基于网络的复杂疾病的研究
| 论文创新点 | 第4-8页 |
| 摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-12页 |
| 1 引言 | 第13-23页 |
| 1.1 网络生物学 | 第13-15页 |
| 1.2 复杂疾病的动态网络生物标记物 | 第15-18页 |
| 1.3 疾病模块简介 | 第18-20页 |
| 1.4 本论文的主要研究工作及组织结构 | 第20-23页 |
| 1.4.1 本论文的主要研究工作 | 第20-21页 |
| 1.4.2 论文的结构 | 第21-23页 |
| 2 基于动态网络识别复杂疾病的动态网络生物标记物 | 第23-63页 |
| 2.1 复杂疾病数据处理与蛋白质选取 | 第25-26页 |
| 2.2 动态网络的构建 | 第26-40页 |
| 2.2.1 基于互信息构建精炼网络 | 第27-29页 |
| 2.2.2 网络优化与正则化参数的选取 | 第29-32页 |
| 2.2.3 网络的确定与评估 | 第32-40页 |
| 2.3 动态网络生物标记物的识别 | 第40-61页 |
| 2.3.1 保守模块及高影响力模块的识别 | 第41-47页 |
| 2.3.2 复合指标识别动态网络生物标记物 | 第47-49页 |
| 2.3.3 动态网络生物标记物的分析 | 第49-61页 |
| 2.4 本章小结 | 第61-63页 |
| 3 基于多层网络识别疾病相关的模块和生物组分 | 第63-81页 |
| 3.1 流感病毒多维数据的收集与整理 | 第65页 |
| 3.2 多层网络的构建 | 第65-72页 |
| 3.2.1 相互作用关系的挖掘与抽取 | 第66-68页 |
| 3.2.2 转录调控网络的优化 | 第68-70页 |
| 3.2.3 基因调控网络的推断 | 第70-71页 |
| 3.2.4 模型应用与网络评估 | 第71-72页 |
| 3.3 病毒复制相关模块和生物组分识别 | 第72-79页 |
| 3.3.1 病毒复制重要模块的探测 | 第73-75页 |
| 3.3.2 病毒复制关键生物组分的识别 | 第75-79页 |
| 3.4 本章小结 | 第79-81页 |
| 4 总结与展望 | 第81-85页 |
| 4.1 全文总结 | 第81-82页 |
| 4.2 进一步研究工作的展望 | 第82-85页 |
| 参考文献 | 第85-95页 |
| 攻博期间发表的科研成果目录 | 第95-97页 |
| 致谢 | 第97页 |
