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CTCF结合的顺式调控元件的鉴定和功能分析

致谢第1-7页
摘要第7-9页
Abstract第9-11页
专业词汇中英文对照表第11-15页
引言第15-17页
第1章 文献综述第17-33页
   ·染色质结构与基因表达调控第17-22页
     ·染色质的基本结构第17页
     ·DNase I敏感位点与染色质开放状态第17-18页
     ·组蛋白修饰第18-19页
     ·染色体内部的相互作用第19-20页
     ·染色体之间的相互作用第20-22页
   ·CTCF的功能基因组学研究第22-27页
     ·CTCF的结构及功能第22-23页
     ·CTCF锌指结构的研究第23-24页
     ·CTCF结合位点在全基因组中的分布第24-25页
     ·CTCF与染色质构象第25-26页
     ·CTCF与基因表达调控第26-27页
   ·基因组调控元件的功能及应用第27-33页
     ·绝缘子元件的结构与功能第27-28页
     ·增强子阻断的绝缘子元件调控基因表达的机制第28-29页
     ·真核生物中参与绝缘子元件功能的蛋白因子第29页
     ·绝缘子元件在人类基因治疗中的应用第29-30页
     ·沉默子的结构及功能分类第30-33页
第2章 材料和方法第33-51页
   ·实验材料第33-38页
     ·高通量数据第33页
     ·细胞系第33页
     ·质粒载体第33-34页
     ·实验试剂与仪器第34-38页
   ·实验方法第38-51页
     ·CTCF识别序列的鉴定第38页
     ·PCR扩增待测的绝缘子候选者第38-41页
     ·质粒载体构建第41-44页
     ·病毒载体构建及病毒滴度测定第44-45页
     ·LB培养基平板的准备第45页
     ·感受态细胞的制备(电转化型)第45-46页
     ·煮沸法提取质粒(批量提取质粒)第46页
     ·细胞培养第46-49页
     ·流式细胞仪计数分析与分选细胞第49页
     ·基因毒性检测第49-50页
     ·数据的统计分析第50-51页
第3章 结果与讨论第51-77页
   ·绝缘子元件的鉴定和功能分析第51-65页
     ·全基因组CTCF识别序列的挖掘和注释第51-54页
     ·具有增强子阻断活性的绝缘子元件的筛选第54-56页
     ·具有增强子阻断活性的绝缘子元件的功能鉴定第56-59页
     ·绝缘子元件能减弱由外源载体导致的基因毒性作用第59-61页
     ·全基因组中仅少数的CTCF结合序列为增强子阻断子元件第61页
     ·具有增强子阻断功能的绝缘子的染色体特征第61-62页
     ·高CTCF结合率的DNA序列的功能分析第62-65页
   ·自发性沉默子T39的鉴定和功能分析第65-77页
     ·T39沉默子的发现第65-67页
     ·T39的染色体特征分析第67页
     ·T39与文献报道的沉默子的功能比较第67-69页
     ·T39的沉默子活性检测第69-77页
第4章 结论第77-79页
参考文献第79-95页
附录第95-109页
 附图第95-101页
 附表第101-109页
作者简介及在学期间发表的学术论文与研究成果第109-110页

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