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骨骼肌发育相关的猪新基因家族MuRFs的分子特征与功能初步研究

中文摘要第1-11页
ABSTRACT第11-13页
缩略词表(ABBREVIATIONS)第13-14页
1 文献综述第14-32页
   ·骨骼肌生长发育的基本过程第14-15页
   ·参与骨骼肌生长发育的一些调控因子第15-18页
     ·生肌调节因子第15-17页
     ·肌细胞增强因子第17-18页
   ·骨骼肌中蛋白质合成和分解途径第18-22页
     ·泛素-蛋白酶体通路及肌肉特异性泛素连接酶第19页
     ·IGF1/P13K/Akt通路第19-20页
     ·NF-κB第20-21页
     ·Myostatin第21页
     ·其它参与骨骼肌萎缩的信号通路及调控因子第21-22页
   ·MuRF基因家族的研究进展及存在问题第22-26页
   ·microRNA与肌肉生长发育第26-29页
   ·真核生物启动子的研究方法第29-32页
2. 研究目的与意义第32-33页
3. 材料与方法第33-52页
   ·材料第33-37页
     ·试验样品第33-34页
       ·基因克隆以及基因多态检测的样品第33页
       ·猪基因性状关联分析的DNA样品第33页
       ·用于基因染色体定位的DNA样品第33页
       ·基因表达差异研究的组织样品第33-34页
     ·载体、菌株和细胞第34-35页
       ·试验用载体第34-35页
       ·试验用菌株第35页
       ·试验用细胞系第35页
     ·试验用试剂及配制第35-37页
       ·主要试剂第35-36页
       ·其他试剂及培养基的配制第36-37页
     ·主要仪器设备第37页
     ·主要分子生物学及统计软件第37页
     ·主要数据库及在线分析软件第37页
   ·方法第37-52页
     ·基因的的分离第37-39页
       ·基因cDNA的克隆第37-38页
       ·序列的同源性分析与鉴定第38页
       ·引物设计第38页
       ·PCR扩增条件第38-39页
     ·PCR产物的纯化、克隆与测序第39-42页
     ·IMpRH辐射杂种板定位第42页
       ·定位引物设计第42页
       ·定位引物扩增及其分型方法与数据分析第42页
     ·MuRFs基因的mRNA表达分析第42-44页
       ·组织和细胞中总RNA提取第42-43页
       ·总RNA的反转录第43页
       ·扩增反应条件第43-44页
       ·数据分析第44页
     ·猪MuRF1和MuRF2基因的SNP检测与性状关联分析第44页
       ·PCR扩增反应第44页
       ·酶切条件第44页
       ·基因分型第44页
       ·数据统计分析第44页
     ·MuRF1及MuRF2基因5’UTR片段的克隆、结构分析及双荧光素酶报告基因载体的构建第44-47页
       ·MuRF1及MuRF2基因启动子片段的克隆第44-45页
       ·启动了的转录因子结合位点预测第45页
       ·启动子荧光素酶报告基因表达载体的构建第45-47页
     ·小鼠FoxO1和FoxO3a基因真核表达载体的构建第47-48页
     ·小鼠MuRF1基因3’UTR克隆、潜在microRNA位点预测及荧光素酶报告基因表达载体的构建第48-49页
       ·小鼠MuRF1基因3’UTR潜在microRNA位点预测第48页
       ·microRNA靶位点验证用荧光素酶报告基因表达载体的构建第48-49页
     ·细胞培养和转染第49-52页
       ·哺乳动物细胞培养及质粒转染第49-50页
       ·质粒转染第50页
       ·双荧光素酶活性测定第50页
       ·Western Blot用蛋白样品制备第50-52页
4. 结果第52-76页
   ·基因片段的分离、鉴定和序列分析第52-57页
     ·猪MuRFs家族基因的克隆第52页
     ·猪MuRFs家族基因的序列分析结果第52-56页
       ·MuRF1基因的序列分析第52-53页
       ·MuRF2基因的序列分析第53-55页
       ·MuRF3基因的序列分析第55-56页
     ·三个基因的氨基酸序列比对结果第56-57页
   ·猪MuRF1基因的染色体定位第57-59页
   ·猪MuRFs基因家族的时空表达检测第59-62页
     ·总RNA的提取和检测结果第59页
     ·猪MuRFs基因的组织表达第59-60页
     ·猪MuRF1和MuRF2在长白猪胚胎不同时期肌肉中的表达第60-62页
   ·猪MuRF1和MuRF2基因SNP检测及性状关联分析第62-65页
     ·MuRF1基因的SNP检测与性状关联分析第62-63页
       ·MuRF1基因的SNP检测第62-63页
       ·MuRF1基因多态与性状关联第63页
     ·MuRF2基因的SNP检测与性状关联分析第63-65页
       ·MuRF2基因的SNP检测第63-64页
       ·MuRF2基因多态与性状关联第64-65页
   ·MuRF1及MuRF2基因启动子片段删减及潜在转录位点分析第65-69页
     ·猪MuRF1基因启动子区的克隆第65-66页
     ·猪MuRF1基因启动子区转录因子结合位点预测第66页
     ·MuRF2基因启动子区的克隆第66-67页
     ·MuRF2基因启动子区转录因子结合位点预测第67-68页
     ·删减启动子序列双荧光素酶报告系统检测第68-69页
   ·Foxo1及Foxo3a超表达后MuRF1基因的表达检测第69-71页
   ·作用于MuRF1基因的microRNA预测及验证第71-76页
     ·microRNA的预测及小鼠MuRF1 3'UTR的克隆第71-72页
     ·双荧光素酶酶报告系统验证预测结果第72-73页
     ·Western blot验证预测结果第73-74页
     ·肌萎缩状态下miR-29表达分析第74-76页
5 讨论第76-85页
   ·关于利用EST和基因组数据库克隆基因第76-77页
   ·关于猪MuRFs基因家族的结构及功能预测第77-78页
   ·关于猪MuRF1基因的染色体定位第78页
   ·关于猪MuRF1s基因家族的时空表达分析第78-80页
   ·关于基因的SNP及性状关联分析第80-81页
     ·关于SNP检测与分析第80页
     ·猪MuRF1和MuRF2基因SNP与生产性状的关联第80-81页
   ·关于MuRF1和MuRF2基因的启动子分析第81-82页
   ·关于肌细胞正常分化状态下Foxo1和Foxo3a与MuRF1基因的关系第82-83页
   ·关于microRNA靶基因的预测及验证第83-85页
6 小结第85-87页
   ·主要研究结果第85页
   ·本研究的创新点与特色第85-86页
   ·本研究不足之处及值得进一步研究的问题第86-87页
参考文献第87-101页
在读期间发表的论文第101-102页
致谢第102-103页

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