58页
        3.3.1. 菌肉伤变特征与分子系统分支的相关性第51-52页
        3.3.2 Schaffe和KOH化学反应与分子系统分支的相关性第52页
        3.3.3 伤变气味与分子系统分支的相关性第52页
        3.3.4 菌环及下表面特征与分子系统分支的相关性第52-57页
        3.3.5 子实体菌柄基部形态特征与系统学分支的相关性第57页
        3.3.6 子实体菌盖颜色、孢子形状和囊状体形状特征与系统学分支的相关性第57页
        3.3.7 几个新类群形态特征与ITS分子亲缘关系的相关性第57页
        3.3.8 蘑菇属分子系统学与表型的统一第57-58页
        3.3.9 蘑菇属表型分类特征第58页
    3.4 蘑菇属Arvenses组系统学研究第58-82页
        3.4.1 蘑菇属Arvenses组分子系统学第59-61页
        3.4.2 蘑菇属Arvenses组的生态特征第61页
        3.4.3 蘑菇属Arvenses组的表型特点第61页
        3.4.4 蘑菇属Arvenses三个新种描述第61-76页
            3.4.4.1 贵州蘑菇Agaricus guizhouensis第61-66页
            3.4.4.2 长柄蘑菇Agaricus longistipes第66-71页
            3.4.4.3 大蘑菇Agaricus megalocarpus第71-75页
            3.4.4.4 Agaricus sp.1和Agaricus sp.2第75-76页
        3.4.5 蘑菇属Arvenses组贵州三个新记录种第76-82页
            3.4.5.1 Agaricus abruptibulbus第76-78页
            3.4.5.2 Agaricus flocculosipes第78-79页
            3.4.5.3 Agaricus subrufescens第79-82页
    3.5 蘑菇属其他组的新种描述第82-96页
        3.5.1 A.sp8第82-83页
        3.5.2 A.sp10第83-85页
        3.5.3 A.spll第85-87页
        3.5.4 A.sp12第87-89页
        3.5.5 A.sp16第89-91页
        3.5.6 A.sp18第91-92页
        3.5.7 A.sp20第92-94页
        3.5.8 A.sp21第94-96页
    3.6 中国西南地区蘑菇属土壤养分特性研究第96-103页
        3.6.1 贵州蘑菇属生长土壤养分特征和生境分级结果第96-98页
        3.6.2 贵州蘑菇属土壤养分特性和生境关系第98-99页
        3.6.3 土壤养分对蘑菇属真菌分布的影响第99-101页
        3.6.4 某些已知种的生长环境中土壤养分特征第101-103页
4 讨论与结论第103-111页
    4.1 讨论第103-108页
        4.1.1 蘑菇属组间的的系统学地位第103-107页
            4.1.1.1 Xanthodermatei组的系统地位第103-104页
            4.1.1.2 Sanguinolenti组与Xanthodermatei组、Bivelare组、Chitonioides组的关系第104-105页
            4.1.1.3 Agaricus组系统地位第105页
            4.1.1.4 Arvenses组、TRIV、Minores组的关系第105-106页
            4.1.1.5 Spissicaules组系统地位第106页
            4.1.1.6 几个新类群的系统学地位第106-107页
        4.1.2 蘑菇属Arvenses组特性及应用第107页
            4.1.2.1 中国高原亚热带蘑菇属Arvenses组分布第107页
            4.1.2.2 菌盖白色基因型固定在分支C和D第107页
            4.1.2.3 营养和药用的价值的多样性第107页
        4.1.3 中国西南地区蘑菇属组成及多样性第107-108页
        4.1.4 蘑菇属真菌形态特征演化假设第108页
        4.1.5 关于蘑菇属真菌深入研究的设想第108页
        4.1.6 蘑菇属土壤养分特征及栽培上应用第108页
    4.2 结论第108-110页
        4.2.1 蘑菇属主要表型性状在ITS分子系统研究中得到认可第108-109页
        4.2.2 蘑菇属组间的亲缘关系第109页
        4.2.3 中国西南地区蘑菇属种类第109页
        4.2.4 中国西南地区蘑菇属Arvenses组多样性第109-110页
        4.2.5 中国西南地区蘑菇属地理分布及土壤特征第110页
    4.3 本论文的创新点第110-111页
参考文献第111-119页
附录第119-120页
    攻读博士期间发表与论文相关的论文第119页
    授权的专利第119-120页
致谢第120页

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